Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

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Length 444 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 AC068631.1-223ENST00000625877 472 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXF2Q12947 WDR75-207ENST00000631047 270 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXF2Q12947 AL121759.2-201ENST00000636173 570 ntTSL 4 BASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXF2Q12947 AC099654.10-201ENST00000640395 161 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXF2Q12947 AL034546.1-201ENST00000623740 3693 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXF2Q12947 TRIM64B-201ENST00000329862 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXF2Q12947 AL592429.1-201ENST00000403909 1473 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXF2Q12947 LINC01020-202ENST00000508201 1800 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXF2Q12947 EMSY-201ENST00000334736 5508 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXF2Q12947 FTO-204ENST00000463855 3056 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXF2Q12947 AC109780.1-201ENST00000451768 1344 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXF2Q12947 CASP10-202ENST00000286186 5928 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXF2Q12947 RAPH1-207ENST00000423104 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXF2Q12947 LMNTD1-202ENST00000413632 1520 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXF2Q12947 PTPRT-201ENST00000356100 12480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXF2Q12947 PTPRT-202ENST00000373184 12483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXF2Q12947 PTPRT-203ENST00000373187 12453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXF2Q12947 CHST9-203ENST00000618847 11388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXF2Q12947 GTDC1-204ENST00000392869 10514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
FOXF2Q12947 C9orf135-AS1-201ENST00000439418 1375 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
FOXF2Q12947 SEMA3A-201ENST00000265362 8225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
FOXF2Q12947 AL022344.1-201ENST00000439913 3965 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
FOXF2Q12947 SLC26A3-201ENST00000340010 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
FOXF2Q12947 DLG1-210ENST00000422288 2854 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
FOXF2Q12947 ZNF615-201ENST00000376716 4048 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
FOXF2Q12947 AC144833.1-201ENST00000567953 4089 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
FOXF2Q12947 CCDC54-201ENST00000261058 1444 ntAPPRIS P1 BASIC4.91□□□□□ -1.62
FOXF2Q12947 FBXW12-201ENST00000296438 1647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
FOXF2Q12947 YTHDC1-207ENST00000579690 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
FOXF2Q12947 SIAH1-202ENST00000380006 3352 ntAPPRIS P3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
FOXF2Q12947 MGAM2-201ENST00000477922 7867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
FOXF2Q12947 Y_RNA.88-201ENST00000363029 99 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
FOXF2Q12947 RNA5SP326-201ENST00000363209 110 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
FOXF2Q12947 RNA5SP27-201ENST00000363839 119 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
FOXF2Q12947 RNU6-353P-201ENST00000364266 108 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
FOXF2Q12947 ZRSR2-202ENST00000380308 744 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
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FOXF2Q12947 MIR105-2-201ENST00000385083 81 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
FOXF2Q12947 DNAJA1P3-201ENST00000399417 1194 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
FOXF2Q12947 AC013472.2-201ENST00000416226 306 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
FOXF2Q12947 PCDH9-AS2-201ENST00000419371 538 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
FOXF2Q12947 ITGA9-AS1-202ENST00000420870 581 ntTSL 4 BASIC4.91□□□□□ -1.62
FOXF2Q12947 F10-AS1-201ENST00000424635 417 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
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FOXF2Q12947 CT45A2-201ENST00000605791 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
FOXF2Q12947 NANOGP3-201ENST00000605855 286 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
FOXF2Q12947 SOX2OT_exon1.1-201ENST00000614902 232 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
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FOXF2Q12947 AC239868.2-201ENST00000564237 4527 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
FOXF2Q12947 HMMR-203ENST00000393915 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
FOXF2Q12947 LINC01963-201ENST00000562038 3148 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
FOXF2Q12947 ZNF546-201ENST00000347077 7987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
FOXF2Q12947 KYNUP3-201ENST00000574386 1341 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
FOXF2Q12947 CCDC18-AS1-205ENST00000421202 2973 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
FOXF2Q12947 LRRC49-223ENST00000560369 2586 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
FOXF2Q12947 ATXN2-215ENST00000542287 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
FOXF2Q12947 MT-RNR2-201ENST00000387347 1559 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
FOXF2Q12947 CDKAL1-201ENST00000274695 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
FOXF2Q12947 IRAK4-203ENST00000448290 1381 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
FOXF2Q12947 OBSCN-201ENST00000284548 20432 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
FOXF2Q12947 SPATA1-206ENST00000490879 2888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
FOXF2Q12947 FRMD6-205ENST00000554167 4176 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.62
FOXF2Q12947 SYTL2-208ENST00000524452 2733 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.62
FOXF2Q12947 JCHAIN-206ENST00000543780 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
FOXF2Q12947 MSR1-204ENST00000381998 2826 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
FOXF2Q12947 LINC01951-201ENST00000377300 1925 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.62
FOXF2Q12947 LIPF-203ENST00000394375 1470 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.62
FOXF2Q12947 LYRM2-208ENST00000523377 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
FOXF2Q12947 LINC01179-201ENST00000507838 2163 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
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