Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 TCF4-290ENST00000638154 7801 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
RUNX3Q13761 CCNT1-205ENST00000618666 6915 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
RUNX3Q13761 AASDH-201ENST00000205214 3590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
RUNX3Q13761 AC011755.1-201ENST00000623763 2049 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
RUNX3Q13761 RPS6KA5-207ENST00000614987 26795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
RUNX3Q13761 UBR1-201ENST00000290650 7761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
RUNX3Q13761 CLUL1-213ENST00000620089 1947 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
RUNX3Q13761 ESCO1-204ENST00000622333 1850 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
RUNX3Q13761 FAM19A2-215ENST00000551619 2718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
RUNX3Q13761 POU2F1-212ENST00000541643 13937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
RUNX3Q13761 SLC30A6-205ENST00000435660 4776 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
RUNX3Q13761 MIR383-201ENST00000362257 73 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
RUNX3Q13761 SNORA37-201ENST00000384504 129 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
RUNX3Q13761 RPL21P43-201ENST00000425440 472 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
RUNX3Q13761 ANAPC1P1-201ENST00000426186 2145 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
RUNX3Q13761 LINC01014-203ENST00000455307 548 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
RUNX3Q13761 RPS7P7-201ENST00000463499 571 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
RUNX3Q13761 ALG13-211ENST00000473389 693 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
RUNX3Q13761 AC010255.1-201ENST00000504829 731 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
RUNX3Q13761 AC108475.1-201ENST00000507880 950 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
RUNX3Q13761 AC010425.1-201ENST00000511734 554 ntTSL 4 BASIC4.56□□□□□ -1.68
RUNX3Q13761 RNA5SP497-201ENST00000516081 97 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
RUNX3Q13761 AP003354.2-201ENST00000517983 563 ntTSL 4 BASIC4.56□□□□□ -1.68
RUNX3Q13761 IGLVVI-25-1-201ENST00000521893 249 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
RUNX3Q13761 LINC02553-201ENST00000529088 734 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
RUNX3Q13761 AP001804.2-201ENST00000533932 910 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
RUNX3Q13761 TRAV8-5-201ENST00000537369 341 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
RUNX3Q13761 TWF1-207ENST00000548315 1170 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
RUNX3Q13761 AC009268.1-201ENST00000561352 1203 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
RUNX3Q13761 AC127540.1-201ENST00000580311 689 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
RUNX3Q13761 TTN-AS1-217ENST00000585625 945 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
RUNX3Q13761 AC079587.1-201ENST00000603846 277 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
RUNX3Q13761 AC010894.2-203ENST00000606406 499 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
RUNX3Q13761 MIR6891-201ENST00000618788 93 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
RUNX3Q13761 ZNF479-203ENST00000620639 1239 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
RUNX3Q13761 TMEM30CP-203ENST00000637814 1035 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
RUNX3Q13761 MIR492-201ENST00000638676 116 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
RUNX3Q13761 OR56A3-205ENST00000641905 4595 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
RUNX3Q13761 CCNYL2-202ENST00000637719 3311 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
RUNX3Q13761 OR56A4-204ENST00000641835 3613 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
RUNX3Q13761 AC133552.1-201ENST00000569988 4007 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
RUNX3Q13761 FTO-203ENST00000460382 1517 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
RUNX3Q13761 CUL4AP1-201ENST00000514750 1863 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
RUNX3Q13761 ADAM29-214ENST00000618444 2949 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.56□□□□□ -1.68
RUNX3Q13761 OR5A1-202ENST00000641045 8612 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
RUNX3Q13761 FKBP7-204ENST00000424785 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
RUNX3Q13761 NCK1-204ENST00000469404 2403 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
RUNX3Q13761 SOCS5-201ENST00000306503 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
RUNX3Q13761 C12orf60-201ENST00000330828 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
RUNX3Q13761 CNTN1-202ENST00000348761 3328 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
RUNX3Q13761 C1orf100-201ENST00000308105 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
RUNX3Q13761 OR56B2P-201ENST00000317102 954 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
RUNX3Q13761 OR13G1-201ENST00000359688 1046 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
RUNX3Q13761 RNU1-94P-201ENST00000362627 173 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
RUNX3Q13761 RNU6-249P-201ENST00000363016 102 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
RUNX3Q13761 RNU6-670P-201ENST00000364312 104 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
RUNX3Q13761 RNU1-64P-201ENST00000365443 163 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
RUNX3Q13761 DNASE2B-202ENST00000370665 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
RUNX3Q13761 AL022722.2-201ENST00000402519 180 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
RUNX3Q13761 AL139095.3-201ENST00000419672 1203 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
RUNX3Q13761 LINC01492-202ENST00000425157 659 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
RUNX3Q13761 AC012497.1-201ENST00000429392 575 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
RUNX3Q13761 OR4C10P-201ENST00000434991 931 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
RUNX3Q13761 NMNAT1P2-201ENST00000435192 860 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
RUNX3Q13761 AC073486.1-202ENST00000458437 489 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
RUNX3Q13761 AC078828.1-201ENST00000471993 458 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
RUNX3Q13761 AC135999.1-201ENST00000478962 479 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
RUNX3Q13761 NAV2-AS3-201ENST00000534036 598 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
RUNX3Q13761 LINC02446-201ENST00000544591 868 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
RUNX3Q13761 AC069437.1-201ENST00000551372 512 ntTSL 4 BASIC4.55□□□□□ -1.68
RUNX3Q13761 AC098850.3-201ENST00000577569 771 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
RUNX3Q13761 AC093227.2-201ENST00000589357 285 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
RUNX3Q13761 STARD13-AS-208ENST00000589472 859 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
RUNX3Q13761 LINC00347-205ENST00000597518 868 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
RUNX3Q13761 AC022387.2-201ENST00000604050 448 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
RUNX3Q13761 AL591034.3-201ENST00000605511 685 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
RUNX3Q13761 AC092683.2-203ENST00000618807 788 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
RUNX3Q13761 AL161637.1-201ENST00000622380 412 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
RUNX3Q13761 RNA5SP196-201ENST00000625967 102 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
RUNX3Q13761 AC140479.6-201ENST00000633535 357 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
RUNX3Q13761 LINC01709-202ENST00000635702 1204 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
RUNX3Q13761 LRRC9-202ENST00000445360 4717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
RUNX3Q13761 ZNF660-201ENST00000322734 5834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
RUNX3Q13761 SEC31A-237ENST00000513858 3687 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
RUNX3Q13761 ZNF562-201ENST00000293648 12380 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
RUNX3Q13761 CDKL3-209ENST00000523054 1775 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
RUNX3Q13761 DYNAP-201ENST00000321600 2027 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
RUNX3Q13761 PCDH15-209ENST00000395433 6942 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
RUNX3Q13761 CD86-203ENST00000393627 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
RUNX3Q13761 PSG1-201ENST00000244296 2276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
RUNX3Q13761 AC010186.3-201ENST00000537616 2508 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
RUNX3Q13761 DHX9P1-201ENST00000436565 3076 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
RUNX3Q13761 BAZ2B-203ENST00000392782 8058 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
RUNX3Q13761 ARHGAP28-205ENST00000531294 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
RUNX3Q13761 RIMS1-204ENST00000401910 3542 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
RUNX3Q13761 AL158163.1-201ENST00000603915 1649 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
RUNX3Q13761 PDE7A-201ENST00000379419 2425 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
RUNX3Q13761 MPHOSPH9-211ENST00000541076 6136 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
RUNX3Q13761 UBE4A-203ENST00000545354 2149 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
RUNX3Q13761 ZNF207-203ENST00000394670 13781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
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