Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 ZRANB2-AS2-201ENST00000411721 518 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
CBFBQ13951 AL669831.5-220ENST00000412115 581 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
CBFBQ13951 AC096669.1-202ENST00000413708 616 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
CBFBQ13951 AC013401.1-202ENST00000422017 626 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
CBFBQ13951 LINC02238-201ENST00000424953 557 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
CBFBQ13951 AP001324.1-201ENST00000428553 399 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CBFBQ13951 AL122010.1-201ENST00000429293 720 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
CBFBQ13951 AL353693.1-201ENST00000429567 442 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
CBFBQ13951 RPS6P15-201ENST00000431996 751 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CBFBQ13951 RPL12P17-201ENST00000432393 498 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CBFBQ13951 AC003001.1-201ENST00000443247 1135 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
CBFBQ13951 CASP12-206ENST00000446862 1196 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CBFBQ13951 AC073909.1-201ENST00000447112 999 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CBFBQ13951 LINC01344-202ENST00000449842 571 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
CBFBQ13951 SNAP25-AS1-204ENST00000451151 867 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
CBFBQ13951 MRPL42P4-201ENST00000453267 443 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CBFBQ13951 LINC01436-201ENST00000457157 1048 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
CBFBQ13951 TRAPPC2-204ENST00000458511 678 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
CBFBQ13951 RN7SL51P-201ENST00000468230 285 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CBFBQ13951 AC092957.1-201ENST00000473299 570 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
CBFBQ13951 AC117394.1-201ENST00000477323 567 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CBFBQ13951 AC112204.2-201ENST00000503269 374 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
CBFBQ13951 AC104137.1-201ENST00000503625 385 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
CBFBQ13951 AC104071.1-201ENST00000505636 602 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
CBFBQ13951 AC113347.3-201ENST00000509113 148 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CBFBQ13951 MTND6P2-201ENST00000512226 524 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CBFBQ13951 AC009623.1-201ENST00000517964 1131 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
CBFBQ13951 AC062004.1-202ENST00000524014 246 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
CBFBQ13951 OPRM1-223ENST00000524163 1251 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CBFBQ13951 AC087623.1-201ENST00000533301 377 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
CBFBQ13951 AC027544.3-201ENST00000535082 757 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CBFBQ13951 EMP1-206ENST00000537612 505 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
CBFBQ13951 AC130404.1-201ENST00000539362 739 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
CBFBQ13951 MIR4307HG-201ENST00000548170 822 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
CBFBQ13951 NELL2-211ENST00000548826 559 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
CBFBQ13951 AC039056.1-201ENST00000552704 467 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
CBFBQ13951 AC022404.1-201ENST00000555320 273 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CBFBQ13951 LINC02311-201ENST00000556144 383 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
CBFBQ13951 AADACP1-206ENST00000561502 1193 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CBFBQ13951 AC015720.2-201ENST00000567709 334 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CBFBQ13951 MIR1273E-201ENST00000581165 102 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CBFBQ13951 AC104996.1-201ENST00000583250 591 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
CBFBQ13951 AP005242.1-201ENST00000583946 467 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
CBFBQ13951 AC068408.2-201ENST00000584566 439 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
CBFBQ13951 LINC01899-203ENST00000584810 337 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
CBFBQ13951 AC011990.1-201ENST00000592809 734 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
CBFBQ13951 Z98949.1-203ENST00000597284 851 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
CBFBQ13951 ELSPBP1-205ENST00000597519 557 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
CBFBQ13951 ERVK-28-203ENST00000600419 457 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CBFBQ13951 AC024075.3-201ENST00000601687 453 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
CBFBQ13951 XIST-210ENST00000602863 775 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
CBFBQ13951 AC011453.2-201ENST00000603737 729 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CBFBQ13951 AC114878.2-201ENST00000604863 1251 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CBFBQ13951 AL160400.1-201ENST00000606385 1030 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CBFBQ13951 AC105402.3-203ENST00000608822 885 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
CBFBQ13951 TUSC7.1-201ENST00000610969 165 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CBFBQ13951 AC132068.1-201ENST00000623805 459 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CBFBQ13951 AC009303.2-205ENST00000627670 1091 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
CBFBQ13951 SNORA17.5-201ENST00000630429 132 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CBFBQ13951 AL136084.2-203ENST00000630758 690 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
CBFBQ13951 CCDC195-201ENST00000638102 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
CBFBQ13951 RNF20-202ENST00000389120 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CBFBQ13951 MAP9-208ENST00000515654 2044 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
CBFBQ13951 AL078621.3-201ENST00000623707 2042 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CBFBQ13951 ZNF283-201ENST00000324461 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CBFBQ13951 OR2J3-202ENST00000641151 3297 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
CBFBQ13951 AP001605.1-201ENST00000420186 2603 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CBFBQ13951 AC006206.1-201ENST00000544842 3387 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CBFBQ13951 ZNF410-211ENST00000555044 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CBFBQ13951 DDX18P4-201ENST00000511690 1966 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CBFBQ13951 ADAM18-202ENST00000379866 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CBFBQ13951 DDX3Y-201ENST00000336079 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CBFBQ13951 OR9K1P-202ENST00000641111 3217 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CBFBQ13951 OR8A1-203ENST00000641670 5709 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CBFBQ13951 PTBP3-207ENST00000458258 7995 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CBFBQ13951 RNF133-201ENST00000340112 1445 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CBFBQ13951 FOXN2-203ENST00000616844 1414 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CBFBQ13951 NKAIN2-204ENST00000545433 3052 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CBFBQ13951 LMO3-209ENST00000447609 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CBFBQ13951 HELLS-204ENST00000371332 2675 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CBFBQ13951 RNA5SP319-201ENST00000362768 119 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CBFBQ13951 PAGE2-202ENST00000374968 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CBFBQ13951 RNU6-317P-201ENST00000384031 107 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CBFBQ13951 SFR1P1-201ENST00000403720 688 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CBFBQ13951 FCF1P5-201ENST00000406490 482 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CBFBQ13951 RN7SKP59-201ENST00000410520 314 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CBFBQ13951 EFCAB14-AS1-201ENST00000418985 491 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CBFBQ13951 AC092634.4-201ENST00000419937 423 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CBFBQ13951 GAPDHP49-201ENST00000421421 961 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CBFBQ13951 LINC01690-201ENST00000424837 576 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CBFBQ13951 NANOGP4-201ENST00000427230 913 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CBFBQ13951 AC104843.2-201ENST00000427666 297 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CBFBQ13951 TXNDC12-AS1-201ENST00000428794 391 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CBFBQ13951 NDUFB4P8-201ENST00000435351 367 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CBFBQ13951 CBX1P4-201ENST00000439415 457 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CBFBQ13951 AC019185.1-201ENST00000442718 389 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CBFBQ13951 RNF219-AS1-202ENST00000444769 590 ntTSL 4 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CBFBQ13951 YWHAQP9-201ENST00000445891 512 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CBFBQ13951 AL158210.1-201ENST00000448835 500 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CBFBQ13951 SRGAP3-AS4-201ENST00000449023 377 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.3 ms