Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 EMSY-207ENST00000525919 4074 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
ITGB3BPQ13352 MYB-226ENST00000528774 2277 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
ITGB3BPQ13352 AL929601.4-201ENST00000613011 1341 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ITGB3BPQ13352 OR51H2P-202ENST00000641424 3046 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ITGB3BPQ13352 VIP-201ENST00000367243 1581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
ITGB3BPQ13352 ZNF765-201ENST00000396408 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
ITGB3BPQ13352 EXO1-208ENST00000518483 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
ITGB3BPQ13352 ADGRL3-203ENST00000506700 4838 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
ITGB3BPQ13352 AP1G1-207ENST00000564155 2723 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
ITGB3BPQ13352 LINC02432-202ENST00000509161 2839 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
ITGB3BPQ13352 MPDZ-204ENST00000381022 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
ITGB3BPQ13352 MIR921-201ENST00000401133 56 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ITGB3BPQ13352 HDGFP1-201ENST00000405943 252 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ITGB3BPQ13352 FCF1P5-201ENST00000406490 482 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ITGB3BPQ13352 AC004875.1-201ENST00000432702 378 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
ITGB3BPQ13352 AC073587.1-201ENST00000447093 876 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ITGB3BPQ13352 RN7SL385P-201ENST00000468873 276 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ITGB3BPQ13352 AC098583.1-201ENST00000480875 255 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ITGB3BPQ13352 STMN1P2-201ENST00000508435 439 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ITGB3BPQ13352 ZFAND1-208ENST00000519523 698 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
ITGB3BPQ13352 TRAV8-5-201ENST00000537369 341 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ITGB3BPQ13352 LINC02390-201ENST00000541404 560 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
ITGB3BPQ13352 AC026992.1-202ENST00000558454 421 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
ITGB3BPQ13352 AC091178.1-203ENST00000584586 279 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ITGB3BPQ13352 MIR3138-201ENST00000585238 82 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ITGB3BPQ13352 LINC01791-201ENST00000589511 677 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
ITGB3BPQ13352 AC010422.4-201ENST00000601420 533 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
ITGB3BPQ13352 AC103792.1-201ENST00000603591 919 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ITGB3BPQ13352 AL590392.1-201ENST00000604960 446 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ITGB3BPQ13352 AL008729.2-201ENST00000606393 473 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ITGB3BPQ13352 AP002360.3-201ENST00000607673 710 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ITGB3BPQ13352 5S_rRNA.16-201ENST00000612928 119 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ITGB3BPQ13352 AC244517.3-201ENST00000616254 1235 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ITGB3BPQ13352 CCL14-203ENST00000620991 426 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
ITGB3BPQ13352 VIPR1-AS1-223ENST00000627073 451 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
ITGB3BPQ13352 OTOGL-204ENST00000547103 8032 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
ITGB3BPQ13352 ETV1-205ENST00000405192 4402 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
ITGB3BPQ13352 RIMS1-204ENST00000401910 3542 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
ITGB3BPQ13352 STAG2-205ENST00000371160 6045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
ITGB3BPQ13352 TAX1BP1-202ENST00000396319 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
ITGB3BPQ13352 NABP1-205ENST00000425611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
ITGB3BPQ13352 PUS7L-201ENST00000344862 13593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
ITGB3BPQ13352 RBBP6-202ENST00000348022 5739 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
ITGB3BPQ13352 CNGA1-209ENST00000544810 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
ITGB3BPQ13352 NXPH1-205ENST00000602349 1953 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ITGB3BPQ13352 ARHGEF12-202ENST00000397843 9660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
ITGB3BPQ13352 GRAMD1C-208ENST00000472026 1876 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
ITGB3BPQ13352 CSNK1G3-210ENST00000521364 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
ITGB3BPQ13352 ZFX-203ENST00000379177 7558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
ITGB3BPQ13352 NFIB-211ENST00000606230 2311 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
ITGB3BPQ13352 OR4K17-201ENST00000315543 1032 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
ITGB3BPQ13352 MIR331-201ENST00000362302 94 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
ITGB3BPQ13352 RN7SKP224-201ENST00000364140 325 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
ITGB3BPQ13352 SRY-201ENST00000383070 845 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
ITGB3BPQ13352 RNU1-63P-201ENST00000383902 164 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
ITGB3BPQ13352 CEACAMP8-201ENST00000413902 580 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
ITGB3BPQ13352 LINC01198-201ENST00000416521 500 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
ITGB3BPQ13352 AC131571.1-201ENST00000429821 577 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
ITGB3BPQ13352 PPIAP13-201ENST00000434706 478 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
ITGB3BPQ13352 ELOCP3-201ENST00000439303 348 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
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ITGB3BPQ13352 TTTY23-201ENST00000452889 512 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
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ITGB3BPQ13352 AC111000.4-201ENST00000504301 569 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
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ITGB3BPQ13352 RN7SKP5-201ENST00000517045 272 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
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ITGB3BPQ13352 MIR4675-201ENST00000577898 77 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
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ITGB3BPQ13352 LINC00993-204ENST00000606476 500 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
ITGB3BPQ13352 AC114781.5-201ENST00000615297 108 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
ITGB3BPQ13352 MIR6830-201ENST00000636015 70 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
ITGB3BPQ13352 SCN1A-218ENST00000640036 8131 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
ITGB3BPQ13352 SOCS5-201ENST00000306503 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
ITGB3BPQ13352 EOGT-210ENST00000615922 1931 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
ITGB3BPQ13352 PCDH11X-207ENST00000406881 4156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
ITGB3BPQ13352 OR4E2-202ENST00000641524 2855 ntAPPRIS P1 BASIC4.98□□□□□ -1.61
ITGB3BPQ13352 UGT2A3-201ENST00000251566 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
ITGB3BPQ13352 TET2-202ENST00000305737 9233 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
ITGB3BPQ13352 FAM204A-203ENST00000369183 13889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
ITGB3BPQ13352 PPP1R9A-207ENST00000433881 9928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
ITGB3BPQ13352 DNAJC9-AS1-204ENST00000440197 2865 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
ITGB3BPQ13352 TEX35-202ENST00000367639 785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
ITGB3BPQ13352 MIR3065-201ENST00000390137 79 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
ITGB3BPQ13352 AL583835.1-201ENST00000399570 407 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
ITGB3BPQ13352 FABP12P1-201ENST00000401911 322 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
ITGB3BPQ13352 RPS3AP54-201ENST00000435535 734 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
ITGB3BPQ13352 AC006037.1-201ENST00000437967 287 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
ITGB3BPQ13352 AC073636.1-202ENST00000457756 558 ntTSL 4 BASIC4.98□□□□□ -1.61
ITGB3BPQ13352 AC004692.2-202ENST00000458680 478 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
ITGB3BPQ13352 RN7SL303P-201ENST00000469773 251 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
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