Protein–RNA interactions for Protein: P59942

MCCD1, Mitochondrial coiled-coil domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCD1P59942 SNORA58-201ENST00000505219 137 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
MCCD1P59942 AC093325.1-201ENST00000508378 326 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
MCCD1P59942 B3GNTL1P1-201ENST00000509174 289 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
MCCD1P59942 RNA5SP401-201ENST00000515920 127 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
MCCD1P59942 COX6B1P6-201ENST00000522347 255 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
MCCD1P59942 KC877392.1-201ENST00000524855 426 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
MCCD1P59942 EIF4A2P5-201ENST00000529914 499 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
MCCD1P59942 RPL27A-211ENST00000532359 406 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
MCCD1P59942 PHBP2-201ENST00000532859 806 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
MCCD1P59942 CDKN3-206ENST00000541304 1070 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
MCCD1P59942 LINC02384-208ENST00000546086 565 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
MCCD1P59942 LINC02386-201ENST00000551202 509 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
MCCD1P59942 CAPN3-210ENST00000561817 915 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
MCCD1P59942 LINC01904-201ENST00000564872 861 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
MCCD1P59942 AC010531.4-201ENST00000570286 576 ntTSL 4 BASIC7.2□□□□□ -1.26
MCCD1P59942 ZNF43-209ENST00000598288 560 ntTSL 4 BASIC7.2□□□□□ -1.26
MCCD1P59942 CERS6-AS1-209ENST00000609766 642 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
MCCD1P59942 MIR6070-201ENST00000613967 103 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
MCCD1P59942 MDM4-215ENST00000614459 9782 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
MCCD1P59942 AC138058.1-201ENST00000620572 449 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
MCCD1P59942 KLHL5-201ENST00000261425 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
MCCD1P59942 ECHDC1-222ENST00000531967 2585 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
MCCD1P59942 PNLIPRP3-201ENST00000369230 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
MCCD1P59942 AC022905.1-201ENST00000503430 3048 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
MCCD1P59942 SLC2A14-201ENST00000340749 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
MCCD1P59942 IARS-213ENST00000627121 4587 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
MCCD1P59942 ELOVL5-203ENST00000370918 3081 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
MCCD1P59942 EPHA3-203ENST00000494014 3085 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
MCCD1P59942 NFX1-203ENST00000379540 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
MCCD1P59942 PKN2-202ENST00000370513 2890 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
MCCD1P59942 B3GNT5-206ENST00000465010 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
MCCD1P59942 ZNF106-201ENST00000263805 10460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
MCCD1P59942 NRXN1-248ENST00000636345 3595 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
MCCD1P59942 IL20-202ENST00000367098 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
MCCD1P59942 FMN1-211ENST00000561249 4251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
MCCD1P59942 SF3B3-201ENST00000302516 9720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
MCCD1P59942 BNC1-202ENST00000569704 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
MCCD1P59942 RGPD1-206ENST00000641458 5271 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
MCCD1P59942 LPA-201ENST00000316300 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
MCCD1P59942 NLRP4-203ENST00000587891 3201 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
MCCD1P59942 NARS2-204ENST00000528850 2137 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
MCCD1P59942 ZNF402P-201ENST00000404435 3100 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
MCCD1P59942 PSG1-206ENST00000595356 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
MCCD1P59942 PSMC6-201ENST00000445930 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
MCCD1P59942 ERVFRD-1-201ENST00000472091 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
MCCD1P59942 GPRIN3-202ENST00000609438 14244 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
MCCD1P59942 ESF1-202ENST00000617257 1470 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
MCCD1P59942 SERPINB7-207ENST00000546027 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
MCCD1P59942 AC004852.2-201ENST00000614289 2218 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
MCCD1P59942 GOLT1B-201ENST00000229314 3227 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
MCCD1P59942 ADH7-202ENST00000437033 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
MCCD1P59942 AC009220.2-201ENST00000489759 1751 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
MCCD1P59942 DACH2-207ENST00000510272 1764 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
MCCD1P59942 PMCH-201ENST00000329406 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
MCCD1P59942 ARGFX-201ENST00000334384 992 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
MCCD1P59942 SNORA32.2-201ENST00000384049 122 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
MCCD1P59942 MIR606-201ENST00000384851 96 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
MCCD1P59942 SNORA75.4-201ENST00000391278 119 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
MCCD1P59942 ZNF788-202ENST00000397759 777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
MCCD1P59942 AL359694.1-201ENST00000403247 604 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
MCCD1P59942 AL136131.1-201ENST00000406079 803 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
MCCD1P59942 RNU6-1068P-201ENST00000410958 103 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
MCCD1P59942 AP000695.2-201ENST00000428667 715 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
MCCD1P59942 AC018865.1-201ENST00000433507 578 ntTSL 4 BASIC7.19□□□□□ -1.26
MCCD1P59942 BRK1P2-201ENST00000442875 223 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
MCCD1P59942 CRYZL1-217ENST00000445393 824 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
MCCD1P59942 HMGN1P36-201ENST00000446623 298 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
MCCD1P59942 AC007557.1-201ENST00000451711 541 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
MCCD1P59942 TREML3P-201ENST00000457327 501 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
MCCD1P59942 RN7SL83P-201ENST00000468131 297 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
MCCD1P59942 RAB7A-205ENST00000485280 507 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
MCCD1P59942 RPS3AP50-201ENST00000487064 803 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
MCCD1P59942 RN7SL350P-201ENST00000492591 299 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
MCCD1P59942 LINC00903-201ENST00000497854 223 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
MCCD1P59942 LINC02379-201ENST00000505741 300 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
MCCD1P59942 AC103851.1-201ENST00000506833 274 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
MCCD1P59942 AC139713.2-204ENST00000511042 342 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
MCCD1P59942 SCARNA11.1-201ENST00000516918 132 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
MCCD1P59942 AP001085.1-201ENST00000524441 639 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
MCCD1P59942 AP001970.1-201ENST00000531681 701 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
MCCD1P59942 LRTOMT-215ENST00000538478 814 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
MCCD1P59942 ADAMTS7P4-205ENST00000560651 453 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
MCCD1P59942 AC011120.1-201ENST00000583916 624 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
MCCD1P59942 AC006504.5-202ENST00000586784 656 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
MCCD1P59942 RPL29P33-201ENST00000587474 316 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
MCCD1P59942 RPL7AP69-201ENST00000595306 806 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
MCCD1P59942 CEP164P1-207ENST00000608660 504 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
MCCD1P59942 AL513478.2-201ENST00000610400 988 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
MCCD1P59942 LRRC2-AS1-202ENST00000614743 633 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
MCCD1P59942 LINC01646-202ENST00000634256 1107 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
MCCD1P59942 FOXM1-202ENST00000359843 3315 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
MCCD1P59942 INTS7-203ENST00000366994 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
MCCD1P59942 CD96-203ENST00000438817 1565 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
MCCD1P59942 RSU1P2-203ENST00000448600 1582 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
MCCD1P59942 MEF2C-AS1-214ENST00000514794 2350 ntTSL 4 BASIC7.19□□□□□ -1.26
MCCD1P59942 AL512353.3-201ENST00000417517 1326 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
MCCD1P59942 EEF1A1P42-201ENST00000613436 1331 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
MCCD1P59942 AF121898.1-201ENST00000440763 1860 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
MCCD1P59942 IL6ST-212ENST00000522633 1878 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
MCCD1P59942 TMTC2-204ENST00000549919 6211 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.9 ms