Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 GCSAML-203ENST00000366491 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 CTSS-201ENST00000368985 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 DCLRE1A-201ENST00000361384 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 TM4SF18-201ENST00000296059 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 NUDCD1-202ENST00000427660 2098 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 MS4A14-203ENST00000395005 2813 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 FAM72B-201ENST00000355228 1773 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 GYPE-201ENST00000358615 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 PTP4A1-205ENST00000626021 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 LINC01020-202ENST00000508201 1800 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 CRYAB-201ENST00000227251 848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 RAET1L-202ENST00000367341 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 ASXL1-203ENST00000375689 812 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 RNU6-98P-201ENST00000384173 107 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 DHFRP5-201ENST00000406944 564 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 MIR1303-201ENST00000408625 86 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 RNA5SP345-201ENST00000410646 108 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 IQCA1-AS1-201ENST00000413353 489 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 CFLAR-AS1-201ENST00000415011 1072 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 GPC5-AS2-201ENST00000417589 401 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 AC106900.1-201ENST00000418620 456 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 MTCO3P4-201ENST00000419236 787 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 AL691447.1-201ENST00000419456 387 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 MTND2P16-201ENST00000419987 799 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 OR2AM1P-201ENST00000422137 422 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 AC007161.1-204ENST00000423039 460 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 TTC3-AS1-201ENST00000424733 1097 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 AC091493.1-201ENST00000426218 411 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 MTCO1P43-201ENST00000431831 488 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 REG1CP-203ENST00000434852 460 ntTSL 4 BASIC3.43□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 HLA-N-201ENST00000437516 135 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 AC006994.1-201ENST00000438212 839 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 AC096639.1-201ENST00000456240 347 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 AC092754.1-201ENST00000472975 479 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 RPS18P6-201ENST00000476880 458 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 RPL32P33-201ENST00000487023 394 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 LINC01596-201ENST00000503609 592 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 LINC02114-201ENST00000503757 801 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 C8orf44-205ENST00000521889 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 COX6B1P6-201ENST00000522347 255 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 AP000620.1-201ENST00000527147 504 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 AP006287.2-201ENST00000529036 502 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 AC055720.1-201ENST00000539552 475 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 LINC02406-201ENST00000553029 546 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 GPATCH2L-203ENST00000553588 776 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 ZNF192P1-203ENST00000565888 810 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 RN7SL708P-201ENST00000580952 299 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 MYLK-221ENST00000583087 678 ntTSL 4 BASIC3.43□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 AC008759.1-201ENST00000589783 983 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 AC022916.2-201ENST00000590144 559 ntTSL 4 BASIC3.43□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 AC011516.1-201ENST00000599129 180 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 SMIM12P1-201ENST00000603004 274 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 AC009597.2-201ENST00000604659 592 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 AC247036.1-201ENST00000605005 389 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 AC006946.3-201ENST00000609791 756 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 RDM1-215ENST00000612980 501 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 C8orf59-213ENST00000619594 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 AC015804.1-201ENST00000622935 435 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 LINC00976-201ENST00000625513 783 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 LINC00506-201ENST00000628435 525 ntTSL 4 BASIC3.43□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 ASB8-218ENST00000629941 278 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 AP002008.2-205ENST00000637111 1091 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 OR8A1-204ENST00000642111 1145 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 FAM169A-203ENST00000510496 5810 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 MUM1L1-202ENST00000357175 4173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 CYP3A7-CYP3A51P-201ENST00000611620 1608 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 AGTR2-201ENST00000371906 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 AC068446.1-201ENST00000556425 1549 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 C1orf112-202ENST00000359326 4002 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 SAMSN1-203ENST00000400566 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 RXFP1-204ENST00000423548 3930 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 AC000367.1-201ENST00000452711 1766 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 AC109780.1-201ENST00000451768 1344 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 FAM35DP-201ENST00000323387 2712 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 ELAVL2-202ENST00000380110 3691 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 RAB3C-201ENST00000282878 8896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 LGI1-228ENST00000637689 1802 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 AIG1-208ENST00000494282 3393 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 BLM-208ENST00000560509 3966 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 DAZ1-205ENST00000540248 3268 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 DGKH-201ENST00000261491 17261 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 SSX3-201ENST00000298396 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 RNU6-600P-201ENST00000362524 99 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 RN7SKP6-201ENST00000364795 319 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 MIR142-201ENST00000384835 87 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 TRAV36DV7-201ENST00000390463 356 ntAPPRIS P1 BASIC3.42□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 RNU2-65P-201ENST00000410162 185 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 RNU2-21P-201ENST00000410368 188 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 EEF1B2P8-201ENST00000414101 671 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 PPIAP23-201ENST00000420099 497 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 AC006509.1-201ENST00000420788 634 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 COX6CP13-201ENST00000428703 226 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 AC009238.2-201ENST00000431026 355 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 RPL37P1-201ENST00000432310 284 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 NEK4P1-201ENST00000433383 879 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 FTH1P16-201ENST00000435241 552 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 HMGB1P45-201ENST00000435986 653 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 RPL23AP19-201ENST00000436229 369 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 AC004938.1-201ENST00000438468 308 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 AL353662.1-201ENST00000439099 327 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
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