Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 AL355306.2-209ENST00000437803 357 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 CBX1P4-201ENST00000439415 457 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 PTGES3P1-201ENST00000439531 483 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 TBX18-AS1-202ENST00000441863 382 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 FHP1-201ENST00000442741 703 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 AC016772.1-201ENST00000444170 1261 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 AL356421.2-201ENST00000446733 197 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 SBDSP1-204ENST00000453858 737 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 AL021393.1-201ENST00000456740 539 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 AC005229.2-201ENST00000456995 399 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 COPS8P2-201ENST00000473228 627 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 LINC02234-202ENST00000513288 705 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 ZFAND1-208ENST00000519523 698 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 AC023202.1-201ENST00000521681 491 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 OR8G5-201ENST00000524943 1041 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 LRRC6P1-201ENST00000532188 885 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 AP000462.1-201ENST00000535704 818 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 FAXC-204ENST00000538471 941 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 AC079866.2-201ENST00000541870 515 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 BLZF2P-201ENST00000553776 1130 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 AL132857.1-201ENST00000555180 708 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 AC022098.3-201ENST00000590715 315 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 BNIP3P32-201ENST00000600015 554 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 EIF1P6-201ENST00000600054 334 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 AC024060.1-201ENST00000607052 494 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 AC021205.3-201ENST00000609680 1709 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 AC016769.4-201ENST00000616893 535 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 AL035461.2-201ENST00000619201 524 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 AC073052.2-202ENST00000622296 775 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 ITGA9-AS1-218ENST00000630762 751 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 AL121594.5-201ENST00000631724 573 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 AC136428.4-201ENST00000634254 1155 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 LEUTX-202ENST00000638280 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 VNN2-201ENST00000326499 2118 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 AC092079.1-201ENST00000558620 1985 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 NSRP1P1-201ENST00000444067 1693 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 AL590763.1-201ENST00000398297 1545 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 AC120338.1-201ENST00000625074 1541 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 AC000123.3-201ENST00000624029 4975 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 LINC02085-201ENST00000465215 2051 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 DPP8-203ENST00000341861 8699 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 AC015813.1-203ENST00000585065 4722 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 GABRA3-201ENST00000370314 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 AC235565.1-201ENST00000456962 1325 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 Z95327.2-201ENST00000414579 1873 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 TIPARP-207ENST00000542783 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 LRRC19-201ENST00000380055 3609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 PTPRD-201ENST00000355233 8251 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 DNAH6-202ENST00000389394 12795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 AL133268.1-201ENST00000405676 1401 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 FABP4-201ENST00000256104 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-1339P-201ENST00000363574 91 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-353P-201ENST00000364266 108 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-171P-201ENST00000384354 107 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 SYCP3-202ENST00000392924 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 GUCA1C-202ENST00000393963 900 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 AC013442.1-201ENST00000397347 228 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 RPS3AP25-201ENST00000411660 793 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 DPPA2P3-201ENST00000411853 655 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 MTND4P3-201ENST00000417829 541 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 RIMKLBP2-201ENST00000424737 654 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 AC092634.2-201ENST00000428146 1010 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 AL049749.1-201ENST00000430281 632 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 RPL7L1P9-201ENST00000431298 745 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 AC241644.1-201ENST00000431525 446 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 FKBP7-205ENST00000434643 666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 AC105271.1-201ENST00000442876 497 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 AP000470.1-201ENST00000448063 693 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 AZGP1P2-201ENST00000454506 345 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 LINC01312-202ENST00000456347 813 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 RNU7-140P-201ENST00000459546 60 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 AP000797.2-201ENST00000475768 606 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 SSR3-206ENST00000476217 807 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 AC005912.1-201ENST00000495392 255 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 AC010627.1-201ENST00000503819 1294 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 AC026719.1-201ENST00000506059 456 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 AC006499.3-201ENST00000506077 748 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 MYLK-AS2-201ENST00000510827 500 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 TBCA-207ENST00000520039 157 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 AC012103.1-201ENST00000522281 780 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 AC009563.1-202ENST00000523365 643 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 AC023796.1-201ENST00000536131 670 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 AC016526.2-201ENST00000554225 520 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 AC004825.1-201ENST00000555068 586 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 AC090971.2-201ENST00000558142 510 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 AC068714.1-201ENST00000559623 800 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 AC087190.2-201ENST00000565648 731 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 CYP2C60P-201ENST00000566088 139 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 AC005670.2-201ENST00000571841 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 AC027455.1-201ENST00000574104 594 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 AP000769.2-201ENST00000602344 396 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 IGLCOR22-2-201ENST00000605398 313 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 AL365400.2-201ENST00000605604 902 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 AL353600.1-201ENST00000608148 251 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 AC004948.1-201ENST00000609858 672 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 AC015914.2-201ENST00000618167 288 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 HMMR-203ENST00000393915 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 FGD4-210ENST00000525053 2925 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 ZFX-211ENST00000539115 6801 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 ZNF12-203ENST00000404360 4474 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.7 ms