Protein–RNA interactions for Protein: Q53FE4

C4orf17, Uncharacterized protein C4orf17, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf17Q53FE4 AL121949.2-201ENST00000403446 1548 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
C4orf17Q53FE4 SCAPER-202ENST00000324767 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
C4orf17Q53FE4 CLEC4E-201ENST00000299663 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
C4orf17Q53FE4 SERPINB7-206ENST00000540675 2193 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
C4orf17Q53FE4 GCSAM-201ENST00000308910 3336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
C4orf17Q53FE4 LRRC37A12P-201ENST00000454917 1801 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
C4orf17Q53FE4 DEPDC1B-201ENST00000265036 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
C4orf17Q53FE4 CDKAL1-202ENST00000378610 3115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
C4orf17Q53FE4 GCNA-202ENST00000373696 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
C4orf17Q53FE4 TRIM6-202ENST00000380097 3403 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
C4orf17Q53FE4 GPR87-201ENST00000260843 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
C4orf17Q53FE4 IL1RAP-201ENST00000072516 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
C4orf17Q53FE4 PKIB-211ENST00000615438 1936 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
C4orf17Q53FE4 WNK3-201ENST00000354646 11341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
C4orf17Q53FE4 CD84-201ENST00000311224 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
C4orf17Q53FE4 COMMD6-201ENST00000355801 486 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
C4orf17Q53FE4 ZRSR2-202ENST00000380308 744 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
C4orf17Q53FE4 AC117470.1-201ENST00000381974 330 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
C4orf17Q53FE4 AL391419.1-201ENST00000398901 1275 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
C4orf17Q53FE4 SNRPD3-202ENST00000402849 567 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
C4orf17Q53FE4 Y_RNA.615-201ENST00000410769 117 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
C4orf17Q53FE4 FLJ27354-201ENST00000415584 788 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
C4orf17Q53FE4 AC026355.1-201ENST00000423466 587 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
C4orf17Q53FE4 VDAC1P2-201ENST00000423609 850 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
C4orf17Q53FE4 LINC00502-201ENST00000423621 445 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
C4orf17Q53FE4 ETDA-201ENST00000427686 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
C4orf17Q53FE4 RPS10P21-201ENST00000430654 475 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
C4orf17Q53FE4 RPL23AP30-201ENST00000432419 501 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
C4orf17Q53FE4 E2F3-IT1-201ENST00000433182 400 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
C4orf17Q53FE4 USP24P1-201ENST00000433802 779 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
C4orf17Q53FE4 ERLEC1P1-201ENST00000433806 578 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
C4orf17Q53FE4 AC245291.3-201ENST00000443400 292 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
C4orf17Q53FE4 AC004980.3-201ENST00000447046 365 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
C4orf17Q53FE4 SLC25A18P1-201ENST00000449385 454 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
C4orf17Q53FE4 CECR9-201ENST00000453421 199 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
C4orf17Q53FE4 AC091685.2-201ENST00000454924 864 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
C4orf17Q53FE4 AC098583.1-201ENST00000480875 255 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
C4orf17Q53FE4 EEF1A1P25-201ENST00000495704 1267 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
C4orf17Q53FE4 PTP4A1P4-201ENST00000512479 322 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
C4orf17Q53FE4 LINC02492-204ENST00000515660 584 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
C4orf17Q53FE4 RNA5SP518-201ENST00000515957 119 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
C4orf17Q53FE4 AC090572.1-201ENST00000519251 160 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
C4orf17Q53FE4 CARSP2-201ENST00000520688 277 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
C4orf17Q53FE4 AC009884.1-201ENST00000522670 545 ntTSL 4 BASIC6.55□□□□□ -1.36
C4orf17Q53FE4 SDHAF2-208ENST00000543265 438 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
C4orf17Q53FE4 HSPE1P3-201ENST00000559254 309 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
C4orf17Q53FE4 AC068722.1-202ENST00000559600 655 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
C4orf17Q53FE4 AC009145.3-201ENST00000567386 476 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
C4orf17Q53FE4 AC005324.5-201ENST00000584540 571 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
C4orf17Q53FE4 AC006967.3-201ENST00000594086 1093 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
C4orf17Q53FE4 AC004908.2-201ENST00000609090 574 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
C4orf17Q53FE4 AC092807.2-201ENST00000609367 243 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
C4orf17Q53FE4 uc_338.22-201ENST00000622722 187 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
C4orf17Q53FE4 AC091953.2-201ENST00000623979 160 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
C4orf17Q53FE4 AC068631.1-221ENST00000626006 592 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
C4orf17Q53FE4 GTF2E1-201ENST00000283875 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
C4orf17Q53FE4 GAPVD1-204ENST00000394083 4747 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
C4orf17Q53FE4 PSG9-204ENST00000418820 1748 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
C4orf17Q53FE4 AC016831.1-201ENST00000432045 6411 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
C4orf17Q53FE4 PLP1-220ENST00000612423 3132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
C4orf17Q53FE4 SLF1-201ENST00000265140 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
C4orf17Q53FE4 IL1RL1-203ENST00000404917 3571 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
C4orf17Q53FE4 MED12L-206ENST00000474524 10744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
C4orf17Q53FE4 NEUROD4-201ENST00000242994 3953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
C4orf17Q53FE4 PAPOLG-201ENST00000238714 4263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
C4orf17Q53FE4 GPR89A-203ENST00000462900 1527 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
C4orf17Q53FE4 AC053481.2-201ENST00000602493 1815 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
C4orf17Q53FE4 FKTN-202ENST00000357998 2404 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
C4orf17Q53FE4 APOL3-203ENST00000397287 3626 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
C4orf17Q53FE4 UNC5D-201ENST00000287272 8662 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
C4orf17Q53FE4 REST-201ENST00000309042 7300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
C4orf17Q53FE4 STK33-208ENST00000447869 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
C4orf17Q53FE4 GPM6A-202ENST00000393658 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
C4orf17Q53FE4 CHEK1-216ENST00000534070 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
C4orf17Q53FE4 AC107980.1-201ENST00000558671 3355 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
C4orf17Q53FE4 ZNF630-202ENST00000409324 2455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
C4orf17Q53FE4 AC091046.3-201ENST00000631455 1574 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
C4orf17Q53FE4 ACTG2-203ENST00000409731 1413 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
C4orf17Q53FE4 PPP6C-201ENST00000373547 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
C4orf17Q53FE4 LINC00184-201ENST00000429269 2270 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
C4orf17Q53FE4 A2M-201ENST00000318602 4844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
C4orf17Q53FE4 RPL23AP57-201ENST00000332361 466 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
C4orf17Q53FE4 IGLV3-12-201ENST00000390313 356 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
C4orf17Q53FE4 RNA5SP53-201ENST00000391299 120 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
C4orf17Q53FE4 AL133260.1-201ENST00000405720 405 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
C4orf17Q53FE4 AL603908.1-201ENST00000406098 201 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
C4orf17Q53FE4 GSTA10P-201ENST00000412182 576 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
C4orf17Q53FE4 AL691515.2-201ENST00000414765 466 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
C4orf17Q53FE4 AL138831.1-201ENST00000415144 209 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
C4orf17Q53FE4 AC073069.1-201ENST00000428657 441 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
C4orf17Q53FE4 RPL32-206ENST00000435983 620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
C4orf17Q53FE4 AL591719.2-201ENST00000437400 386 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
C4orf17Q53FE4 TUBB4BP6-201ENST00000437576 479 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
C4orf17Q53FE4 AL591501.1-201ENST00000439992 495 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
C4orf17Q53FE4 AC083855.1-201ENST00000440041 258 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
C4orf17Q53FE4 DARS-AS1-205ENST00000444649 558 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
C4orf17Q53FE4 AC095032.1-201ENST00000444810 527 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
C4orf17Q53FE4 DDX3P2-201ENST00000446138 111 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
C4orf17Q53FE4 AL445307.1-201ENST00000446476 602 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
C4orf17Q53FE4 AC239798.3-201ENST00000454459 408 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.2 ms