Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

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Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 AC110775.1-201ENST00000513721 462 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PTP4A2Q12974 AC091435.2-201ENST00000514586 565 ntTSL 4 BASIC5.16□□□□□ -1.58
PTP4A2Q12974 AP003354.2-201ENST00000517983 563 ntTSL 4 BASIC5.16□□□□□ -1.58
PTP4A2Q12974 HDAC2-AS2-207ENST00000518470 563 ntTSL 4 BASIC5.16□□□□□ -1.58
PTP4A2Q12974 AP001636.3-202ENST00000525714 894 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
PTP4A2Q12974 AC016987.1-201ENST00000558587 499 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
PTP4A2Q12974 IGKV2OR2-2-201ENST00000605025 300 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PTP4A2Q12974 AC010424.2-201ENST00000607594 443 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PTP4A2Q12974 AC097717.1-250ENST00000608498 273 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
PTP4A2Q12974 SSX9-202ENST00000608568 580 ntTSL 4 BASIC5.16□□□□□ -1.58
PTP4A2Q12974 AL356056.1-205ENST00000608904 651 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
PTP4A2Q12974 AC139769.3-201ENST00000618383 175 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PTP4A2Q12974 CHRM3-AS2-209ENST00000628573 766 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
PTP4A2Q12974 AC024337.2-201ENST00000616608 2797 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
PTP4A2Q12974 SEC63P2-201ENST00000503863 1939 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PTP4A2Q12974 ADGRL2-204ENST00000370715 5585 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
PTP4A2Q12974 TM4SF1-202ENST00000472441 3115 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
PTP4A2Q12974 PTPRO-204ENST00000445537 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
PTP4A2Q12974 TNRC6B-201ENST00000301923 15958 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
PTP4A2Q12974 SLMAP-206ENST00000428312 4132 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
PTP4A2Q12974 MAPK10-206ENST00000395161 4186 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
PTP4A2Q12974 SMG1P6-201ENST00000532337 2930 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
PTP4A2Q12974 ASB14-202ENST00000487349 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
PTP4A2Q12974 TDRD3-204ENST00000377894 2484 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.58
PTP4A2Q12974 BRIP1-202ENST00000577598 3969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
PTP4A2Q12974 GTPBP10-201ENST00000222511 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
PTP4A2Q12974 BICRAL-201ENST00000314073 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
PTP4A2Q12974 RBMS1-202ENST00000392753 3781 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
PTP4A2Q12974 OR2H1-203ENST00000377136 3024 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.58
PTP4A2Q12974 AC090510.1-202ENST00000500850 2017 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
PTP4A2Q12974 TPTE2-205ENST00000400230 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
PTP4A2Q12974 CLHC1-203ENST00000406076 1777 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
PTP4A2Q12974 OR2B6-201ENST00000244623 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.59
PTP4A2Q12974 RN7SKP104-201ENST00000362605 328 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PTP4A2Q12974 RNU6-304P-201ENST00000364855 107 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PTP4A2Q12974 SNORA70-201ENST00000384436 135 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PTP4A2Q12974 U3.35-201ENST00000408405 208 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PTP4A2Q12974 Z68694.1-201ENST00000413929 841 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PTP4A2Q12974 RGS17P1-201ENST00000423358 553 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PTP4A2Q12974 AL359853.3-201ENST00000423879 544 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
PTP4A2Q12974 SEC63P1-201ENST00000425785 1258 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PTP4A2Q12974 AC092159.1-201ENST00000433724 493 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
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PTP4A2Q12974 FXN-205ENST00000498653 856 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
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PTP4A2Q12974 CRISP1-203ENST00000505118 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
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PTP4A2Q12974 AC114550.3-201ENST00000524073 579 ntTSL 4 BASIC5.15□□□□□ -1.59
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PTP4A2Q12974 AC244502.1-203ENST00000541008 576 ntTSL 4 BASIC5.15□□□□□ -1.59
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PTP4A2Q12974 AC092079.1-201ENST00000558620 1985 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PTP4A2Q12974 ALB-201ENST00000295897 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
PTP4A2Q12974 MTHFD2L-207ENST00000433372 1407 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
PTP4A2Q12974 KAT6B-201ENST00000287239 8287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
PTP4A2Q12974 USF3-202ENST00000478658 8461 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PTP4A2Q12974 LINC02085-201ENST00000465215 2051 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PTP4A2Q12974 CASC1-204ENST00000395990 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
PTP4A2Q12974 ZNF845-201ENST00000458035 4311 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PTP4A2Q12974 COA1-201ENST00000223336 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PTP4A2Q12974 DIRC1-201ENST00000308100 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
PTP4A2Q12974 OR8K5-201ENST00000313447 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PTP4A2Q12974 AC135895.1-201ENST00000360528 1058 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PTP4A2Q12974 RNA5SP305-201ENST00000362665 119 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PTP4A2Q12974 RNU5B-4P-201ENST00000363508 111 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PTP4A2Q12974 RNU6-317P-201ENST00000384031 107 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PTP4A2Q12974 DNAJC19P6-201ENST00000401853 280 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PTP4A2Q12974 Z97832.1-201ENST00000402490 328 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PTP4A2Q12974 AP002530.1-201ENST00000405705 684 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PTP4A2Q12974 AL158837.1-201ENST00000417644 452 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PTP4A2Q12974 KCNIP1-205ENST00000434108 726 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
PTP4A2Q12974 AL445644.1-201ENST00000436524 751 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PTP4A2Q12974 PSMD10P3-201ENST00000437000 448 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
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