Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 SV2B-201ENST00000330276 11202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 TRIM51GP-201ENST00000534741 1350 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 ZNF567-203ENST00000585696 3734 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 SLC26A5-207ENST00000393729 2422 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 SLC1A2-203ENST00000395753 11689 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 SRGAP1-201ENST00000355086 23331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 CLEC4A-201ENST00000229332 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 IL3-201ENST00000296870 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 RNVU1-6-201ENST00000364688 164 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 RNA5SP223-201ENST00000365174 120 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 DEFB119-203ENST00000376321 457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 MIR600-201ENST00000385007 98 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 MIR137-201ENST00000385223 102 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 AC104297.1-201ENST00000393779 870 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 AL021331.1-201ENST00000402817 582 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 AL356967.1-201ENST00000406305 431 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 AC105402.1-201ENST00000413336 545 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 GPC5-IT1-201ENST00000416664 658 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 OR2X1P-201ENST00000421144 687 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 AC246680.2-201ENST00000422106 389 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 OR6K4P-201ENST00000423179 955 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 AL158828.1-201ENST00000438582 197 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 CACYBPP1-201ENST00000438592 684 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 CR769776.1-201ENST00000441254 787 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 AL034380.1-201ENST00000448791 306 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 ZNF886P-201ENST00000450781 723 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 AL035407.2-201ENST00000454090 378 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 RPL7P32-201ENST00000457119 744 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 AC121764.2-201ENST00000469806 587 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 AC037198.2-201ENST00000478845 733 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 AC069444.1-201ENST00000489428 266 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 BOLA3P3-201ENST00000505182 232 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 AL159163.1-201ENST00000507747 600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 FGB-207ENST00000509493 1164 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 AC083795.2-201ENST00000510034 610 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 AC004980.4-201ENST00000513375 203 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 GPX8-208ENST00000515370 1036 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 TBCA-207ENST00000520039 157 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 AC023538.1-201ENST00000534576 736 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 BNIP3P1-201ENST00000547295 580 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 LINC02402-201ENST00000550337 1212 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 LINC00511-212ENST00000581183 657 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 RN7SL52P-201ENST00000584271 284 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 AC008738.1-201ENST00000590117 375 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 AC100781.1-203ENST00000598549 399 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 AC113368.1-201ENST00000603736 382 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 AC002487.1-201ENST00000604565 994 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 BNIP3P41-202ENST00000616656 861 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 RN7SL722P-201ENST00000617780 284 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 RN7SL565P-201ENST00000618246 284 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 AC068057.2-201ENST00000624047 895 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 PCBP1-AS1-278ENST00000625518 864 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 AC019226.2-201ENST00000625973 424 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 LINC01002-236ENST00000634022 378 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 SPTY2D1-AS1-204ENST00000634992 373 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 ZNF83-204ENST00000545872 2633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 PALMD-203ENST00000605497 1942 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 ZNF429-209ENST00000618549 1889 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 INTS6P1-201ENST00000504674 2530 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 LRIT3-201ENST00000327908 3781 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 ATPAF1-212ENST00000542495 1779 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 CLSPN-206ENST00000520551 4010 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 CTSV-203ENST00000538255 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 MGAM2-201ENST00000477922 7867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 AL365214.2-201ENST00000433684 1365 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 UGP2-203ENST00000445915 1955 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 WDR12-201ENST00000261015 8100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 AP000808.1-201ENST00000512200 3252 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 HOMER1-201ENST00000282260 774 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 OR5AC2-201ENST00000358642 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 SAR1A-201ENST00000373236 437 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 SEC61A2-203ENST00000379017 600 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 RNU6-185P-201ENST00000384421 107 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 MIR192-201ENST00000384915 110 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 RN7SKP126-201ENST00000411143 300 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 AL591468.1-201ENST00000417932 573 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 AC023347.1-202ENST00000419223 440 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 AC005005.2-201ENST00000420779 380 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 RPL12P28-201ENST00000430852 489 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 ZBTB40-IT1-201ENST00000438551 273 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 GABRG3-AS1-201ENST00000439938 970 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 AL354794.1-201ENST00000442103 516 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 KNOP1P3-201ENST00000446933 426 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 MRPL35P2-201ENST00000448009 511 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 LINC00448-202ENST00000448411 433 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 AC092647.2-201ENST00000452998 253 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 EIF4A2P4-201ENST00000458691 1196 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 AC096992.1-201ENST00000459808 709 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 RN7SL591P-201ENST00000496150 292 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 AC106821.1-201ENST00000502861 572 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 AC093534.1-201ENST00000504977 132 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 LINC00977-201ENST00000509893 1163 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 AC008837.1-201ENST00000511513 412 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 HDAC2-AS2-209ENST00000519270 1244 ntTSL 4 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 AC100784.1-201ENST00000522790 310 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 ZFPM2-AS1-207ENST00000524045 987 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 AC132219.1-201ENST00000524337 478 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 AP003557.1-202ENST00000528978 562 ntTSL 4 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 OR7E128P-201ENST00000532736 1024 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SEMA3BQ13214 AP002765.2-201ENST00000532961 666 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
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