Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 AP001781.1-201ENST00000530977 207 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 G2E3-AS1-201ENST00000548631 579 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 AL355075.3-201ENST00000554678 492 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 AC090519.2-201ENST00000559034 655 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 AC021351.1-201ENST00000560886 652 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 AC002094.2-201ENST00000577850 1121 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 TTN-AS1-232ENST00000589487 1077 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 AL133338.2-201ENST00000604292 736 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 COX6CP4-201ENST00000605798 228 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 AC005021.1-201ENST00000608730 355 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 AL122125.1-201ENST00000616999 600 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 AC015871.5-202ENST00000623252 701 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 AC104820.1-201ENST00000624183 307 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 ELF1-204ENST00000625359 2032 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 OR51C1P-202ENST00000641159 1444 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 SLC4A10-206ENST00000446997 5551 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 ATRX-202ENST00000395603 10218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 ERGIC2-201ENST00000360150 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 GABRA1-220ENST00000638159 4088 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 MLIP-213ENST00000514921 5743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 HERC1-201ENST00000443617 15137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 SPATA2P1-201ENST00000431223 2055 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 RBMS1-202ENST00000392753 3781 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 ZC3H14-215ENST00000555900 1762 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 CYP3A43-204ENST00000354829 1709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 PCDH15-211ENST00000395440 3177 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 CP-201ENST00000264613 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 AL157756.1-201ENST00000532515 2859 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 SCGB2A2-202ENST00000525380 1305 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 PCDH15-206ENST00000373965 9237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 AC010300.1-201ENST00000600671 5134 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 SNORA71.2-201ENST00000364941 134 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 ATP6V1G3-203ENST00000367382 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 SNORA11-201ENST00000408789 128 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 AC079630.1-201ENST00000412812 585 ntTSL 4 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 AL158837.1-201ENST00000417644 452 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 AL645465.1-201ENST00000417765 642 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 AL391807.1-202ENST00000419979 534 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 EIF4A1P1-201ENST00000420241 934 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 AL133419.1-201ENST00000423153 640 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 Z74021.1-201ENST00000423610 407 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 AL445528.1-201ENST00000426330 420 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 YY1P1-201ENST00000427625 668 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 AC007563.3-201ENST00000433233 371 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 CASP12-204ENST00000433738 709 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 AL139002.1-201ENST00000435281 902 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 AC108751.2-201ENST00000469993 231 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 AL161747.1-201ENST00000480068 358 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 AC004069.1-201ENST00000504082 549 ntTSL 4 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 TMEM108-AS1-201ENST00000504993 705 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 AC139718.2-201ENST00000506068 481 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 BTG4P1-201ENST00000510421 183 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 AP002812.2-201ENST00000525594 585 ntTSL 4 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 PRB1-204ENST00000546254 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 AC025035.1-201ENST00000551571 894 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 KPNA2P3-201ENST00000584190 848 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 AC034236.3-201ENST00000605999 461 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 AC100847.1-201ENST00000611316 481 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 RUVBL2-213ENST00000639391 120 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 AL139254.3-201ENST00000641097 674 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 PIGN-242ENST00000640145 4505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 RAP1B-201ENST00000250559 13438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 LINC01189-201ENST00000428440 3321 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 MAP2-202ENST00000360351 9711 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 AL136164.3-201ENST00000624429 3978 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 NXT2-201ENST00000218004 2692 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 TMEM154-201ENST00000304385 10698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 FAM72A-201ENST00000341209 1774 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 NBPF14-206ENST00000614999 10080 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 TET2-203ENST00000380013 9679 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 CYP7A1-201ENST00000301645 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 LPAR4-205ENST00000614823 2155 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 VN2R3P-201ENST00000422626 1412 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 MFSD8-220ENST00000641243 1422 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 CROT-204ENST00000442291 1993 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 AL731566.1-201ENST00000620490 1937 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 DEFB128-201ENST00000334391 373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 RNA5SP151-201ENST00000365632 117 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 MIR421-201ENST00000365696 85 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 SDHCP2-201ENST00000398565 501 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 OR1F12-201ENST00000402365 945 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 Z98745.1-201ENST00000402553 494 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 AL589655.1-201ENST00000405398 482 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 SCP2-205ENST00000408941 1298 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 ACAP2-IT1-201ENST00000419899 690 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 RAD23BP1-201ENST00000421404 1227 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 AL157378.1-201ENST00000424506 265 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 AC234779.1-201ENST00000425910 285 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 AL606490.7-201ENST00000433136 191 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 AC022431.1-201ENST00000450941 438 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 AL450344.1-201ENST00000456018 639 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 CYCSP34-201ENST00000458172 304 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 AL591473.1-201ENST00000464297 313 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 RPL7AP10-201ENST00000481016 791 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 PLSCR5-202ENST00000482567 1018 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 LINC01192-207ENST00000492553 836 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 AC097103.1-201ENST00000512398 273 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 RNA5SP446-201ENST00000515955 82 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 AL355432.1-201ENST00000522960 564 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CDKN3Q16667 AC008641.1-201ENST00000523781 248 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
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