Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 TRIM55-203ENST00000350034 1177 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 RNU6-433P-201ENST00000363216 104 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 SPRR2B-201ENST00000368755 617 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 ANP32E-202ENST00000369115 708 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 RABGGTB-202ENST00000370826 512 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 DAOA-202ENST00000375936 742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 SNORA51.12-201ENST00000384448 134 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 IGLV5-48-201ENST00000390293 369 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 AL589647.1-201ENST00000402485 466 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 BTF3P7-201ENST00000407097 488 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 AC107079.1-201ENST00000416509 669 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 LINC00993-201ENST00000420453 540 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 HRH4-202ENST00000426880 909 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 Z82246.1-201ENST00000428201 457 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 PPIAP10-201ENST00000438675 458 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 AL772161.1-201ENST00000439130 476 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 AC005487.1-201ENST00000440208 665 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 CCDC17-203ENST00000445048 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 AC006458.1-201ENST00000445093 653 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 EEF1B2P6-201ENST00000445713 673 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 BZW1P1-201ENST00000454901 1240 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 AC108161.1-201ENST00000461060 402 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 AL122020.1-201ENST00000472287 459 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 SUMO2P4-201ENST00000504193 276 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 MYLK-AS2-202ENST00000515464 754 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 RNA5SP228-201ENST00000516232 133 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 AC008662.1-201ENST00000521805 674 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 AF181450.1-201ENST00000522980 410 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 SLC2A13P1-201ENST00000531560 322 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 AP002765.2-201ENST00000532961 666 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 AP002754.2-201ENST00000542121 462 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 DCN-209ENST00000546745 1026 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 AL049875.1-202ENST00000556620 857 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 LINC01584-203ENST00000567231 646 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 MIR3691-201ENST00000578066 90 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 KPNA2P3-201ENST00000584190 848 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 AC010463.3-201ENST00000594077 500 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 ZNF788-206ENST00000596883 692 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 Z98949.1-203ENST00000597284 851 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 AC005084.1-201ENST00000605160 304 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 RPL12P48-201ENST00000605620 304 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 AC090517.2-201ENST00000614966 680 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 C8orf59-212ENST00000615697 483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 AP000550.3-201ENST00000637734 379 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 AC104837.1-201ENST00000444644 1587 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 IL31RA-201ENST00000297015 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 CYP3A5-201ENST00000222982 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 STK33-208ENST00000447869 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 CLRN1-AS1-201ENST00000465576 2045 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 PLCE1-201ENST00000371375 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 CLTC-210ENST00000579456 2301 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 AC001226.2-204ENST00000638101 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 MYCT1-201ENST00000367245 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 PATL1-201ENST00000300146 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 MTND5P26-201ENST00000426018 1752 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 GPN1-205ENST00000458167 1618 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 PRLR-203ENST00000348262 1339 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 LINC01440-201ENST00000416190 1340 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 METTL15-201ENST00000303459 4068 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 ECHDC1-210ENST00000454859 2341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 AC022325.1-201ENST00000502748 2199 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 RFX3-212ENST00000617270 9253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 LRRC37B-203ENST00000394713 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 CLEC12B-202ENST00000396502 3029 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 SMARCA2-206ENST00000382185 1584 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 AC015871.3-201ENST00000618835 2261 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 WFDC8-202ENST00000357199 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 DEC1-201ENST00000374016 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 AL645927.1-201ENST00000396783 406 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 RPL36P18-201ENST00000419316 318 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 LINC00310-202ENST00000419881 910 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 AL389915.1-201ENST00000422463 466 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 AL590762.4-201ENST00000425885 253 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 AC245884.2-201ENST00000426257 404 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 CYP4F32P-201ENST00000426492 504 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 AL591475.1-201ENST00000429060 489 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 AC137630.2-202ENST00000429681 555 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 MTND3P21-201ENST00000433774 331 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 AC017074.2-201ENST00000439382 607 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 AC122718.1-201ENST00000439448 744 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 AC017006.2-201ENST00000444077 464 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 AC092155.1-201ENST00000444672 573 ntTSL 4 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 VN1R10P-201ENST00000447106 875 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 RPS27AP15-201ENST00000447672 466 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 AC003071.1-201ENST00000451219 789 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 AC131571.1-202ENST00000454509 598 ntTSL 4 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 FAM133DP-201ENST00000464802 691 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 RPL23AP64-201ENST00000469465 435 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 AC092865.4-201ENST00000477936 615 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 RN7SL727P-201ENST00000482164 296 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 RN7SL30P-201ENST00000488416 306 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 RN7SL808P-201ENST00000496066 299 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 AC110716.1-201ENST00000506934 607 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 AC026434.1-201ENST00000511474 454 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 OR52B2-201ENST00000530810 1079 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 AC138207.6-203ENST00000581652 565 ntTSL 4 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 CT45A1-202ENST00000594565 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 AL024498.1-201ENST00000606522 1100 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 AL445222.1-201ENST00000607259 628 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CCDC85BQ15834 RPSAP73-201ENST00000614820 330 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
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