Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWI4

SHISA2, Protein shisa-2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHISA2Q6UWI4 PARP4P1-201ENST00000435945 2337 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SHISA2Q6UWI4 AC132219.2-201ENST00000624416 2327 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SHISA2Q6UWI4 LHX9-201ENST00000367387 7836 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SHISA2Q6UWI4 KCNH7-202ENST00000332142 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SHISA2Q6UWI4 PRLR-202ENST00000310101 1297 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SHISA2Q6UWI4 BX322650.1-201ENST00000332359 2143 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SHISA2Q6UWI4 Y_RNA.373-201ENST00000365600 103 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SHISA2Q6UWI4 SPRR2E-202ENST00000368751 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SHISA2Q6UWI4 SPRR2D-202ENST00000368756 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SHISA2Q6UWI4 RNU6-38P-201ENST00000384085 107 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SHISA2Q6UWI4 TRBV6-6-201ENST00000390371 388 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SHISA2Q6UWI4 SNORD37.1-201ENST00000390968 65 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SHISA2Q6UWI4 RNU6-952P-201ENST00000391164 108 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SHISA2Q6UWI4 ARSFP1-201ENST00000398758 477 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SHISA2Q6UWI4 FDPSP5-201ENST00000399474 1057 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SHISA2Q6UWI4 MIR548M-201ENST00000408260 86 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SHISA2Q6UWI4 RN7SKP146-201ENST00000410242 334 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SHISA2Q6UWI4 RNU2-28P-201ENST00000410457 189 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SHISA2Q6UWI4 VAV3-203ENST00000415432 1293 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SHISA2Q6UWI4 GH2-202ENST00000423893 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SHISA2Q6UWI4 AC073900.1-201ENST00000429766 776 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SHISA2Q6UWI4 AC119618.1-201ENST00000434191 222 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SHISA2Q6UWI4 AL731534.1-201ENST00000434711 269 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SHISA2Q6UWI4 TUBB4BP6-201ENST00000437576 479 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SHISA2Q6UWI4 RPEP4-201ENST00000437636 602 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SHISA2Q6UWI4 AF228730.2-201ENST00000438784 848 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SHISA2Q6UWI4 AL158835.1-204ENST00000449693 371 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SHISA2Q6UWI4 GOT2P2-201ENST00000450663 1251 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SHISA2Q6UWI4 RPL31P11-202ENST00000454082 372 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SHISA2Q6UWI4 GH2-204ENST00000456543 794 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SHISA2Q6UWI4 RNU6-333P-201ENST00000459117 107 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SHISA2Q6UWI4 TDGF1P6-201ENST00000463873 448 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SHISA2Q6UWI4 RPS16P9-201ENST00000477220 427 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SHISA2Q6UWI4 LINC00960-202ENST00000492922 2126 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SHISA2Q6UWI4 LINC01181-201ENST00000503718 556 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SHISA2Q6UWI4 AC091965.3-201ENST00000506236 208 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SHISA2Q6UWI4 AC008592.4-201ENST00000509999 450 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SHISA2Q6UWI4 AC093668.1-201ENST00000514917 911 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SHISA2Q6UWI4 LINC02492-204ENST00000515660 584 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SHISA2Q6UWI4 MTND6P19-201ENST00000519399 524 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SHISA2Q6UWI4 COX6CP8-201ENST00000522620 226 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SHISA2Q6UWI4 AC009884.1-201ENST00000522670 545 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SHISA2Q6UWI4 AC107952.1-201ENST00000524200 376 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SHISA2Q6UWI4 AC103843.1-201ENST00000527318 682 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SHISA2Q6UWI4 AP000827.1-201ENST00000527814 258 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SHISA2Q6UWI4 MS4A7-208ENST00000530234 730 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SHISA2Q6UWI4 HABP2-203ENST00000542051 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SHISA2Q6UWI4 AC079598.4-201ENST00000549647 265 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SHISA2Q6UWI4 CBX5-204ENST00000550411 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SHISA2Q6UWI4 OVCH1-AS1-202ENST00000550906 654 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SHISA2Q6UWI4 AC007375.1-201ENST00000554513 578 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SHISA2Q6UWI4 AC244034.2-201ENST00000562504 509 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SHISA2Q6UWI4 AL078601.3-201ENST00000573303 535 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SHISA2Q6UWI4 AC129492.2-201ENST00000577807 517 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SHISA2Q6UWI4 AP001496.1-201ENST00000579113 471 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SHISA2Q6UWI4 AC011516.1-201ENST00000599129 180 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SHISA2Q6UWI4 AC008738.6-201ENST00000604605 569 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SHISA2Q6UWI4 AC009237.17-201ENST00000618111 748 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SHISA2Q6UWI4 CCL14-202ENST00000618404 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SHISA2Q6UWI4 AC244472.1-201ENST00000620773 347 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SHISA2Q6UWI4 AC078938.1-201ENST00000620993 318 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SHISA2Q6UWI4 LAMTOR5-AS1-248ENST00000630488 703 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SHISA2Q6UWI4 LCA5L-203ENST00000380671 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SHISA2Q6UWI4 MYO6-201ENST00000369975 5387 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SHISA2Q6UWI4 KAT6B-205ENST00000372725 6944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SHISA2Q6UWI4 TRPM3-208ENST00000377105 5957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SHISA2Q6UWI4 DNM1L-203ENST00000381000 4397 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SHISA2Q6UWI4 MUSK-205ENST00000374448 2754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SHISA2Q6UWI4 ERVH48-1-201ENST00000447535 2790 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SHISA2Q6UWI4 DICER1-214ENST00000556045 2776 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SHISA2Q6UWI4 R3HCC1L-203ENST00000370584 3372 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SHISA2Q6UWI4 BCL2L14-204ENST00000396367 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SHISA2Q6UWI4 HMGCR-209ENST00000511206 3395 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SHISA2Q6UWI4 ZNF429-209ENST00000618549 1889 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SHISA2Q6UWI4 DDX42-203ENST00000457800 3323 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SHISA2Q6UWI4 CSNK1G3-210ENST00000521364 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SHISA2Q6UWI4 FAM240A-201ENST00000444264 1826 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SHISA2Q6UWI4 FAM240A-202ENST00000640551 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SHISA2Q6UWI4 CYP8B1-201ENST00000316161 3974 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SHISA2Q6UWI4 NEDD9-208ENST00000504387 3211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SHISA2Q6UWI4 AL161891.1-201ENST00000621575 4636 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SHISA2Q6UWI4 LIX1-AS1-201ENST00000504578 1793 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SHISA2Q6UWI4 VCAM1-204ENST00000370119 2483 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SHISA2Q6UWI4 ZNF569-202ENST00000392149 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SHISA2Q6UWI4 CYFIP2-201ENST00000435847 3673 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SHISA2Q6UWI4 LINC01416-201ENST00000563553 2310 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SHISA2Q6UWI4 NLRC4-204ENST00000404025 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SHISA2Q6UWI4 EFTUD1P2-201ENST00000514817 1603 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SHISA2Q6UWI4 GPBP1-204ENST00000506184 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SHISA2Q6UWI4 AC004972.1-201ENST00000623934 2209 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SHISA2Q6UWI4 PRRC2C-201ENST00000338920 10355 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SHISA2Q6UWI4 SERPINA6-201ENST00000341584 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
SHISA2Q6UWI4 CDKL3-210ENST00000523832 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
SHISA2Q6UWI4 FOXM1-202ENST00000359843 3315 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
SHISA2Q6UWI4 NUDCD1-202ENST00000427660 2098 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
SHISA2Q6UWI4 TEX26-201ENST00000380473 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
SHISA2Q6UWI4 OPRM1-206ENST00000419506 1402 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
SHISA2Q6UWI4 DAAM1-201ENST00000360909 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
SHISA2Q6UWI4 AC109361.1-201ENST00000513220 3526 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SHISA2Q6UWI4 CA1-225ENST00000626824 2405 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
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