Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 AL590762.2-201ENST00000395798 571 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
DDX39BQ13838 AL591848.1-201ENST00000413092 322 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
DDX39BQ13838 LINC00626-201ENST00000420691 955 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
DDX39BQ13838 AC004074.1-201ENST00000421810 1063 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
DDX39BQ13838 AL357315.1-201ENST00000422930 254 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
DDX39BQ13838 AC012519.1-201ENST00000424588 610 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
DDX39BQ13838 NDUFA5P10-201ENST00000432147 357 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
DDX39BQ13838 AC002378.1-201ENST00000432360 298 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
DDX39BQ13838 LINC00595-203ENST00000432742 683 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
DDX39BQ13838 TMEM196-204ENST00000433641 768 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
DDX39BQ13838 RPL7P61-201ENST00000451721 751 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
DDX39BQ13838 ATP5A1P7-201ENST00000453978 1279 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
DDX39BQ13838 RPL23AP12-201ENST00000467573 473 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
DDX39BQ13838 AC010683.1-201ENST00000473673 378 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
DDX39BQ13838 CFAP44-AS1-202ENST00000498480 686 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
DDX39BQ13838 AC091826.2-201ENST00000504034 412 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
DDX39BQ13838 LINC02430-201ENST00000504755 476 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
DDX39BQ13838 RNU6-1308P-201ENST00000516817 103 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
DDX39BQ13838 HIGD1AP18-201ENST00000520730 278 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
DDX39BQ13838 GABARAPL1-212ENST00000543602 653 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
DDX39BQ13838 AC027287.2-201ENST00000547559 592 ntTSL 4 BASIC4.52□□□□□ -1.69
DDX39BQ13838 MIR3667-201ENST00000581025 74 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
DDX39BQ13838 MTRNR2L12-201ENST00000600213 1049 ntAPPRIS P1 BASIC4.52□□□□□ -1.69
DDX39BQ13838 MIR4500HG-205ENST00000606590 579 ntTSL 4 BASIC4.52□□□□□ -1.69
DDX39BQ13838 AC133644.2-201ENST00000608142 540 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
DDX39BQ13838 AC097505.1-201ENST00000610199 565 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
DDX39BQ13838 WDR75-207ENST00000631047 270 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
DDX39BQ13838 PRUNE2-208ENST00000443509 12356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
DDX39BQ13838 IMPG2-201ENST00000193391 8337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
DDX39BQ13838 SLC30A6-205ENST00000435660 4776 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
DDX39BQ13838 AC021086.1-201ENST00000499025 1569 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
DDX39BQ13838 CTNNA3-203ENST00000433211 10675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
DDX39BQ13838 AC017002.4-201ENST00000604721 1525 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
DDX39BQ13838 NKRF-202ENST00000371527 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
DDX39BQ13838 ZNF660-201ENST00000322734 5834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
DDX39BQ13838 MPDZ-211ENST00000536827 6176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
DDX39BQ13838 RNASE2-201ENST00000304625 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
DDX39BQ13838 RN7SKP149-201ENST00000363008 344 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
DDX39BQ13838 IL6-206ENST00000407492 926 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
DDX39BQ13838 GSTM3P2-201ENST00000412746 530 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
DDX39BQ13838 AC092652.1-202ENST00000413315 587 ntTSL 4 BASIC4.51□□□□□ -1.69
DDX39BQ13838 RBMS3-AS1-201ENST00000414547 554 ntTSL 4 BASIC4.51□□□□□ -1.69
DDX39BQ13838 CFLAR-AS1-201ENST00000415011 1072 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
DDX39BQ13838 AC073521.1-201ENST00000418679 625 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
DDX39BQ13838 GAPDHP49-201ENST00000421421 961 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
DDX39BQ13838 FABP7P1-201ENST00000424004 391 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
DDX39BQ13838 RPS27P18-201ENST00000431701 247 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
DDX39BQ13838 AC009487.1-201ENST00000444164 403 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
DDX39BQ13838 AL627224.1-201ENST00000448334 444 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
DDX39BQ13838 LINC01765-201ENST00000448680 491 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
DDX39BQ13838 AC090142.1-201ENST00000465776 462 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
DDX39BQ13838 GYPB-202ENST00000502664 521 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
DDX39BQ13838 PTPN20-213ENST00000502705 854 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
DDX39BQ13838 AC093909.2-201ENST00000505178 437 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
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DDX39BQ13838 RNU2-30P-201ENST00000516209 141 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
DDX39BQ13838 AP001574.1-201ENST00000519566 546 ntTSL 4 BASIC4.51□□□□□ -1.69
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DDX39BQ13838 AP000676.2-201ENST00000529711 301 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
DDX39BQ13838 AL049875.1-201ENST00000554328 582 ntTSL 4 BASIC4.51□□□□□ -1.69
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DDX39BQ13838 AC020659.1-204ENST00000562920 400 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
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DDX39BQ13838 AC129510.2-201ENST00000582774 345 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
DDX39BQ13838 DAB1-AS1-208ENST00000586465 748 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
DDX39BQ13838 RNF138P2-201ENST00000603490 592 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
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DDX39BQ13838 AC092902.2-219ENST00000608488 822 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
DDX39BQ13838 AL096803.3-201ENST00000609032 532 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
DDX39BQ13838 SYNJ2BP-COX16-205ENST00000621525 929 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
DDX39BQ13838 VIPR1-AS1-223ENST00000627073 451 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
DDX39BQ13838 AL354733.2-209ENST00000589233 1434 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
DDX39BQ13838 SMAD5-212ENST00000545620 6937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
DDX39BQ13838 AC022893.2-201ENST00000564832 3296 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
DDX39BQ13838 BCLAF1P2-201ENST00000624956 2609 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
DDX39BQ13838 HIPK3-204ENST00000525975 3668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
DDX39BQ13838 AL583808.2-201ENST00000418078 1382 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
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DDX39BQ13838 MTRNR2L7-201ENST00000544824 1535 ntAPPRIS P1 BASIC4.51□□□□□ -1.69
DDX39BQ13838 ADAM18-201ENST00000265707 2388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
DDX39BQ13838 ZNF630-207ENST00000616492 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
DDX39BQ13838 AC092329.3-201ENST00000611392 1904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
DDX39BQ13838 ADGRG4-201ENST00000370652 9820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
DDX39BQ13838 RWDD2B-207ENST00000493196 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
DDX39BQ13838 SLC10A2-201ENST00000245312 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
DDX39BQ13838 FPGT-208ENST00000534056 1426 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
DDX39BQ13838 SYCP1-210ENST00000618516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
DDX39BQ13838 ARHGAP42-203ENST00000524892 5685 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
DDX39BQ13838 SNORA74A-201ENST00000364089 198 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
DDX39BQ13838 C1orf194-204ENST00000369949 731 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
DDX39BQ13838 R3HCC1L-204ENST00000370586 941 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
DDX39BQ13838 HSPD1P16-201ENST00000402302 394 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
DDX39BQ13838 RSU1P3-201ENST00000412878 835 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
DDX39BQ13838 AC006369.1-201ENST00000419425 548 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
DDX39BQ13838 RNF19BPX-201ENST00000426224 625 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
DDX39BQ13838 DPY19L1P2-201ENST00000426647 915 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
DDX39BQ13838 AC007559.1-201ENST00000428736 355 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
DDX39BQ13838 NRBF2P3-201ENST00000432731 865 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
DDX39BQ13838 AL606490.7-201ENST00000433136 191 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
DDX39BQ13838 RPS26P2-201ENST00000440331 348 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
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