Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 MIR4420-201ENST00000583944 77 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 MIR4737-201ENST00000583979 81 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 AC005757.1-201ENST00000591432 472 ntTSL 4 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 ZNF92P3-201ENST00000596594 954 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 AL606834.3-201ENST00000602615 496 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 AC018754.1-201ENST00000607486 925 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 LINC02098-201ENST00000608492 475 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 EAF1-AS1-211ENST00000610011 316 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 AL050303.3-201ENST00000613704 284 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 AL138960.1-201ENST00000613838 513 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 uc_338.9-201ENST00000617424 182 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 FRG1HP-204ENST00000617940 757 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 AC079906.1-201ENST00000621214 815 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 AP002967.1-201ENST00000624203 539 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 SPTY2D1-AS1-204ENST00000634992 373 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 AC099654.2-201ENST00000433031 1980 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 MPDZ-204ENST00000381022 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 ZNF93-201ENST00000343769 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 PRUNE2-207ENST00000428286 12437 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 ZNF849P-201ENST00000594711 1566 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 OSGEPL1-201ENST00000264151 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 OPRM1-215ENST00000520708 1519 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 AC106754.1-201ENST00000562632 1513 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 SAMMSON-213ENST00000641336 1521 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 MBNL1-203ENST00000324196 5225 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 PALMD-201ENST00000263174 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 ATF7IP-214ENST00000540793 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 AC012618.3-205ENST00000637896 1496 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 MMRN1-201ENST00000264790 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 SDAD1P1-202ENST00000524156 2051 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 ZBTB21-201ENST00000310826 7449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 DNA2-201ENST00000358410 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 HEMGN-202ENST00000616898 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 CLUL1-213ENST00000620089 1947 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 SYCP1-209ENST00000613524 3034 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 CLEC4A-201ENST00000229332 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 CCNB3-202ENST00000348603 1201 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 RNU5B-1-201ENST00000363286 116 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 CCNB3-203ENST00000376038 1201 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 OR6C4-201ENST00000394256 1046 ntAPPRIS P1 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 VN1R51P-201ENST00000411675 945 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 RPL7P29-201ENST00000437151 728 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 ARL5AP2-201ENST00000444698 533 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 AL606517.1-201ENST00000446914 387 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 GJE1-201ENST00000450456 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 AC104164.3-201ENST00000467363 1258 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 SSR3-206ENST00000476217 807 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 RPS4XP6-201ENST00000477670 797 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 AC104119.1-201ENST00000508829 339 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 AL049544.1-201ENST00000511849 673 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 AC098976.1-201ENST00000513014 541 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 AC110760.3-202ENST00000515177 371 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 AC027701.1-201ENST00000520155 823 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 AC005740.3-201ENST00000520882 344 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 AC009563.1-202ENST00000523365 643 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 AC091163.1-201ENST00000524012 605 ntTSL 4 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 LINC02306-201ENST00000546412 529 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 LINC02156-201ENST00000552320 483 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 AC068714.1-201ENST00000559623 800 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 AC022929.1-201ENST00000560675 823 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 AC022884.2-201ENST00000578535 580 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 MIR3667-201ENST00000581025 74 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 AP002906.1-201ENST00000603405 233 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 AC034229.4-201ENST00000607861 441 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 USP32P2-207ENST00000608376 253 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 AC055764.2-201ENST00000610089 670 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 AC091046.2-201ENST00000620775 665 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 AC138907.10-201ENST00000623708 983 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 ERI2-202ENST00000357967 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 PLCH1-201ENST00000334686 6128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 RPGRIP1L-201ENST00000262135 8195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 NRG1-220ENST00000539990 2401 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 RFX4-201ENST00000229387 3378 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 IL13RA2-201ENST00000243213 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 BAALC-AS1-201ENST00000499522 1353 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 CTAGE5-207ENST00000396165 3071 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 SPART-202ENST00000438666 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 LINC02085-201ENST00000465215 2051 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 SAMMSON-226ENST00000642089 1582 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 VWC2L-202ENST00000427124 4480 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 GABRA2-202ENST00000381620 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 AC245407.1-201ENST00000621489 2538 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 KLHL13-203ENST00000371878 3234 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 MTRR-202ENST00000440940 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 Z94721.2-201ENST00000609590 5310 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 ERBIN-208ENST00000506030 4386 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 DCDC1-203ENST00000406071 4758 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 LMOD3-201ENST00000420581 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 OR4N5-201ENST00000333629 927 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 DNAJC12-202ENST00000339758 1064 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 RNU6-304P-201ENST00000364855 107 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 RPL23AP59-201ENST00000399415 461 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 AL603865.2-201ENST00000401679 213 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 IL6-206ENST00000407492 926 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 RNU6-584P-201ENST00000410350 95 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 AC009302.1-201ENST00000417147 390 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 AC087857.1-201ENST00000425894 467 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 OR5K2-201ENST00000427338 1060 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 AL450472.1-201ENST00000439434 405 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 AC004854.1-201ENST00000440356 349 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.7 ms