Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXF6

RAB11FIP5, Rab11 family-interacting protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP5Q9BXF6 APC-207ENST00000508376 10619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
RAB11FIP5Q9BXF6 CSRNP3-201ENST00000314499 11788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC9C1-201ENST00000305815 4172 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC02085-201ENST00000465215 2051 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
RAB11FIP5Q9BXF6 AC000374.1-201ENST00000434698 1745 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
RAB11FIP5Q9BXF6 ATP13A4-203ENST00000392443 4016 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
RAB11FIP5Q9BXF6 CUL2-209ENST00000537177 4271 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF137P-201ENST00000456718 1920 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
RAB11FIP5Q9BXF6 OR13G1-201ENST00000359688 1046 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
RAB11FIP5Q9BXF6 RNU4-39P-201ENST00000362455 127 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
RAB11FIP5Q9BXF6 RN7SKP74-201ENST00000362849 309 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
RAB11FIP5Q9BXF6 S100A9-201ENST00000368738 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
RAB11FIP5Q9BXF6 TRBV24-1-201ENST00000390397 381 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
RAB11FIP5Q9BXF6 TRAV26-2-201ENST00000390460 327 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
RAB11FIP5Q9BXF6 MAST4-207ENST00000407621 559 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
RAB11FIP5Q9BXF6 AL359265.2-201ENST00000434367 631 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
RAB11FIP5Q9BXF6 MTND2P2-201ENST00000434633 945 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC00446-202ENST00000438327 357 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
RAB11FIP5Q9BXF6 RPS15AP29-201ENST00000445539 400 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
RAB11FIP5Q9BXF6 AP001596.1-202ENST00000452460 644 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
RAB11FIP5Q9BXF6 AC096741.1-201ENST00000472250 846 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
RAB11FIP5Q9BXF6 RPL7AP10-201ENST00000481016 791 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
RAB11FIP5Q9BXF6 VPS26A-206ENST00000489794 928 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
RAB11FIP5Q9BXF6 PDCD10-216ENST00000492396 814 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
RAB11FIP5Q9BXF6 FO393419.2-201ENST00000492975 428 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
RAB11FIP5Q9BXF6 HMGB1P3-201ENST00000502802 616 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
RAB11FIP5Q9BXF6 AL033397.2-201ENST00000508884 547 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
RAB11FIP5Q9BXF6 SETP12-201ENST00000514068 805 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
RAB11FIP5Q9BXF6 RNU6-513P-201ENST00000516104 104 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
RAB11FIP5Q9BXF6 AC124069.1-201ENST00000517454 735 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
RAB11FIP5Q9BXF6 AC091564.3-201ENST00000527398 429 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
RAB11FIP5Q9BXF6 AC027544.2-201ENST00000539313 630 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
RAB11FIP5Q9BXF6 AC092140.1-201ENST00000563090 549 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
RAB11FIP5Q9BXF6 AC118757.1-201ENST00000586982 453 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
RAB11FIP5Q9BXF6 AC004160.1-202ENST00000599917 578 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
RAB11FIP5Q9BXF6 AL391001.1-201ENST00000602747 715 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
RAB11FIP5Q9BXF6 AL161616.1-201ENST00000611867 286 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC00923-207ENST00000619015 505 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
RAB11FIP5Q9BXF6 RPL23AP61-201ENST00000623642 466 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
RAB11FIP5Q9BXF6 AC074387.1-201ENST00000632044 823 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
RAB11FIP5Q9BXF6 AL031119.1-201ENST00000404707 1879 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
RAB11FIP5Q9BXF6 MAP3K20-202ENST00000375213 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
RAB11FIP5Q9BXF6 PTPN13-202ENST00000411767 8119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
RAB11FIP5Q9BXF6 MFSD8-242ENST00000641690 4199 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
RAB11FIP5Q9BXF6 AC006994.2-202ENST00000639259 3828 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
RAB11FIP5Q9BXF6 TLK1-212ENST00000521943 2605 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
RAB11FIP5Q9BXF6 EXO1-208ENST00000518483 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC00862-204ENST00000637098 1400 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM68-202ENST00000434581 2549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
RAB11FIP5Q9BXF6 AL022393.1-201ENST00000625142 1677 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
RAB11FIP5Q9BXF6 CNTN6-205ENST00000446702 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
RAB11FIP5Q9BXF6 SLAIN1-202ENST00000314070 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
RAB11FIP5Q9BXF6 TCN1-201ENST00000257264 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
RAB11FIP5Q9BXF6 SPATA2P1-201ENST00000431223 2055 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
RAB11FIP5Q9BXF6 CLEC7A-203ENST00000310002 425 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
RAB11FIP5Q9BXF6 AL590240.1-201ENST00000334118 313 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
RAB11FIP5Q9BXF6 DEFB128-201ENST00000334391 373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
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RAB11FIP5Q9BXF6 TRAJ35-201ENST00000390502 59 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
RAB11FIP5Q9BXF6 OR1F12-201ENST00000402365 945 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
RAB11FIP5Q9BXF6 AL080315.1-201ENST00000406055 466 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
RAB11FIP5Q9BXF6 RPL37P18-201ENST00000411602 243 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC00161-201ENST00000412526 870 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
RAB11FIP5Q9BXF6 AC062031.1-201ENST00000414967 747 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
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RAB11FIP5Q9BXF6 RPL7P57-201ENST00000423238 740 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
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RAB11FIP5Q9BXF6 LINC01878-201ENST00000434559 769 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
RAB11FIP5Q9BXF6 AL353681.1-201ENST00000435828 731 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
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RAB11FIP5Q9BXF6 OR7H2P-201ENST00000513483 306 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
RAB11FIP5Q9BXF6 AL671862.1-201ENST00000515851 349 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
RAB11FIP5Q9BXF6 RN7SKP46-201ENST00000515942 234 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
RAB11FIP5Q9BXF6 AC012103.1-201ENST00000522281 780 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
RAB11FIP5Q9BXF6 NPM1P35-201ENST00000533043 868 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
RAB11FIP5Q9BXF6 AC084880.2-201ENST00000536009 501 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
RAB11FIP5Q9BXF6 AC090023.2-201ENST00000540875 545 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
RAB11FIP5Q9BXF6 SETP1-201ENST00000556014 845 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
RAB11FIP5Q9BXF6 AL139021.2-201ENST00000556390 399 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
RAB11FIP5Q9BXF6 AGBL1-AS1-203ENST00000566878 865 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
RAB11FIP5Q9BXF6 RN7SL690P-201ENST00000582087 240 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
RAB11FIP5Q9BXF6 SP2-AS1-204ENST00000585280 405 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
RAB11FIP5Q9BXF6 AL137078.2-201ENST00000615740 318 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
RAB11FIP5Q9BXF6 AC015804.1-201ENST00000622935 435 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC00836-203ENST00000628620 1179 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
RAB11FIP5Q9BXF6 AC092813.1-201ENST00000635455 969 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
RAB11FIP5Q9BXF6 CDKL3-210ENST00000523832 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
RAB11FIP5Q9BXF6 AC021242.1-201ENST00000507315 2035 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
RAB11FIP5Q9BXF6 ELF1-204ENST00000625359 2032 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
RAB11FIP5Q9BXF6 EPHA3-202ENST00000452448 2546 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
RAB11FIP5Q9BXF6 AL672167.1-204ENST00000641875 3017 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
RAB11FIP5Q9BXF6 GRIK2-204ENST00000369137 4272 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
RAB11FIP5Q9BXF6 RNF111-212ENST00000561186 4536 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
RAB11FIP5Q9BXF6 AL731532.2-201ENST00000623542 1953 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
RAB11FIP5Q9BXF6 ORC4-202ENST00000392857 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
RAB11FIP5Q9BXF6 ALS2CR12-202ENST00000392257 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
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