Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 OR10G7-202ENST00000641585 3449 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
USP35Q9P2H5 IL21-201ENST00000264497 629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
USP35Q9P2H5 OR8B3-201ENST00000354597 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
USP35Q9P2H5 RNU6-353P-201ENST00000364266 108 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
USP35Q9P2H5 APOOL-201ENST00000373173 1279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
USP35Q9P2H5 OR8B2-201ENST00000375013 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
USP35Q9P2H5 MANSC4-201ENST00000381273 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
USP35Q9P2H5 MIR192-201ENST00000384915 110 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
USP35Q9P2H5 AL356967.1-201ENST00000406305 431 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
USP35Q9P2H5 RNA5SP487-201ENST00000410186 122 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
USP35Q9P2H5 RNU2-6P-201ENST00000411404 190 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
USP35Q9P2H5 TRIM60P5Y-201ENST00000413946 574 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
USP35Q9P2H5 ATP6V1G1P7-201ENST00000415853 349 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
USP35Q9P2H5 AL929472.2-201ENST00000419993 481 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
USP35Q9P2H5 COX6CP17-201ENST00000421389 185 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
USP35Q9P2H5 AL049637.1-201ENST00000424664 503 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
USP35Q9P2H5 AC092634.2-201ENST00000428146 1010 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
USP35Q9P2H5 DYNLL1P7-201ENST00000429273 258 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
USP35Q9P2H5 AC008072.1-201ENST00000434254 824 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
USP35Q9P2H5 AC009963.2-201ENST00000453431 138 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
USP35Q9P2H5 RNU7-140P-201ENST00000459546 60 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
USP35Q9P2H5 F11-AS1-201ENST00000505103 1178 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
USP35Q9P2H5 RPS4XP20-201ENST00000505751 772 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
USP35Q9P2H5 AC120193.1-201ENST00000518988 741 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
USP35Q9P2H5 LRRC6P1-201ENST00000532188 885 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
USP35Q9P2H5 AC130404.1-201ENST00000539362 739 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
USP35Q9P2H5 AL163932.1-201ENST00000555776 542 ntTSL 4 BASIC7.24□□□□□ -1.25
USP35Q9P2H5 LINS1-207ENST00000560133 1196 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
USP35Q9P2H5 NTAN1P1-201ENST00000603150 646 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
USP35Q9P2H5 AC112220.2-201ENST00000605513 533 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
USP35Q9P2H5 AC024060.1-201ENST00000607052 494 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
USP35Q9P2H5 IL21-202ENST00000611104 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
USP35Q9P2H5 AC116447.1-201ENST00000613153 453 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
USP35Q9P2H5 AC099494.2-201ENST00000623371 978 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
USP35Q9P2H5 AC116563.2-201ENST00000624751 535 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
USP35Q9P2H5 MIR7641-1-201ENST00000627518 61 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
USP35Q9P2H5 NR2C2-213ENST00000617312 8113 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
USP35Q9P2H5 SDCBP-213ENST00000630925 2076 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
USP35Q9P2H5 PTPRB-202ENST00000334414 12316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
USP35Q9P2H5 ZNF420-202ENST00000337995 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
USP35Q9P2H5 AL157756.1-201ENST00000532515 2859 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
USP35Q9P2H5 OR4E2-202ENST00000641524 2855 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
USP35Q9P2H5 DTNA-229ENST00000598142 2509 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
USP35Q9P2H5 ZNF83-203ENST00000541777 3743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
USP35Q9P2H5 PRUNE2-201ENST00000223609 2697 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
USP35Q9P2H5 IL15-204ENST00000477265 6026 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
USP35Q9P2H5 SLC35A1-201ENST00000369552 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
USP35Q9P2H5 AC021237.1-201ENST00000504175 1643 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
USP35Q9P2H5 KRR1-201ENST00000229214 10118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
USP35Q9P2H5 CCNB3-201ENST00000276014 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
USP35Q9P2H5 RNVU1-6-201ENST00000364688 164 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
USP35Q9P2H5 OR5L2-201ENST00000378397 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
USP35Q9P2H5 PRR21-201ENST00000408934 1170 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
USP35Q9P2H5 AL138760.1-201ENST00000423283 435 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
USP35Q9P2H5 MTCYBP32-201ENST00000427945 1084 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
USP35Q9P2H5 RPL39L-202ENST00000433055 749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
USP35Q9P2H5 AL139002.1-201ENST00000435281 902 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
USP35Q9P2H5 AC012368.1-201ENST00000438115 552 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
USP35Q9P2H5 BX248409.1-201ENST00000455497 255 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
USP35Q9P2H5 RPL37P3-201ENST00000456825 293 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
USP35Q9P2H5 HMGB1P44-201ENST00000508597 572 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
USP35Q9P2H5 MTND6P2-201ENST00000512226 524 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
USP35Q9P2H5 AC098869.2-201ENST00000514187 862 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
USP35Q9P2H5 AC093331.2-201ENST00000520459 677 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
USP35Q9P2H5 SLC48A1-205ENST00000547002 751 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
USP35Q9P2H5 LINC02345-203ENST00000558897 405 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
USP35Q9P2H5 AC015912.1-201ENST00000574826 538 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
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USP35Q9P2H5 AC091905.4-201ENST00000623432 202 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
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USP35Q9P2H5 AC009303.2-205ENST00000627670 1091 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
USP35Q9P2H5 KSR2-202ENST00000425217 17008 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
USP35Q9P2H5 PAK3-205ENST00000417227 2196 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
USP35Q9P2H5 AC092162.3-201ENST00000624511 1624 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
USP35Q9P2H5 XRN1-201ENST00000264951 10143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
USP35Q9P2H5 GPR1-201ENST00000407325 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
USP35Q9P2H5 SGIP1-203ENST00000371037 7768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
USP35Q9P2H5 DOPEY1-201ENST00000237163 7995 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
USP35Q9P2H5 AC011755.1-201ENST00000623763 2049 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
USP35Q9P2H5 PDCD1LG2-201ENST00000397747 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
USP35Q9P2H5 TAAR1-201ENST00000275216 1020 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
USP35Q9P2H5 AC093719.1-202ENST00000392735 373 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
USP35Q9P2H5 RPL11P3-201ENST00000395256 523 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
USP35Q9P2H5 CoTC_ribozyme.1-201ENST00000408104 192 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
USP35Q9P2H5 AC109779.1-201ENST00000414475 573 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
USP35Q9P2H5 RPS7P9-201ENST00000414704 586 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
USP35Q9P2H5 MTND4P3-201ENST00000417829 541 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
USP35Q9P2H5 OSTCP5-201ENST00000425293 453 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
USP35Q9P2H5 NPM1P24-201ENST00000428039 894 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
USP35Q9P2H5 TSSK4-203ENST00000428351 576 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
USP35Q9P2H5 AL139819.1-201ENST00000429420 471 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
USP35Q9P2H5 MTCYBP15-201ENST00000433123 1127 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
USP35Q9P2H5 AC092809.1-201ENST00000441469 474 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
USP35Q9P2H5 EXOSC3P1-201ENST00000448649 500 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
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