Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

Predictions only

Length 4,074 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 BNIP3P10-201ENST00000605360 577 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
PKHD1P08F94 RNU1-30P-201ENST00000606575 163 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
PKHD1P08F94 VEPH1-203ENST00000392833 3979 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
PKHD1P08F94 LINC01189-201ENST00000428440 3321 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
PKHD1P08F94 AC023632.6-201ENST00000624338 2177 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
PKHD1P08F94 MAP2-207ENST00000447185 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
PKHD1P08F94 HIVEP2-202ENST00000367603 9724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
PKHD1P08F94 NDUFS1-201ENST00000233190 11819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
PKHD1P08F94 C5orf51-201ENST00000381647 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
PKHD1P08F94 AL359922.3-201ENST00000624779 1670 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
PKHD1P08F94 AC004690.2-201ENST00000472838 1754 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
PKHD1P08F94 TEX41-206ENST00000432608 661 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
PKHD1P08F94 AC018731.1-201ENST00000447078 576 ntTSL 4 BASIC2.64□□□□□ -1.99
PKHD1P08F94 BTF3P6-201ENST00000448054 499 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
PKHD1P08F94 RPS26P28-201ENST00000470806 348 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
PKHD1P08F94 LINC01570-201ENST00000561572 434 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
PKHD1P08F94 AC097467.3-208ENST00000593486 670 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
PKHD1P08F94 IL1R1-204ENST00000409929 1858 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
PKHD1P08F94 CCDC162P-202ENST00000368966 6751 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
PKHD1P08F94 MYO3B-202ENST00000408978 5529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
PKHD1P08F94 RHOT1-204ENST00000394692 2960 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
PKHD1P08F94 NXPE4-202ENST00000424261 1687 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
PKHD1P08F94 CPD-202ENST00000543464 4007 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
PKHD1P08F94 SCN8A-203ENST00000545061 11433 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
PKHD1P08F94 AL031429.1-201ENST00000426775 749 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
PKHD1P08F94 LINC00458-202ENST00000427299 1030 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
PKHD1P08F94 OR5K2-201ENST00000427338 1060 ntAPPRIS P1 BASIC2.64□□□□□ -1.99
PKHD1P08F94 NUDT7-202ENST00000437314 930 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
PKHD1P08F94 AC010235.1-201ENST00000450613 547 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
PKHD1P08F94 RPS11P1-201ENST00000451072 473 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
PKHD1P08F94 AL163973.3-201ENST00000547093 430 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
PKHD1P08F94 AC135178.3-202ENST00000580537 579 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
PKHD1P08F94 AC087749.1-202ENST00000585020 566 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
PKHD1P08F94 AL645927.2-201ENST00000618350 349 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
PKHD1P08F94 SCARNA15.3-201ENST00000626315 122 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
PKHD1P08F94 SCARNA4.1-201ENST00000628597 123 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
PKHD1P08F94 RNF19A-205ENST00000519449 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
PKHD1P08F94 NHS-202ENST00000398097 8213 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
PKHD1P08F94 CCDC80-201ENST00000206423 12430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
PKHD1P08F94 ERBB4-202ENST00000342788 12136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
PKHD1P08F94 TM4SF18-201ENST00000296059 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
PKHD1P08F94 ZNF43-205ENST00000594012 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
PKHD1P08F94 INTU-201ENST00000335251 13233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
PKHD1P08F94 RAD51AP1-202ENST00000352618 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
PKHD1P08F94 FTO-206ENST00000471389 11766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
PKHD1P08F94 FAM133A-201ENST00000322139 3292 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.63□□□□□ -1.99
PKHD1P08F94 UBE4A-201ENST00000252108 6103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
PKHD1P08F94 MTND4LP20-201ENST00000402379 270 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
PKHD1P08F94 AC078828.1-201ENST00000471993 458 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
PKHD1P08F94 AC080162.1-201ENST00000480764 491 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
PKHD1P08F94 AC020703.1-201ENST00000505051 521 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
PKHD1P08F94 HDAC2-AS2-209ENST00000519270 1244 ntTSL 4 BASIC2.63□□□□□ -1.99
PKHD1P08F94 LINC02386-202ENST00000551287 564 ntTSL 4 BASIC2.63□□□□□ -1.99
PKHD1P08F94 AC002094.2-201ENST00000577850 1121 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
PKHD1P08F94 MIR3945-201ENST00000581853 98 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
PKHD1P08F94 MARCH6-201ENST00000274140 9569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
PKHD1P08F94 CLUL1-208ENST00000581619 2449 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
PKHD1P08F94 PCDH15-230ENST00000617051 7048 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
PKHD1P08F94 COLCA1-205ENST00000620864 8098 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
PKHD1P08F94 SRGAP2-203ENST00000573034 6301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
PKHD1P08F94 NUP107-201ENST00000229179 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
PKHD1P08F94 KCNJ15-201ENST00000328656 8399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
PKHD1P08F94 ZNF480-205ENST00000595962 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
PKHD1P08F94 GPAM-201ENST00000348367 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
PKHD1P08F94 AC079809.1-201ENST00000415468 276 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
PKHD1P08F94 RPL12P46-201ENST00000436610 195 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
PKHD1P08F94 LINC01965-204ENST00000545549 575 ntTSL 4 BASIC2.63□□□□□ -1.99
PKHD1P08F94 DLG2-207ENST00000398309 7890 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
PKHD1P08F94 MBNL3-206ENST00000394311 11263 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
PKHD1P08F94 FSBP-203ENST00000611249 2181 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
PKHD1P08F94 BMPR1A-201ENST00000372037 11255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
PKHD1P08F94 RYR3-208ENST00000622037 15564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
PKHD1P08F94 DUSP19-202ENST00000354221 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
PKHD1P08F94 AC007463.1-201ENST00000416534 734 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
PKHD1P08F94 EIF4HP2-201ENST00000424380 563 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
PKHD1P08F94 AP001432.1-201ENST00000440629 520 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
PKHD1P08F94 SERPINA7P1-201ENST00000443077 631 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
PKHD1P08F94 AC090686.1-201ENST00000481577 749 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
PKHD1P08F94 AC108067.1-201ENST00000514304 215 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
PKHD1P08F94 EIF4BP1-201ENST00000554881 351 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
PKHD1P08F94 AC079684.1-201ENST00000621405 437 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
PKHD1P08F94 AP000542.2-201ENST00000623199 6179 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
PKHD1P08F94 PLEKHG7-201ENST00000344636 3868 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
PKHD1P08F94 NUP93-202ENST00000542526 8257 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
PKHD1P08F94 ALB-201ENST00000295897 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
PKHD1P08F94 ALPK2-201ENST00000361673 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
PKHD1P08F94 NACA-203ENST00000454682 6629 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
PKHD1P08F94 AL034370.1-201ENST00000397254 1590 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
PKHD1P08F94 WDR7-213ENST00000615645 5257 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
PKHD1P08F94 HOOK3-201ENST00000307602 14398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
PKHD1P08F94 OR7D4-203ENST00000641669 4965 ntAPPRIS P1 BASIC2.63□□□□□ -1.99
PKHD1P08F94 EMSY-205ENST00000524767 4116 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
PKHD1P08F94 EEF1A1-211ENST00000615060 3508 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
PKHD1P08F94 AL360270.1-201ENST00000440689 2359 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
PKHD1P08F94 ACEA_U3.1-201ENST00000363057 217 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
PKHD1P08F94 MIR128-1-201ENST00000384921 82 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
PKHD1P08F94 RPL7P58-201ENST00000402913 758 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
PKHD1P08F94 RPL5P2-201ENST00000429598 854 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
PKHD1P08F94 AL157385.1-201ENST00000446973 268 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
PKHD1P08F94 AC012671.1-201ENST00000451912 203 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126.6 ms