Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 GYPA-203ENST00000503627 318 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
PTPRAP18433 SCARNA15.1-201ENST00000516384 125 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
PTPRAP18433 AC025366.1-201ENST00000523264 202 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
PTPRAP18433 MINCR-206ENST00000524335 499 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
PTPRAP18433 AP005639.1-201ENST00000526939 192 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
PTPRAP18433 LINC02384-206ENST00000541707 904 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
PTPRAP18433 AC068722.1-202ENST00000559600 655 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
PTPRAP18433 AC091117.2-201ENST00000560324 542 ntTSL 4 BASIC6.88□□□□□ -1.31
PTPRAP18433 AL138976.2-201ENST00000563989 694 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
PTPRAP18433 TXNP4-201ENST00000575018 310 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
PTPRAP18433 MIR1269B-201ENST00000580405 75 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
PTPRAP18433 AC005726.5-201ENST00000585189 298 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
PTPRAP18433 RNASEH2B-AS1-206ENST00000601286 657 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
PTPRAP18433 AC011453.2-201ENST00000603737 729 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
PTPRAP18433 AC018445.2-201ENST00000622987 260 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
PTPRAP18433 RASSF9-201ENST00000361228 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
PTPRAP18433 LCOR-201ENST00000286067 4542 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
PTPRAP18433 LPAR6-201ENST00000345941 2428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
PTPRAP18433 RFX4-203ENST00000392842 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
PTPRAP18433 NUP93-202ENST00000542526 8257 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
PTPRAP18433 CDY2A-201ENST00000250838 1954 ntAPPRIS ALT1 BASIC6.88□□□□□ -1.31
PTPRAP18433 LINC02466-201ENST00000500092 1963 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
PTPRAP18433 ST6GAL1-211ENST00000448044 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
PTPRAP18433 AC078880.4-201ENST00000617627 1749 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
PTPRAP18433 CFHR4-204ENST00000608469 1601 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
PTPRAP18433 IL20-202ENST00000367098 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
PTPRAP18433 OXCT1-206ENST00000512084 1593 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
PTPRAP18433 FCGR1B-209ENST00000616817 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
PTPRAP18433 GPATCH2L-201ENST00000261530 14007 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
PTPRAP18433 RPL37A-210ENST00000491306 3647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
PTPRAP18433 PDE4D-202ENST00000317118 2599 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
PTPRAP18433 AL589993.1-201ENST00000407450 2524 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
PTPRAP18433 NPHP3-AS1-202ENST00000504440 2507 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
PTPRAP18433 RAB6C-AS1-201ENST00000412425 2454 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
PTPRAP18433 AC131971.1-201ENST00000332881 1482 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
PTPRAP18433 STAG2-202ENST00000371144 4281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
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PTPRAP18433 FER-210ENST00000628534 558 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
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PTPRAP18433 AQP9-202ENST00000536493 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
PTPRAP18433 DNAH10-210ENST00000638045 13678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
PTPRAP18433 TMEM132B-206ENST00000613307 9659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
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PTPRAP18433 ACACA-240ENST00000617649 7912 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
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PTPRAP18433 CNOT1-216ENST00000569240 7660 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
PTPRAP18433 ORC3-202ENST00000392844 2512 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
PTPRAP18433 MAPK10-261ENST00000641050 3109 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
PTPRAP18433 SORBS1-203ENST00000354106 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
PTPRAP18433 PLD5-203ENST00000427495 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
PTPRAP18433 PDZRN4-203ENST00000539469 3041 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
PTPRAP18433 EGFEM1P-205ENST00000483846 2327 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
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