Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 RN7SL329P-201ENST00000467740 299 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 CDV3-208ENST00000511392 554 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 RNA5SP154-201ENST00000516193 111 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 DISC1FP1-203ENST00000562678 796 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 AC009039.1-201ENST00000568711 471 ntTSL 4 BASIC4.29□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 OR1F2P-201ENST00000570470 933 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 AC211433.2-201ENST00000608433 387 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 AC020634.1-201ENST00000608701 549 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 NAA60-237ENST00000615865 326 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 AL445528.2-201ENST00000620582 470 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 ZNF560-201ENST00000301480 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 USH2A-202ENST00000366942 6320 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 ENOX2-202ENST00000370927 3788 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 SLC17A3-204ENST00000397060 2052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 ZNF415-201ENST00000243643 2270 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 LINC00862-201ENST00000367355 1417 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 DNAH8-202ENST00000359357 13864 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 AC125257.1-201ENST00000560400 2930 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 RNF145-201ENST00000274542 3364 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 PCDH15-234ENST00000622048 6820 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 FAM111A-201ENST00000361723 3592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 ELAVL4-206ENST00000371827 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 LINC01733-201ENST00000449316 4604 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 PTPN22-201ENST00000359785 3654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 RNU1-15P-201ENST00000353977 144 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 AC093719.1-202ENST00000392735 373 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 VN1R8P-201ENST00000407739 893 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 LINC00867-202ENST00000415417 488 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 VN1R31P-201ENST00000417498 730 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 AC138024.1-201ENST00000420867 699 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 AL139240.1-201ENST00000422963 505 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 NPM1P26-201ENST00000426339 738 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 DYNLL1P7-201ENST00000429273 258 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 TMEM196-204ENST00000433641 768 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 ITGA9-AS1-207ENST00000445429 532 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 ATXN3-206ENST00000502250 1259 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 STPG2-AS1-201ENST00000508933 537 ntTSL 4 BASIC4.28□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 OSBPL9P2-201ENST00000526582 1228 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 KIRREL3-AS2-201ENST00000532988 492 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 AC079866.2-201ENST00000541870 515 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 AP005119.2-201ENST00000579735 1105 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 AL133243.1-201ENST00000614487 366 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 AC243585.1-201ENST00000617867 607 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 AC006065.6-201ENST00000625201 545 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 CHRM3-AS2-209ENST00000628573 766 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 OR2L1P-202ENST00000641567 1023 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 LINC02432-202ENST00000509161 2839 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 TUG1-201ENST00000519077 5673 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 MECOM-219ENST00000628990 4835 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
IMPG1Q17R60 MNS1-201ENST00000260453 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 MEI4-201ENST00000602452 4800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 PCDH15-218ENST00000437009 6804 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 HSPD1P11-201ENST00000508643 1702 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 RPAP2-203ENST00000610020 16993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 AC004057.1-202ENST00000356247 284 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 OR6C1-201ENST00000379668 1064 ntAPPRIS P1 BASIC4.27□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 RNU6ATAC5P-201ENST00000388104 126 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 ATP5F1P2-201ENST00000398143 760 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 SNORA74C-2-201ENST00000411179 201 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 ARAFP1-201ENST00000422172 605 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 MTCO1P51-201ENST00000427672 1060 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 SKP1P3-201ENST00000429280 487 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 ITGA9-AS1-203ENST00000429532 702 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 AC005828.1-201ENST00000431604 524 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 YWHAZP2-201ENST00000440317 728 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 AC011753.3-201ENST00000443436 406 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 RPL23AP43-201ENST00000446445 471 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 AL355870.1-201ENST00000448272 454 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 AL162591.2-201ENST00000449634 317 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 EIF4A1P11-201ENST00000451239 222 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 RNU6ATAC28P-201ENST00000459249 118 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 RGS1-203ENST00000469578 1034 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 AC083982.1-201ENST00000485679 344 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 OR7H2P-201ENST00000513483 306 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 MYL12AP1-201ENST00000518490 515 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 LINC02390-201ENST00000541404 560 ntTSL 4 BASIC4.27□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 AC125612.1-201ENST00000547580 377 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 MIR4436B2-201ENST00000581415 91 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 MIR4436B1-201ENST00000583272 91 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 AC005899.1-201ENST00000584125 563 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 AP005121.1-202ENST00000584414 555 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 AC004241.3-201ENST00000611728 517 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 WDR75-207ENST00000631047 270 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 OR52N4-202ENST00000641350 1276 ntAPPRIS P1 BASIC4.27□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 PPP1R9A-208ENST00000456331 10090 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 AC096751.1-201ENST00000515178 2202 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 STEAP2-203ENST00000394622 6612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 AC089984.1-201ENST00000552780 1431 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 RBBP6-203ENST00000381039 3384 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 ATG12-208ENST00000509910 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 FAM35A-201ENST00000298784 3402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 KMO-204ENST00000366559 5261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 ADAMTS9-AS1-203ENST00000471990 1606 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 PLET1-201ENST00000338832 1215 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 MIR513A2-201ENST00000385249 127 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 RNA5SP397-201ENST00000391323 118 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 RPS23P10-201ENST00000416185 486 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 ARPP21-211ENST00000427542 568 ntTSL 4 BASIC4.26□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 AL353597.2-202ENST00000434901 373 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 FHP1-201ENST00000442741 703 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.5 ms