Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 BAZ2B-203ENST00000392782 8058 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 ARHGAP21-202ENST00000376410 3526 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 OR51A7-201ENST00000359350 1048 ntAPPRIS P1 BASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 MIR130A-201ENST00000385274 89 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 ZSCAN12P1-201ENST00000406489 419 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 AL391863.2-201ENST00000411838 681 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 MIR3681HG-202ENST00000412606 578 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 AP000534.2-201ENST00000412729 568 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 OR2AT2P-201ENST00000413438 905 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 LINC01442-201ENST00000414201 704 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 LINC01752-201ENST00000417299 438 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 AC004690.1-201ENST00000418216 328 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 AC006076.1-201ENST00000423233 345 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 TMEM183AP1-205ENST00000432739 290 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 RPL21P110-201ENST00000433345 446 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 AC099654.1-201ENST00000442649 407 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 AL392089.1-202ENST00000444793 449 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 AC073130.1-202ENST00000454897 587 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 MTATP6P14-201ENST00000455189 673 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 HMGB3P30-201ENST00000457863 606 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 ALDH7A1P3-201ENST00000492517 345 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 NDUFB5P1-201ENST00000508134 564 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 PTGES3P3-201ENST00000511479 482 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 RNU6-488P-201ENST00000515918 99 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 CYCSP22-201ENST00000517555 339 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 AC064802.1-201ENST00000521523 866 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 HMGB1P1-201ENST00000522557 636 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 MTND1P6-201ENST00000523621 946 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 OR52B2-201ENST00000530810 1079 ntAPPRIS P1 BASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 CACNA1C-IT2-201ENST00000541871 589 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 RAD51AP1-213ENST00000544927 787 ntTSL 4 BASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 AC090109.1-201ENST00000548885 819 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 TIMM9-203ENST00000555061 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 LINC02490-201ENST00000559915 601 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 AC009117.3-202ENST00000563825 557 ntTSL 4 BASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 AC010761.5-201ENST00000579468 287 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 EIF1P5-201ENST00000585002 234 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 AC087283.1-201ENST00000604029 1074 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 AC104695.2-201ENST00000605056 775 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 AC113194.1-201ENST00000606037 500 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 AC019080.3-201ENST00000606180 444 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 AF129408.1-201ENST00000608767 431 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 AC018645.2-201ENST00000609151 472 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 AC116651.1-201ENST00000609724 556 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 AC104763.3-201ENST00000613765 618 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 ATXN3-251ENST00000617719 1074 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 AL138955.1-201ENST00000622881 1040 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 AC010872.1-201ENST00000624225 675 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 MIR325HG-202ENST00000626832 598 ntTSL 4 BASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 LINC00506-201ENST00000628435 525 ntTSL 4 BASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 EIF1AY-201ENST00000361365 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 MTND5P28-201ENST00000438005 1594 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 ALB-202ENST00000401494 1659 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 C4BPAP1-201ENST00000415474 1893 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 THAP12P5-201ENST00000405864 2275 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 CAST-201ENST00000309190 4282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 RALGAPA1-204ENST00000553892 6271 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 FILIP1-203ENST00000393004 7807 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 NKRF-202ENST00000371527 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 OR2H1-202ENST00000377133 3021 ntAPPRIS P1 BASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 OR2H1-203ENST00000377136 3024 ntAPPRIS P1 BASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 OR52E4-202ENST00000641726 2947 ntAPPRIS P1 BASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 DST-202ENST00000312431 17756 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 LIMA1-212ENST00000552491 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 DENND4A-201ENST00000431932 5875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 MMP16-201ENST00000286614 11558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 OR10G4-203ENST00000641722 3301 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 STAG2-202ENST00000371144 4281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 ELOVL7-203ENST00000505959 4165 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 ZRANB2-201ENST00000254821 2821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 VPS13D-213ENST00000613099 16245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 FTX-210ENST00000603037 8347 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 AL121886.1-201ENST00000358609 435 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 RNU1-150P-201ENST00000362491 162 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 RNA5SP502-201ENST00000362694 119 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 IFNB1-201ENST00000380232 859 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 EIF5P1-201ENST00000400019 1231 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 AL162394.1-201ENST00000413271 419 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 RPSAP35-201ENST00000413753 818 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 NPM1P4-201ENST00000414095 812 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 AC004882.2-201ENST00000420180 244 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 BX284632.2-201ENST00000421091 399 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 RPL7P57-201ENST00000423238 740 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 TCEAL3-AS1-201ENST00000424887 361 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 AC234779.1-201ENST00000425910 285 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 PSMA2P3-201ENST00000429685 675 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 MTCO1P43-201ENST00000431831 488 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 AC019117.1-202ENST00000439046 589 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 AL512605.1-202ENST00000441919 381 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 LINC01309-201ENST00000444795 492 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 AL359955.2-201ENST00000445380 353 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 AC023271.1-201ENST00000445936 1090 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 LINC01729-201ENST00000450640 358 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 AL160408.1-203ENST00000453568 631 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 DNAJB5P1-201ENST00000454004 806 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 AL138737.1-201ENST00000456896 1252 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 AC004692.2-201ENST00000457315 355 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 snoU13.7-201ENST00000459220 104 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 RPL37P6-202ENST00000464216 403 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXD4Q12950 RN7SL197P-201ENST00000466981 299 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
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