Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 AC244505.3-201ENST00000454598 187 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
USP35Q9P2H5 RPS4XP12-201ENST00000461747 709 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
USP35Q9P2H5 AC069304.1-201ENST00000491593 704 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
USP35Q9P2H5 AC098799.3-201ENST00000506095 438 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
USP35Q9P2H5 LINC02231-201ENST00000510459 447 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
USP35Q9P2H5 RNU6-513P-201ENST00000516104 104 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
USP35Q9P2H5 E2F5-204ENST00000517476 1094 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
USP35Q9P2H5 AC023796.1-201ENST00000536131 670 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
USP35Q9P2H5 AC024940.3-201ENST00000538551 316 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
USP35Q9P2H5 ZNF84-212ENST00000542874 540 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
USP35Q9P2H5 AC025263.2-201ENST00000550437 548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
USP35Q9P2H5 DTNA-232ENST00000599844 853 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
USP35Q9P2H5 GPR87-201ENST00000260843 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
USP35Q9P2H5 CXCL11-201ENST00000306621 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
USP35Q9P2H5 FOXN2-201ENST00000340553 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
USP35Q9P2H5 IRF5P1-201ENST00000504852 2164 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
USP35Q9P2H5 TNRC6B-206ENST00000454349 18279 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
USP35Q9P2H5 ZNF630-207ENST00000616492 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
USP35Q9P2H5 EIF3H-209ENST00000521861 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
USP35Q9P2H5 ADH4-207ENST00000505590 1400 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
USP35Q9P2H5 AC007681.1-201ENST00000604271 3438 ntTSL 4 BASIC7.21□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 DGKB-201ENST00000399322 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 CFHR3-201ENST00000367425 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 PSMA8-205ENST00000612461 1619 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 RNU1-32P-201ENST00000363937 159 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 IL6-203ENST00000401651 539 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 NCSTNP1-201ENST00000406229 144 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 RNU6-77P-201ENST00000410554 91 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 TAF13P2-201ENST00000416876 286 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 RPL7P56-201ENST00000429441 717 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 AC016712.1-201ENST00000431088 378 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 AC011753.3-201ENST00000443436 406 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 AC005002.1-201ENST00000447458 540 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
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USP35Q9P2H5 AL356270.1-201ENST00000456587 522 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
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USP35Q9P2H5 AC005674.1-201ENST00000503493 459 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 AC097515.1-201ENST00000512370 435 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 OR7H2P-201ENST00000513483 306 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 TBCA-203ENST00000517679 545 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 AC078899.1-201ENST00000521432 1185 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 ATPAF1-210ENST00000532925 998 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
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USP35Q9P2H5 LINC02404-201ENST00000546710 1188 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
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USP35Q9P2H5 AC011473.2-201ENST00000596286 240 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
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USP35Q9P2H5 C2CD6-202ENST00000439140 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 ACE2-201ENST00000252519 3393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
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USP35Q9P2H5 TRPM3-209ENST00000377110 12258 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
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USP35Q9P2H5 AC138969.1-213ENST00000331436 462 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 SNORA51.12-201ENST00000384448 134 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 RNA5SP91-201ENST00000390902 119 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 RPL31-205ENST00000409320 716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
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USP35Q9P2H5 AL391069.1-201ENST00000422153 358 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 AC007161.1-204ENST00000423039 460 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 AL133268.3-201ENST00000428903 577 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 TNKS2-AS1-201ENST00000432246 609 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 ACTR3P2-201ENST00000439585 1257 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 DARS-AS1-206ENST00000446492 488 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 AC023424.1-201ENST00000496058 459 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 AC091860.1-201ENST00000505723 432 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 LINC02479-201ENST00000508942 630 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 AC026719.2-201ENST00000515656 295 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 HMGB1P23-201ENST00000518743 568 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 YWHABP2-201ENST00000540201 713 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 AAGAB-203ENST00000542650 1015 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 AC104938.1-202ENST00000563041 630 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 FOPNL-208ENST00000575744 565 ntTSL 4 BASIC7.2□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 LINC00511-212ENST00000581183 657 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 AC011447.4-201ENST00000587562 111 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 AL133481.2-203ENST00000607558 139 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 CR392039.4-201ENST00000624968 501 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 MIR325HG-202ENST00000626832 598 ntTSL 4 BASIC7.2□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 MYOCOS-202ENST00000636788 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 SYNJ2BP-201ENST00000256366 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
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