Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 AC062016.2-201ENST00000420950 676 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CACNA1SQ13698 CYCSP43-201ENST00000438233 310 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CACNA1SQ13698 DDX39BP2-208ENST00000453923 258 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CACNA1SQ13698 AC025470.2-201ENST00000506106 897 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CACNA1SQ13698 TVP23BP1-201ENST00000557500 617 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CACNA1SQ13698 AC011824.2-203ENST00000579975 633 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CACNA1SQ13698 AC245452.5-201ENST00000620649 780 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CACNA1SQ13698 MIR6500-201ENST00000622700 86 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CACNA1SQ13698 MUC12-206ENST00000536621 16321 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CACNA1SQ13698 FAP-214ENST00000627638 2569 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CACNA1SQ13698 ERGIC2-212ENST00000611644 4961 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CACNA1SQ13698 CD84-208ENST00000534968 7885 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
CACNA1SQ13698 GOLPH3L-201ENST00000271732 2999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
CACNA1SQ13698 NABP1-205ENST00000425611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
CACNA1SQ13698 CDR1-201ENST00000370532 2467 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CACNA1SQ13698 ZNF780A-205ENST00000594395 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CACNA1SQ13698 LRMP-201ENST00000354454 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
CACNA1SQ13698 OR13G1-201ENST00000359688 1046 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CACNA1SQ13698 AP000357.1-201ENST00000409926 1165 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CACNA1SQ13698 AC009237.5-201ENST00000414271 501 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CACNA1SQ13698 LINC00626-201ENST00000420691 955 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
CACNA1SQ13698 ARAFP1-201ENST00000422172 605 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CACNA1SQ13698 ARL4AP4-201ENST00000434170 518 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CACNA1SQ13698 AL353743.2-203ENST00000443630 492 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CACNA1SQ13698 AC018731.1-201ENST00000447078 576 ntTSL 4 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CACNA1SQ13698 LINC01150-201ENST00000455671 315 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
CACNA1SQ13698 SLC9A9-AS1-201ENST00000479030 518 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CACNA1SQ13698 LINC02146-201ENST00000504244 509 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CACNA1SQ13698 CHEK2P2-203ENST00000566448 670 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CACNA1SQ13698 FAM27D1-201ENST00000612308 341 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CACNA1SQ13698 KMT2E-216ENST00000622386 1588 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CACNA1SQ13698 HMBOX1-202ENST00000355231 1694 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CACNA1SQ13698 LINC01375-201ENST00000428485 1860 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CACNA1SQ13698 KCNMB2-210ENST00000617329 2214 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CACNA1SQ13698 AC092162.3-201ENST00000624511 1624 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CACNA1SQ13698 PRKACB-202ENST00000370682 4288 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
CACNA1SQ13698 SCN2A-203ENST00000375437 8792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CACNA1SQ13698 AP005435.3-201ENST00000531260 3198 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CACNA1SQ13698 ZNF616-204ENST00000600228 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
CACNA1SQ13698 ATP2C1-210ENST00000505330 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CACNA1SQ13698 SYTL2-213ENST00000525702 2727 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
CACNA1SQ13698 ENPP3-201ENST00000357639 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
CACNA1SQ13698 RNA5SP372-201ENST00000390836 115 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CACNA1SQ13698 AL158837.1-201ENST00000417644 452 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CACNA1SQ13698 SETP9-201ENST00000423837 832 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CACNA1SQ13698 AL691515.1-201ENST00000432976 733 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CACNA1SQ13698 TFDP2-211ENST00000479040 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
CACNA1SQ13698 ATP6V1G1P6-201ENST00000504007 334 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CACNA1SQ13698 NECAB1-205ENST00000522820 811 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CACNA1SQ13698 AF111169.4-202ENST00000553507 262 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CACNA1SQ13698 PWRN1-202ENST00000562501 642 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CACNA1SQ13698 RPL23AP97-201ENST00000568955 471 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CACNA1SQ13698 SLC14A2-AS1-203ENST00000592286 528 ntTSL 4 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CACNA1SQ13698 MYOCOS-203ENST00000637303 564 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CACNA1SQ13698 MATR3-228ENST00000620916 3134 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CACNA1SQ13698 KCNH5-201ENST00000322893 11290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
CACNA1SQ13698 AFF2-201ENST00000286437 12280 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CACNA1SQ13698 RORB-201ENST00000376896 9551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
CACNA1SQ13698 MTUS1-203ENST00000381861 3996 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CACNA1SQ13698 TRAV36DV7-201ENST00000390463 356 ntAPPRIS P1 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CACNA1SQ13698 NUDT7-202ENST00000437314 930 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
CACNA1SQ13698 TMSB4X-204ENST00000451311 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
CACNA1SQ13698 SKINT1L-203ENST00000453388 749 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CACNA1SQ13698 AL445433.1-201ENST00000457507 257 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CACNA1SQ13698 AC092546.1-202ENST00000505628 499 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CACNA1SQ13698 RNU6-352P-201ENST00000516908 107 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CACNA1SQ13698 LINC00520-201ENST00000554186 831 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CACNA1SQ13698 HMGN2P47-201ENST00000559378 272 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CACNA1SQ13698 MIR4472-2-201ENST00000582069 67 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CACNA1SQ13698 AC002069.2-201ENST00000603580 883 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CACNA1SQ13698 AL353726.1-201ENST00000614041 1000 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CACNA1SQ13698 AC099669.2-201ENST00000616549 437 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CACNA1SQ13698 AC012314.7-201ENST00000619693 93 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CACNA1SQ13698 AC015871.5-202ENST00000623252 701 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CACNA1SQ13698 IL15-204ENST00000477265 6026 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
CACNA1SQ13698 GCSAML-210ENST00000536561 4063 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CACNA1SQ13698 IQCH-206ENST00000546225 3112 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CACNA1SQ13698 ZNF43-207ENST00000595461 3399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
CACNA1SQ13698 BBX-204ENST00000406780 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CACNA1SQ13698 CYP3A43-201ENST00000222382 1515 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
CACNA1SQ13698 NPVF-201ENST00000222674 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
CACNA1SQ13698 SNORA9-201ENST00000384215 133 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CACNA1SQ13698 RN7SKP182-201ENST00000410772 298 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CACNA1SQ13698 LINC01492-202ENST00000425157 659 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CACNA1SQ13698 AC005358.1-201ENST00000445508 1143 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
CACNA1SQ13698 EIF2S2P5-201ENST00000457635 968 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CACNA1SQ13698 AC097467.3-212ENST00000512269 568 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CACNA1SQ13698 AC093524.1-201ENST00000564266 1094 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CACNA1SQ13698 RN7SL339P-201ENST00000580597 296 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CACNA1SQ13698 MIR7151-201ENST00000617477 60 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CACNA1SQ13698 RDM1-221ENST00000617591 432 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
CACNA1SQ13698 AC015967.1-201ENST00000619893 476 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CACNA1SQ13698 MIR6075-201ENST00000620782 95 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CACNA1SQ13698 AC007546.2-201ENST00000623996 360 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CACNA1SQ13698 ADAM29-201ENST00000359240 3325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CACNA1SQ13698 IL7R-201ENST00000303115 4626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
CACNA1SQ13698 AL133268.1-201ENST00000405676 1401 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CACNA1SQ13698 KIF14-202ENST00000614960 6838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
CACNA1SQ13698 TMEM71-210ENST00000523829 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CACNA1SQ13698 NXPH1-205ENST00000602349 1953 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
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