Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 LINC01496-201ENST00000448761 460 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 AL355592.1-201ENST00000450292 386 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 XACT-201ENST00000468762 497 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 RPL23AP37-201ENST00000479658 549 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 CEACAMP10-202ENST00000495431 496 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 LINC02173-201ENST00000504132 521 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 AC108156.1-201ENST00000507849 481 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 OR51K1P-201ENST00000510214 950 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 OR5H4P-201ENST00000510851 923 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 COMMD10-206ENST00000515539 869 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 AC023200.1-201ENST00000519660 651 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 AP001636.3-202ENST00000525714 894 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 AC087783.1-201ENST00000527135 564 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 AC124293.1-201ENST00000530034 493 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 OR5D15P-201ENST00000531671 942 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 ATXN3-215ENST00000532032 1191 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 AC010547.3-201ENST00000569271 440 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 DPRXP4-201ENST00000578053 568 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 AC068790.7-201ENST00000602347 528 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 SUGT1P3-202ENST00000604259 383 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 AC135507.1-201ENST00000607214 561 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 PLSCR2-206ENST00000610787 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 FGF1-214ENST00000612258 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 CU634019.2-201ENST00000625184 593 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 RYR3-208ENST00000622037 15564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 C15orf54-202ENST00000625107 3078 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 ZNF311-203ENST00000377179 2730 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 RFC1-202ENST00000381897 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 VWC2L-201ENST00000312504 4610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 AC005703.1-201ENST00000431343 1773 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 HACD3-209ENST00000566511 1782 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 ETV1-208ENST00000420159 6231 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 SGO1P2-201ENST00000429458 1589 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 KMT2E-216ENST00000622386 1588 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 IGF2BP2-AS1-202ENST00000456447 1531 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 GTF2H2B-203ENST00000508065 1432 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 VIM-AS1-201ENST00000437232 1351 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 ZNF788-203ENST00000430298 3941 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 WDR17-201ENST00000280190 4705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 GABRG3-201ENST00000333743 1235 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 RNU6-666P-201ENST00000363499 107 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 SEC61A2-203ENST00000379017 600 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 RNU6-1263P-201ENST00000384601 106 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 AL138880.1-201ENST00000405824 642 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 RNA5SP498-201ENST00000411342 120 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 RN7SKP273-201ENST00000411392 314 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
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USP18Q9UMW8 AC009299.3-201ENST00000421122 1072 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
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USP18Q9UMW8 LIX1L-AS1-205ENST00000437797 536 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
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USP18Q9UMW8 AL161618.1-201ENST00000438738 761 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 UPP2-IT1-201ENST00000439185 357 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 LINC01923-201ENST00000443261 592 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
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USP18Q9UMW8 AC105999.2-201ENST00000521363 881 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
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USP18Q9UMW8 DCN-210ENST00000547568 823 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
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USP18Q9UMW8 AC106791.2-201ENST00000604680 391 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 OR2AS2P-201ENST00000606902 342 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 AC013562.2-201ENST00000611632 603 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 HULC.1-201ENST00000612720 240 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 AC105227.2-201ENST00000615075 605 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 U6.107-201ENST00000637108 79 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 ZNF343-207ENST00000612935 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 ERVH48-1-201ENST00000447535 2790 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 SEC24D-211ENST00000511481 2626 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 ZNF506-201ENST00000443905 4095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 FLG2-201ENST00000388718 9124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 SLC12A1-201ENST00000330289 1764 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 AC018809.2-201ENST00000602436 3823 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 PNISR-202ENST00000438806 3142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 DNTTIP2-202ENST00000436063 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 CCT8P1-201ENST00000413611 1657 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 AL138828.1-203ENST00000419926 1570 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 OR2AP1-202ENST00000641114 1548 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 PCGF5-201ENST00000336126 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 ZNF518B-201ENST00000326756 6894 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 IL1RAPL2-201ENST00000344799 1290 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 RNA5SP319-201ENST00000362768 119 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 RNU6-623P-201ENST00000363143 105 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 Y_RNA.192-201ENST00000363977 102 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
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