Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 AC004923.2-201ENST00000529649 369 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
GTF3C6Q969F1 OSBPL9P3-201ENST00000534523 595 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
GTF3C6Q969F1 AC091814.1-201ENST00000545258 719 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
GTF3C6Q969F1 AL110118.1-201ENST00000553543 400 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
GTF3C6Q969F1 AC104002.2-201ENST00000553919 318 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
GTF3C6Q969F1 AC002091.1-201ENST00000578788 557 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
GTF3C6Q969F1 AC068020.1-201ENST00000594215 661 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
GTF3C6Q969F1 MIR99AHG-211ENST00000602323 475 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
GTF3C6Q969F1 MIR7155-201ENST00000615925 56 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
GTF3C6Q969F1 AC090510.2-201ENST00000617465 629 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
GTF3C6Q969F1 SATB1-AS1-237ENST00000626982 735 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
GTF3C6Q969F1 AL596275.2-204ENST00000641628 552 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
GTF3C6Q969F1 AL596275.2-206ENST00000641957 626 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
GTF3C6Q969F1 PRG4-202ENST00000367483 4921 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
GTF3C6Q969F1 AC073429.2-201ENST00000569694 1444 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
GTF3C6Q969F1 AP000542.2-201ENST00000623199 6179 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
GTF3C6Q969F1 ARHGEF12-202ENST00000397843 9660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
GTF3C6Q969F1 LYST-202ENST00000389794 12985 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
GTF3C6Q969F1 VNN2-201ENST00000326499 2118 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
GTF3C6Q969F1 PANK1-203ENST00000342512 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
GTF3C6Q969F1 MGST1-201ENST00000010404 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
GTF3C6Q969F1 MT-TP-201ENST00000387461 68 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
GTF3C6Q969F1 MGST1-203ENST00000396207 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
GTF3C6Q969F1 AC006369.1-201ENST00000419425 548 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
GTF3C6Q969F1 AL138789.1-201ENST00000425820 960 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
GTF3C6Q969F1 HMGB3P10-201ENST00000434734 572 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
GTF3C6Q969F1 AP001596.1-202ENST00000452460 644 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
GTF3C6Q969F1 AL035446.1-201ENST00000455011 453 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
GTF3C6Q969F1 LINC01150-201ENST00000455671 315 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
GTF3C6Q969F1 EIF2S2P5-201ENST00000457635 968 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
GTF3C6Q969F1 AC022795.1-201ENST00000473808 480 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
GTF3C6Q969F1 CFLAR-225ENST00000494258 693 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
GTF3C6Q969F1 CASP12-210ENST00000494737 961 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
GTF3C6Q969F1 NDUFA5P12-201ENST00000503796 343 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
GTF3C6Q969F1 LINC01060-205ENST00000512839 716 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
GTF3C6Q969F1 RNA5SP446-201ENST00000515955 82 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
GTF3C6Q969F1 RNU2-30P-201ENST00000516209 141 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
GTF3C6Q969F1 AC019227.1-201ENST00000526902 510 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
GTF3C6Q969F1 AC113192.3-201ENST00000529152 742 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
GTF3C6Q969F1 MIR670HG-201ENST00000533531 897 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
GTF3C6Q969F1 AC027544.2-201ENST00000539313 630 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
GTF3C6Q969F1 AC087888.1-201ENST00000550884 1254 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
GTF3C6Q969F1 LINC02313-201ENST00000553330 550 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
GTF3C6Q969F1 AL136298.1-201ENST00000557371 566 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
GTF3C6Q969F1 AC021483.2-201ENST00000567415 758 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
GTF3C6Q969F1 MIR3667-201ENST00000581025 74 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
GTF3C6Q969F1 AC015911.5-201ENST00000587076 451 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
GTF3C6Q969F1 AC011524.2-201ENST00000589198 399 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
GTF3C6Q969F1 AC021517.1-203ENST00000590257 421 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
GTF3C6Q969F1 ZNF682-204ENST00000593468 581 ntTSL 4 BASIC5.44□□□□□ -1.54
GTF3C6Q969F1 AL391422.2-201ENST00000602854 361 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
GTF3C6Q969F1 AL512782.1-201ENST00000603093 364 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
GTF3C6Q969F1 AC087283.1-201ENST00000604029 1074 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
GTF3C6Q969F1 AL031320.1-201ENST00000604177 357 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
GTF3C6Q969F1 AC120053.1-201ENST00000607706 736 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
GTF3C6Q969F1 AC004948.1-201ENST00000609858 672 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
GTF3C6Q969F1 AC140113.4-201ENST00000622087 222 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
GTF3C6Q969F1 AC090617.9-201ENST00000623751 147 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
GTF3C6Q969F1 PCDH11X-207ENST00000406881 4156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
GTF3C6Q969F1 CARF-203ENST00000414439 2099 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
GTF3C6Q969F1 ARPP21-202ENST00000396481 1304 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
GTF3C6Q969F1 TES-202ENST00000393481 2763 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
GTF3C6Q969F1 ZKSCAN8-201ENST00000330236 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
GTF3C6Q969F1 C15orf41-212ENST00000567389 2618 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
GTF3C6Q969F1 LINC00550-201ENST00000629293 3434 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
GTF3C6Q969F1 PPP1R9A-207ENST00000433881 9928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
GTF3C6Q969F1 MACF1-203ENST00000361689 17538 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
GTF3C6Q969F1 ENPP3-201ENST00000357639 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
GTF3C6Q969F1 AC000123.3-201ENST00000624029 4975 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
GTF3C6Q969F1 EEF1A1-211ENST00000615060 3508 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
GTF3C6Q969F1 DNAJC9-AS1-204ENST00000440197 2865 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
GTF3C6Q969F1 HMCN1-201ENST00000271588 18208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
GTF3C6Q969F1 FGD4-210ENST00000525053 2925 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
GTF3C6Q969F1 AL359715.4-201ENST00000606629 1436 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
GTF3C6Q969F1 RAD1P1-201ENST00000231383 813 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
GTF3C6Q969F1 C10orf120-201ENST00000329446 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
GTF3C6Q969F1 RNU6-792P-201ENST00000363490 107 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
GTF3C6Q969F1 OR51F1-201ENST00000380383 960 ntAPPRIS P5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
GTF3C6Q969F1 MIR137-201ENST00000385223 102 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
GTF3C6Q969F1 TRAV23DV6-201ENST00000390451 409 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
GTF3C6Q969F1 AC098820.3-201ENST00000414135 976 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
GTF3C6Q969F1 BX510359.2-201ENST00000417920 305 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
GTF3C6Q969F1 AC140479.3-201ENST00000418944 1126 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
GTF3C6Q969F1 LINC01945-201ENST00000419784 840 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
GTF3C6Q969F1 AC006055.1-201ENST00000432423 411 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
GTF3C6Q969F1 AC012442.1-201ENST00000436885 529 ntTSL 4 BASIC5.43□□□□□ -1.54
GTF3C6Q969F1 AC005154.2-201ENST00000438110 379 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
GTF3C6Q969F1 ZNF736P11Y-201ENST00000442535 1213 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
GTF3C6Q969F1 ZNF736P12Y-201ENST00000443152 1243 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
GTF3C6Q969F1 DARS-AS1-206ENST00000446492 488 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
GTF3C6Q969F1 RPL31P44-201ENST00000447680 377 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
GTF3C6Q969F1 AL512380.1-202ENST00000447728 543 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
GTF3C6Q969F1 CALM1P2-201ENST00000452941 448 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
GTF3C6Q969F1 ZNF736P4Y-201ENST00000454995 1243 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
GTF3C6Q969F1 HNRNPDLP3-201ENST00000456745 380 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
GTF3C6Q969F1 NPM1P17-201ENST00000479221 602 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
GTF3C6Q969F1 LINC01995-201ENST00000489016 621 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
GTF3C6Q969F1 PTPN20-213ENST00000502705 854 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
GTF3C6Q969F1 LINC02270-201ENST00000505386 610 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
GTF3C6Q969F1 AC011389.1-201ENST00000509170 594 ntTSL 4 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.5 ms