Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 C1orf54-201ENST00000369098 418 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 SAMD13-202ENST00000370669 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 RNU6-481P-201ENST00000384194 107 ntBASIC5□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 TRAJ4-201ENST00000390533 63 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 HMGB1P10-201ENST00000395823 563 ntBASIC5□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 AL021331.1-201ENST00000402817 582 ntBASIC5□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 AL390316.1-201ENST00000406279 553 ntBASIC5□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 AC010385.1-201ENST00000412374 256 ntBASIC5□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 LINC01752-201ENST00000417299 438 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 AC092159.1-201ENST00000433724 493 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 TRAPPC13P1-201ENST00000435991 1062 ntBASIC5□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 Z93403.1-202ENST00000440002 713 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 OR7E125P-201ENST00000443450 846 ntBASIC5□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 C1orf143-201ENST00000443836 762 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 RPS27P5-201ENST00000444247 244 ntBASIC5□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 AL354714.3-201ENST00000447284 493 ntBASIC5□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 LRRC69-202ENST00000448384 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 SEPT7P3-201ENST00000455017 621 ntBASIC5□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 CXorf51A-201ENST00000458472 431 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 AC020779.1-201ENST00000478757 796 ntBASIC5□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 RN7SL441P-201ENST00000492388 296 ntBASIC5□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 KRTAP5-14P-201ENST00000502328 121 ntBASIC5□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 AC093720.1-201ENST00000505681 714 ntBASIC5□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 GNPDA2-202ENST00000507534 1050 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 MRPS33P2-201ENST00000507850 322 ntBASIC5□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 TPT1P8-201ENST00000510120 555 ntBASIC5□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 CHCHD7-209ENST00000519367 442 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 BUD31P1-201ENST00000521828 359 ntBASIC5□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 SDHAF2-208ENST00000543265 438 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 AL132712.2-201ENST00000556653 127 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 AC025917.1-201ENST00000562062 612 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 AC090666.1-201ENST00000578241 445 ntBASIC5□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 AL157392.3-211ENST00000599378 509 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 AL512782.1-201ENST00000603093 364 ntBASIC5□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 USP32P2-207ENST00000608376 253 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 AL451049.1-201ENST00000608672 497 ntBASIC5□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 AC083809.1-201ENST00000615051 472 ntBASIC5□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 AL122125.1-201ENST00000616999 600 ntBASIC5□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 AC087633.2-201ENST00000618611 725 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 AP003476.1-201ENST00000623984 516 ntBASIC5□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 METTL8-218ENST00000638989 876 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 METTL8-219ENST00000640734 726 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 LINC01689-201ENST00000416218 2007 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 DCX-202ENST00000358070 9405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 AC112198.2-201ENST00000426589 6996 ntBASIC5□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 ECT2L-201ENST00000367682 4343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 DOCK9-207ENST00000442173 7643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 SPAM1-201ENST00000223028 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 SCN2A-201ENST00000283256 8660 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 ZNF33A-201ENST00000307441 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC4.99□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 PTPN13-209ENST00000511467 8076 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 ELAVL2-202ENST00000380110 3691 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 FANCI-201ENST00000300027 4713 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 MUC2-202ENST00000613187 4845 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 PLEKHG7-201ENST00000344636 3868 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 GAS2L3-203ENST00000539410 2229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 CNTN5-207ENST00000527185 4303 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 MAPK10-263ENST00000641052 4307 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 RPGRIP1L-201ENST00000262135 8195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 NKRF-202ENST00000371527 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 ROS1-201ENST00000368507 7417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 COA1-201ENST00000223336 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 RPL32P3-201ENST00000359025 275 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 RNA5SP191-201ENST00000362585 102 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 C4orf47-201ENST00000378850 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 TRAV16-201ENST00000390444 329 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 AL158825.1-201ENST00000414735 521 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 AL159990.1-201ENST00000415119 337 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 LINC02528-201ENST00000417800 381 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 AC104462.2-201ENST00000418402 271 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 AC069213.2-201ENST00000420238 366 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 AL158154.1-201ENST00000427387 465 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 MTCO1P43-201ENST00000431831 488 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 AL159990.2-201ENST00000436491 337 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 RPL7AP61-201ENST00000443410 636 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 KRTAP21-3-201ENST00000444335 253 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 AC114877.1-201ENST00000446601 582 ntTSL 4 BASIC4.99□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 PSMC1P13-201ENST00000458195 985 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 AC008379.1-201ENST00000463655 464 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 AC005412.2-201ENST00000492004 341 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 AC097173.1-201ENST00000505862 819 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 RN7SKP141-201ENST00000516167 338 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 AC104036.1-201ENST00000523550 611 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 AC099520.2-201ENST00000523745 567 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 AC091163.1-201ENST00000524012 605 ntTSL 4 BASIC4.99□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 CASP1-206ENST00000526568 1061 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 AP003066.2-201ENST00000529375 555 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 CASP1-216ENST00000534497 825 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 AC104229.1-201ENST00000561364 255 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 AGGF1P9-201ENST00000561884 913 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 DPRXP4-201ENST00000578053 568 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 AC134669.2-201ENST00000578584 1008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 MIR5096-201ENST00000583713 70 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 AC034236.3-201ENST00000605999 461 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 AL355816.2-201ENST00000610049 647 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 PRKCQ-AS1-213ENST00000613985 883 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 AL356274.1-201ENST00000617064 410 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 AC010608.3-201ENST00000625048 527 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 FGF13-202ENST00000315930 19519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 SPATA2P1-201ENST00000431223 2055 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.3 ms