Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 STT3A-214ENST00000531491 2160 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 NAV3-202ENST00000536525 7386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 CFAP57-208ENST00000610710 4162 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 DOCK9-203ENST00000376460 7549 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 RAD51B-210ENST00000487270 2596 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 SMC1A-201ENST00000322213 9784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 DZIP3-201ENST00000361582 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 AL031651.1-201ENST00000615357 1438 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 CASC19-206ENST00000641028 1430 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 USP32-214ENST00000592339 4045 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 CSDE1-205ENST00000438362 4167 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 PIGN-220ENST00000638167 4195 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 LINC00707-201ENST00000436383 3070 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 MTND5P1-201ENST00000445440 1375 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 LDAH-212ENST00000619656 3663 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 GCSAML-210ENST00000536561 4063 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC6.82□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 AC093010.2-202ENST00000493033 3023 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 LINC00284-201ENST00000423211 3208 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 CARF-212ENST00000434998 1955 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 AC113146.2-201ENST00000560743 1961 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 NFATC3-201ENST00000329524 6144 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 CDC7-201ENST00000234626 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 BRIP1-201ENST00000259008 6048 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 CNTD1-205ENST00000588527 1308 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 SLC10A7-202ENST00000394059 1730 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 CCDC26-201ENST00000446592 1721 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 TMEM167B-201ENST00000338272 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 LARP1B-201ENST00000326639 4891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 OR2T7-201ENST00000641057 3463 ntAPPRIS P1 BASIC6.82□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 AC016251.2-201ENST00000623393 3089 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 LGALS13-201ENST00000221797 602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 CD84-201ENST00000311224 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 TMSB4XP2-201ENST00000335179 210 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 PAGE2-202ENST00000374968 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 RNU6-877P-201ENST00000383868 107 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 KRTAP3-2-201ENST00000391587 702 ntAPPRIS P1 BASIC6.82□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 AL354733.1-204ENST00000412069 424 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 RPL17P12-201ENST00000413391 526 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 AIMP1P1-201ENST00000418670 937 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 CYP4F30P-202ENST00000420048 405 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 AL136131.2-201ENST00000424283 348 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 AL365184.2-201ENST00000431139 435 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 AL807757.1-201ENST00000437846 424 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 AL035530.1-201ENST00000446887 331 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 PPIAP20-201ENST00000449839 135 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 BX842559.2-201ENST00000451418 605 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 AC022364.2-201ENST00000457963 554 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 EIF3LP3-201ENST00000495197 822 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 SRP72-202ENST00000504757 745 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 AC017037.1-201ENST00000508460 471 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 LINC02118-202ENST00000510583 419 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 AC131956.2-201ENST00000510922 512 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 AC040970.1-202ENST00000517908 505 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 HMMR-AS1-202ENST00000521666 800 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 MTND1P35-201ENST00000526739 508 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 ANKRD49-206ENST00000540349 573 ntTSL 4 BASIC6.82□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 SLC7A7-210ENST00000554517 1158 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 FLVCR2-207ENST00000555027 938 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 AL132800.1-201ENST00000555109 698 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 AC009754.1-201ENST00000566282 540 ntTSL 4 BASIC6.82□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 AC009097.1-201ENST00000567077 406 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 AC026471.4-201ENST00000569291 449 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 U95743.1-201ENST00000573369 1001 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 THCAT158-201ENST00000575039 535 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 AC130371.1-201ENST00000577023 230 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 AC090403.1-205ENST00000580883 516 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 AC011476.3-202ENST00000586845 553 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 AP001542.2-201ENST00000593141 364 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 AC020765.1-201ENST00000604296 328 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 AC138035.1-202ENST00000604669 683 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 AL035413.2-201ENST00000604801 525 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 AL355802.3-201ENST00000607571 545 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 SSX4B-202ENST00000619890 1092 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 SSX4-202ENST00000620320 1092 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 AL136228.1-201ENST00000622221 319 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 MIR1321-201ENST00000637766 79 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 ZNF571-202ENST00000358744 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 LRRTM4-205ENST00000409911 2976 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 ADA2-210ENST00000610390 4137 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 ADAM20-201ENST00000256389 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 CREM-203ENST00000344351 1625 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 NUMB-201ENST00000355058 3342 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 NCOA2-201ENST00000452400 8447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 PARP4P1-201ENST00000435945 2337 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 NBPF14-209ENST00000620240 2656 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 LINGO2-202ENST00000379992 3044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 ZNF630-202ENST00000409324 2455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 DDAH1-204ENST00000535924 3909 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 AC010531.4-202ENST00000569872 1718 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 AC078880.4-201ENST00000617627 1749 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 LINC01415-201ENST00000587320 4071 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 ZNF19-206ENST00000565100 2087 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 WDR35-201ENST00000281405 6918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 AC092821.3-202ENST00000641304 2767 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 ZNF605-204ENST00000392321 6156 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 TAS2R14-202ENST00000537503 1858 ntAPPRIS P1 BASIC6.81□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 CTDSPL2-204ENST00000558966 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 AC104024.1-201ENST00000428142 2201 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 ATP5A1P1-201ENST00000454088 1321 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
GRIK4Q16099 CENPJ-206ENST00000616936 5020 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.4 ms