Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 MTND5P13-201ENST00000513046 1079 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 LNX1-AS1-204ENST00000514364 495 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 MTCO2P32-201ENST00000514865 403 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01339-203ENST00000519336 561 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 AC025370.1-201ENST00000523775 583 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 AC009509.1-201ENST00000536317 1110 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 AC084291.1-201ENST00000544667 548 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 AC125612.1-201ENST00000547580 377 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 AC126615.2-201ENST00000553003 515 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 SMARCE1P3-201ENST00000553649 1231 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 FRMD6-AS2-202ENST00000557625 581 ntTSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 AC015720.2-201ENST00000567709 334 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 AC018558.3-201ENST00000567902 572 ntTSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 AL163952.1-202ENST00000569625 600 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 AC090621.1-201ENST00000592121 419 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 AL590229.1-201ENST00000603497 542 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 AP000255.1-201ENST00000610276 676 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00850-201ENST00000629221 685 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 AC025263.3-201ENST00000622965 1396 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 FOXP2-202ENST00000360232 1412 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 AL133268.1-201ENST00000405676 1401 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 CD164-207ENST00000504373 1402 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 SERPINA7-202ENST00000372563 1600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 AC011900.1-201ENST00000446838 2999 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 RRP15-201ENST00000366932 7771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 RABGAP1L-202ENST00000325589 1880 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF442-205ENST00000545749 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 ZMAT1-201ENST00000372782 3185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
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SH3BP1Q9Y3L3 CDH17-201ENST00000027335 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 ANXA1-202ENST00000376911 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02225-201ENST00000510444 4069 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 TESPA1-203ENST00000524622 4188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 PANK1-203ENST00000342512 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 CTAGE5-204ENST00000341749 2912 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF611-201ENST00000319783 3153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 RNA5SP319-201ENST00000362768 119 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
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SH3BP1Q9Y3L3 RPL34-203ENST00000394668 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
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SH3BP1Q9Y3L3 LINC01060-205ENST00000512839 716 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 RNA5SP303-201ENST00000516192 130 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
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SH3BP1Q9Y3L3 AC108471.2-203ENST00000532680 517 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
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SH3BP1Q9Y3L3 RAPGEF4-203ENST00000397087 4120 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
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SH3BP1Q9Y3L3 ZNF849P-201ENST00000594711 1566 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 CCT6B-203ENST00000436961 1639 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 BCORP1-203ENST00000513194 5093 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 KANSL1L-209ENST00000457374 2264 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 GALNT11-203ENST00000422997 2371 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 FASTKD3-201ENST00000264669 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 DMTF1-204ENST00000413276 3548 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 AC007390.2-201ENST00000606229 3803 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 MAPK10-304ENST00000641341 3984 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 CDK14-203ENST00000406263 5163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
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SH3BP1Q9Y3L3 TDRD5-202ENST00000367614 3632 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 OR9G1-202ENST00000642097 3611 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 BACH1-201ENST00000286800 5669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 DCDC1-207ENST00000452803 1706 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 UGT2A2-202ENST00000604629 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 AP001029.2-203ENST00000589795 4910 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 SERPINA9-204ENST00000424550 1462 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
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