Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 AC106785.3-201ENST00000564064 847 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 AC009852.2-201ENST00000567898 485 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 HNRNPCP4-201ENST00000571636 900 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 EIF1P5-201ENST00000585002 234 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 NF1P5-201ENST00000588287 448 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 AC079880.2-201ENST00000603790 1213 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 AC133644.2-201ENST00000608142 540 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 AC138965.3-201ENST00000623875 498 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 AC087632.1-216ENST00000625619 487 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 BMS1P21-201ENST00000634565 365 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 IPO11-203ENST00000409534 1725 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 PSG1-204ENST00000436291 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 C6-202ENST00000337836 3551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 AC010300.1-201ENST00000600671 5134 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 AC068446.1-201ENST00000556425 1549 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 CXCL9-201ENST00000264888 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 OR6C3-202ENST00000641364 1341 ntAPPRIS P1 BASIC4.5□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 CDH17-201ENST00000027335 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 EIF2AK2-201ENST00000233057 10042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 LINC02476-201ENST00000426413 1577 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 KLHL13-201ENST00000262820 3972 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 OR10AG1-201ENST00000312345 1016 ntAPPRIS P1 BASIC4.5□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 CFAP126-201ENST00000367974 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 RNU6-98P-201ENST00000384173 107 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 MIR550A3-201ENST00000390735 95 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 CCL7-203ENST00000394630 687 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 ARSD-AS1-201ENST00000414053 816 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 AL357078.2-201ENST00000416486 427 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 AL121882.1-201ENST00000422893 417 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 AC092159.1-201ENST00000433724 493 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 LINC01967-202ENST00000437506 515 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 HMGB3P9-201ENST00000441799 583 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 AC073648.4-201ENST00000442655 781 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 AC064871.1-201ENST00000444562 427 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 Z73495.1-201ENST00000444982 147 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 TPTE2P6-202ENST00000445572 1007 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 CYCSP42-201ENST00000450823 238 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 AC096543.1-201ENST00000455038 823 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 AC007688.1-201ENST00000475592 759 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 AC112206.2-204ENST00000504068 793 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 RNA5SP43-201ENST00000516559 110 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 AP001636.3-202ENST00000525714 894 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 AP001922.4-201ENST00000526967 290 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 MS4A6A-210ENST00000529054 1160 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 GYPA-211ENST00000535709 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 PDCD5P1-201ENST00000543528 309 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 LINC02156-201ENST00000552320 483 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 AL355076.2-201ENST00000555736 544 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 LINS1-207ENST00000560133 1196 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 MIR3934-201ENST00000579806 107 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 AC010511.1-202ENST00000590229 573 ntTSL 4 BASIC4.5□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 AC008536.1-201ENST00000602872 669 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 AC005084.1-201ENST00000605160 304 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 AC006946.3-201ENST00000609791 756 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 RPS6KA5-207ENST00000614987 26795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 LINC02335-201ENST00000616578 659 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 AC015914.2-201ENST00000618167 288 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 AP003072.4-201ENST00000624580 310 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 AL358975.1-202ENST00000628133 589 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 PHACTR2P1-202ENST00000636592 773 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 INTS6P1-201ENST00000504674 2530 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 AC134882.1-201ENST00000603738 1676 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 OR4S2-202ENST00000641692 2211 ntAPPRIS P1 BASIC4.5□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 CFI-202ENST00000394635 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 BNIP3L-202ENST00000518611 1352 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 AC022031.1-201ENST00000585985 2593 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 EIF4E3-202ENST00000389826 6083 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 RIF1-203ENST00000428287 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 ADAM18-201ENST00000265707 2388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 GABRG2-203ENST00000414552 3927 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 PATJ-213ENST00000613764 4172 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 DNAH7-202ENST00000409063 1845 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 RC3H1-202ENST00000367694 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 CP-201ENST00000264613 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 AL133268.1-201ENST00000405676 1401 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 PDE7A-201ENST00000379419 2425 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 BX248415.1-201ENST00000367421 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 DEC1-201ENST00000374016 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 DEFB113-201ENST00000398718 249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 SETP15-201ENST00000412724 337 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 AC068483.1-201ENST00000413403 660 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 AC096669.1-202ENST00000413708 616 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 CHEK2P3-201ENST00000416118 248 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 IGKV1OR9-1-201ENST00000424370 284 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 AL138789.1-201ENST00000425820 960 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 DYNLL1P7-201ENST00000429273 258 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 AC112498.1-201ENST00000444401 332 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 LINC00412-201ENST00000444744 420 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 TRY2P-201ENST00000448860 689 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 LINC01767-201ENST00000451914 545 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 HMGB3P21-201ENST00000452483 547 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 AC026347.1-201ENST00000463255 474 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 AC069304.1-201ENST00000491593 704 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 MTND3P24-201ENST00000506306 329 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 ENPP7P9-201ENST00000514456 627 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 UBE2Q2P10-201ENST00000514854 900 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 HDAC2-AS2-207ENST00000518470 563 ntTSL 4 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 AC104350.1-201ENST00000518750 877 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 LINC00535-204ENST00000520513 305 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 AC131254.2-201ENST00000521908 550 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
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