Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 IQGAP2-203ENST00000396234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
CUL4AQ13619 CFAP47-202ENST00000313548 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
CUL4AQ13619 ZBTB21-201ENST00000310826 7449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
CUL4AQ13619 MTRR-202ENST00000440940 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
CUL4AQ13619 PRG4-206ENST00000635041 4915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CUL4AQ13619 RAG2-209ENST00000618712 2818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CUL4AQ13619 SCN1A-210ENST00000635776 10107 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CUL4AQ13619 SOS1-203ENST00000426016 8517 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CUL4AQ13619 UBR1-201ENST00000290650 7761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
CUL4AQ13619 KARSP3-201ENST00000571212 1504 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CUL4AQ13619 LYST-202ENST00000389794 12985 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CUL4AQ13619 Y_RNA.110-201ENST00000363220 99 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CUL4AQ13619 RNA5SP123-201ENST00000363244 119 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CUL4AQ13619 RNU6-304P-201ENST00000364855 107 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CUL4AQ13619 CARD16-201ENST00000375704 613 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
CUL4AQ13619 SEC61A2-203ENST00000379017 600 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CUL4AQ13619 SCP2-205ENST00000408941 1298 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CUL4AQ13619 RNU2-50P-201ENST00000410494 143 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CUL4AQ13619 LINC01829-201ENST00000414404 571 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CUL4AQ13619 AC009302.1-201ENST00000417147 390 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CUL4AQ13619 AC093162.1-201ENST00000419682 124 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CUL4AQ13619 MTND2P11-201ENST00000423638 648 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CUL4AQ13619 CDY14P-201ENST00000431260 1014 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CUL4AQ13619 AC076966.1-201ENST00000435560 351 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
CUL4AQ13619 RPL12P11-201ENST00000439970 501 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CUL4AQ13619 CDY12P-201ENST00000440679 1015 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CUL4AQ13619 MTCYBP21-201ENST00000443300 1113 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CUL4AQ13619 CDY13P-201ENST00000445813 1015 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CUL4AQ13619 AC114814.3-201ENST00000449362 663 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CUL4AQ13619 CDY23P-201ENST00000451661 1014 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CUL4AQ13619 RN7SL809P-201ENST00000482040 297 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CUL4AQ13619 RAD21-203ENST00000517749 1003 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
CUL4AQ13619 AC018793.4-201ENST00000524542 585 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CUL4AQ13619 CARD16-203ENST00000525374 503 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CUL4AQ13619 OR5AZ1P-201ENST00000527448 943 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CUL4AQ13619 OSBPL9P3-201ENST00000534523 595 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CUL4AQ13619 AC068789.1-201ENST00000547942 577 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CUL4AQ13619 AL109741.3-201ENST00000561748 592 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CUL4AQ13619 AC124068.1-201ENST00000563131 678 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CUL4AQ13619 PWRN3-201ENST00000566797 849 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CUL4AQ13619 MIR548Y-201ENST00000582739 110 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CUL4AQ13619 AC092364.1-202ENST00000593824 565 ntTSL 4 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CUL4AQ13619 AC011503.1-202ENST00000598914 919 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CUL4AQ13619 ZNF92P2-201ENST00000600543 1059 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CUL4AQ13619 AC096553.1-201ENST00000605169 829 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CUL4AQ13619 AL008635.1-201ENST00000609073 385 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CUL4AQ13619 AL445493.3-201ENST00000619568 477 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CUL4AQ13619 AP002799.1-201ENST00000623552 423 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CUL4AQ13619 AC087632.1-216ENST00000625619 487 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CUL4AQ13619 SLC8A1-AS1-239ENST00000631142 623 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CUL4AQ13619 FRG1DP-201ENST00000635586 771 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CUL4AQ13619 MIR4302-201ENST00000638058 60 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CUL4AQ13619 AC018793.1-201ENST00000638166 585 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CUL4AQ13619 AC019072.1-201ENST00000604535 1551 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
CUL4AQ13619 INTS6P1-201ENST00000504674 2530 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
CUL4AQ13619 SPEF2-216ENST00000637569 7350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
CUL4AQ13619 AC125257.1-201ENST00000560400 2930 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
CUL4AQ13619 SMC2-AS1-201ENST00000603487 7020 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.55
CUL4AQ13619 PAN3-202ENST00000399613 4940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
CUL4AQ13619 CFAP70-201ENST00000310715 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CUL4AQ13619 KLHL4-202ENST00000373119 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
CUL4AQ13619 IRF5P1-201ENST00000504852 2164 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CUL4AQ13619 PTPRD-203ENST00000381196 9911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CUL4AQ13619 DLD-204ENST00000437604 1859 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CUL4AQ13619 PARP8-201ENST00000281631 7177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
CUL4AQ13619 SLCO1B7-201ENST00000421593 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
CUL4AQ13619 DCX-202ENST00000358070 9405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
CUL4AQ13619 OR5F1-201ENST00000278409 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CUL4AQ13619 OR8K1-201ENST00000279783 1087 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CUL4AQ13619 RNU6-650P-201ENST00000365658 111 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CUL4AQ13619 AC010385.1-201ENST00000412374 256 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CUL4AQ13619 AC140479.3-201ENST00000418944 1126 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CUL4AQ13619 SKP1P3-201ENST00000429280 487 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CUL4AQ13619 AL035458.1-201ENST00000433096 585 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CUL4AQ13619 LINC00412-201ENST00000444744 420 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CUL4AQ13619 RPS27AP15-201ENST00000447672 466 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CUL4AQ13619 AL355592.1-201ENST00000450292 386 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CUL4AQ13619 SKINT1L-203ENST00000453388 749 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CUL4AQ13619 SCARNA10-201ENST00000459255 330 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CUL4AQ13619 EPDR1-204ENST00000476620 555 ntTSL 4 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CUL4AQ13619 LINC02066-201ENST00000492731 580 ntTSL 4 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CUL4AQ13619 STK26-205ENST00000496850 1186 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
CUL4AQ13619 LINC02430-201ENST00000504755 476 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CUL4AQ13619 AC006499.3-201ENST00000506077 748 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CUL4AQ13619 AC098799.3-201ENST00000506095 438 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CUL4AQ13619 AC096773.1-201ENST00000506852 648 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CUL4AQ13619 AC104119.1-201ENST00000508829 339 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CUL4AQ13619 AC110760.1-201ENST00000513770 590 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CUL4AQ13619 IGLV3-26-201ENST00000520756 302 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CUL4AQ13619 AC025300.1-201ENST00000526616 384 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CUL4AQ13619 MS4A7-208ENST00000530234 730 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CUL4AQ13619 HAUS8P1-201ENST00000549005 542 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CUL4AQ13619 AC025265.1-201ENST00000551299 497 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CUL4AQ13619 LINC00871-201ENST00000555246 408 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CUL4AQ13619 AC092078.2-201ENST00000560900 581 ntTSL 4 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CUL4AQ13619 AC079148.1-201ENST00000565944 819 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CUL4AQ13619 AC007952.9-201ENST00000584365 191 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CUL4AQ13619 AC008537.2-201ENST00000596135 482 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CUL4AQ13619 OR7A19P-201ENST00000608051 733 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CUL4AQ13619 AL512506.1-201ENST00000613918 449 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.1 ms