Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 STARD13-AS-235ENST00000609335 855 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PTCH1Q13635 C2orf91-203ENST00000615044 393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PTCH1Q13635 AC138965.3-201ENST00000623875 498 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
PTCH1Q13635 CDC23-202ENST00000394886 3155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
PTCH1Q13635 CACNB4-221ENST00000636130 7748 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PTCH1Q13635 ATP2C1-210ENST00000505330 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PTCH1Q13635 LINC02389-201ENST00000535058 3546 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PTCH1Q13635 RSF1-204ENST00000480887 5318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
PTCH1Q13635 DDX4-204ENST00000505374 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
PTCH1Q13635 AC097512.1-201ENST00000511453 1309 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PTCH1Q13635 RIMS2-205ENST00000436393 4384 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PTCH1Q13635 NCK1-204ENST00000469404 2403 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PTCH1Q13635 AL603750.1-201ENST00000624216 1717 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
PTCH1Q13635 TRAJ4-201ENST00000390533 63 ntAPPRIS P1 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PTCH1Q13635 ENSAP1-201ENST00000392855 326 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
PTCH1Q13635 AC012506.4-201ENST00000421563 541 ntTSL 4 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PTCH1Q13635 AL445584.1-201ENST00000431451 330 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
PTCH1Q13635 AL592494.1-201ENST00000437523 309 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PTCH1Q13635 AC011897.1-201ENST00000450715 346 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PTCH1Q13635 EIF2S2P5-201ENST00000457635 968 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
PTCH1Q13635 PGBD4P4-201ENST00000509673 613 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
PTCH1Q13635 RNA5SP497-201ENST00000516081 97 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
PTCH1Q13635 AC104393.1-201ENST00000517495 255 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PTCH1Q13635 AC012103.1-201ENST00000522281 780 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PTCH1Q13635 CCNG2P1-201ENST00000549521 1000 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
PTCH1Q13635 AC009852.2-201ENST00000567898 485 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
PTCH1Q13635 LINC02520-201ENST00000570443 537 ntTSL 4 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PTCH1Q13635 AC107993.1-201ENST00000591343 684 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
PTCH1Q13635 ZNF66-203ENST00000594534 757 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PTCH1Q13635 AP000569.1-201ENST00000607953 591 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PTCH1Q13635 AJ009632.2-205ENST00000635225 1169 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PTCH1Q13635 OR6C2-203ENST00000641516 1682 ntAPPRIS P1 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PTCH1Q13635 MARCH1-202ENST00000339875 2476 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
PTCH1Q13635 AKAP4-201ENST00000358526 2881 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
PTCH1Q13635 PCDH15-207ENST00000395430 7002 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
PTCH1Q13635 MYO16-201ENST00000251041 3492 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
PTCH1Q13635 ZNF780A-205ENST00000594395 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
PTCH1Q13635 PPP1R9A-201ENST00000289495 3983 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
PTCH1Q13635 TTF2-201ENST00000369466 9462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
PTCH1Q13635 OR5AS1-202ENST00000641320 7860 ntAPPRIS P1 BASIC6.07□□□□□ -1.44
PTCH1Q13635 AP001273.1-201ENST00000624493 3152 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
PTCH1Q13635 KATNA1-202ENST00000335647 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
PTCH1Q13635 PEX12P1-201ENST00000400284 1048 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
PTCH1Q13635 AL512326.1-201ENST00000443050 721 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
PTCH1Q13635 AP000462.1-201ENST00000535704 818 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
PTCH1Q13635 KLRC2-204ENST00000536833 771 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
PTCH1Q13635 TVP23BP1-201ENST00000557500 617 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
PTCH1Q13635 AC015908.5-201ENST00000623289 343 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
PTCH1Q13635 AL596218.1-201ENST00000634239 1140 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
PTCH1Q13635 ATRX-202ENST00000395603 10218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
PTCH1Q13635 ATP13A4-203ENST00000392443 4016 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
PTCH1Q13635 MPDZ-208ENST00000447879 6262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
PTCH1Q13635 LRRC49-204ENST00000544974 6605 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PTCH1Q13635 KCNT2-206ENST00000609185 3622 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
PTCH1Q13635 CFL2-201ENST00000298159 6747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
PTCH1Q13635 RALGAPA1P1-201ENST00000443361 6232 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
PTCH1Q13635 RLIMP1-201ENST00000339626 1680 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
PTCH1Q13635 LDHAL6CP-202ENST00000550738 3224 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
PTCH1Q13635 ADAM29-201ENST00000359240 3325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PTCH1Q13635 ECM2-202ENST00000375540 1606 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PTCH1Q13635 GABRG2-228ENST00000640985 3086 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PTCH1Q13635 PLCXD3-201ENST00000328457 7538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PTCH1Q13635 RNU1-63P-201ENST00000383902 164 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
PTCH1Q13635 AL080315.1-201ENST00000406055 466 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
PTCH1Q13635 LINC01201-201ENST00000412420 294 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PTCH1Q13635 RPL21P91-201ENST00000429231 479 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
PTCH1Q13635 AL162386.2-201ENST00000442428 457 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PTCH1Q13635 LINC02045-201ENST00000460324 679 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PTCH1Q13635 ANK3-207ENST00000460468 677 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PTCH1Q13635 MORF4L2P1-201ENST00000503761 858 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
PTCH1Q13635 RNA5SP249-201ENST00000516127 99 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
PTCH1Q13635 AC095350.2-201ENST00000544034 201 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PTCH1Q13635 AC129492.2-201ENST00000577807 517 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PTCH1Q13635 RN7SL435P-201ENST00000584418 282 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
PTCH1Q13635 LAMTOR5-AS1-217ENST00000608152 407 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PTCH1Q13635 LAMTOR5-AS1-227ENST00000609653 457 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PTCH1Q13635 ATP2C1-205ENST00000504381 3498 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PTCH1Q13635 FAM49B-212ENST00000519110 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PTCH1Q13635 NTRK3-205ENST00000394480 19984 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PTCH1Q13635 IGF1-202ENST00000337514 7359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
PTCH1Q13635 HMBOX1-202ENST00000355231 1694 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PTCH1Q13635 GCSAML-210ENST00000536561 4063 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PTCH1Q13635 PIGN-245ENST00000640252 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
PTCH1Q13635 ETV1-205ENST00000405192 4402 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
PTCH1Q13635 PTK2-212ENST00000519419 4439 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PTCH1Q13635 ZNF468-203ENST00000595646 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
PTCH1Q13635 SGIP1-204ENST00000371039 4080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
PTCH1Q13635 C15orf41-212ENST00000567389 2618 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
PTCH1Q13635 FKBP7-204ENST00000424785 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
PTCH1Q13635 ZBTB21-201ENST00000310826 7449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
PTCH1Q13635 RNA5SP151-201ENST00000365632 117 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PTCH1Q13635 MIR200C-201ENST00000384980 68 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PTCH1Q13635 RPL6P29-201ENST00000414863 865 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PTCH1Q13635 AC007422.1-201ENST00000433065 1008 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PTCH1Q13635 AC084149.1-201ENST00000437233 284 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PTCH1Q13635 LINC01307-202ENST00000444327 771 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PTCH1Q13635 AC139718.2-201ENST00000506068 481 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PTCH1Q13635 AC093763.1-201ENST00000512464 699 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PTCH1Q13635 SNORA74D-201ENST00000516404 141 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PTCH1Q13635 AC109466.1-204ENST00000519570 717 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
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