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| RUNX3 | Q13761 | RN7SL176P-201 | ENST00000580352 | 264 nt | BASIC | 4.59 | □□□□□ -1.67 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ADAD1P2-201 | ENST00000588476 | 646 nt | BASIC | 4.59 | □□□□□ -1.67 | | |
| RUNX3 | Q13761 | TTN-AS1-237 | ENST00000590743 | 812 nt | TSL 5 BASIC | 4.59 | □□□□□ -1.67 | | |
| RUNX3 | Q13761 | VN1R81P-201 | ENST00000602085 | 372 nt | BASIC | 4.59 | □□□□□ -1.67 | | |
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| RUNX3 | Q13761 | AP002370.2-203 | ENST00000533101 | 576 nt | TSL 4 BASIC | 4.58 | □□□□□ -1.68 | | |
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| RUNX3 | Q13761 | AL050403.2-203 | ENST00000603180 | 558 nt | TSL 4 BASIC | 4.58 | □□□□□ -1.68 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC007620.3-201 | ENST00000608131 | 497 nt | BASIC | 4.58 | □□□□□ -1.68 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL356056.1-205 | ENST00000608904 | 651 nt | TSL 5 BASIC | 4.58 | □□□□□ -1.68 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC003001.2-201 | ENST00000616294 | 831 nt | BASIC | 4.58 | □□□□□ -1.68 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AP003497.2-201 | ENST00000624220 | 967 nt | BASIC | 4.58 | □□□□□ -1.68 | | |
| RUNX3 | Q13761 | GHR-210 | ENST00000615111 | 4814 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 4.58 | □□□□□ -1.68 | | |
| RUNX3 | Q13761 | GABRA2-211 | ENST00000514090 | 3401 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 4.58 | □□□□□ -1.68 | | |
| RUNX3 | Q13761 | PEAK1-204 | ENST00000560626 | 19217 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 4.58 | □□□□□ -1.68 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ADAMDEC1-204 | ENST00000522298 | 2044 nt | APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC | 4.58 | □□□□□ -1.68 | | |
| RUNX3 | Q13761 | OR2L13-201 | ENST00000358120 | 1942 nt | APPRIS P1 BASIC | 4.58 | □□□□□ -1.68 | | |
| RUNX3 | Q13761 | OBSCN-210 | ENST00000570156 | 26925 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 4.58 | □□□□□ -1.68 | | |
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| RUNX3 | Q13761 | IQCM-205 | ENST00000636414 | 1844 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 4.58 | □□□□□ -1.68 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL355852.1-201 | ENST00000454081 | 1771 nt | BASIC | 4.58 | □□□□□ -1.68 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MUC12-202 | ENST00000379442 | 16737 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 4.58 | □□□□□ -1.68 | | |
| RUNX3 | Q13761 | GYPA-212 | ENST00000616983 | 2538 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 4.57 | □□□□□ -1.68 | | |
| RUNX3 | Q13761 | CDY11P-201 | ENST00000447168 | 1651 nt | BASIC | 4.57 | □□□□□ -1.68 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ADGRG4-202 | ENST00000394141 | 8971 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 4.57 | □□□□□ -1.68 | | |
| RUNX3 | Q13761 | NBPF10-201 | ENST00000583866 | 13042 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 4.57 | □□□□□ -1.68 | | |
| RUNX3 | Q13761 | PRKACB-202 | ENST00000370682 | 4288 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.57 | □□□□□ -1.68 | | |
| RUNX3 | Q13761 | DDX4-211 | ENST00000511853 | 1984 nt | TSL 2 BASIC | 4.57 | □□□□□ -1.68 | | |
| RUNX3 | Q13761 | C2orf76-201 | ENST00000334816 | 676 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.57 | □□□□□ -1.68 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MIR3065-201 | ENST00000390137 | 79 nt | BASIC | 4.57 | □□□□□ -1.68 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL607077.1-201 | ENST00000401718 | 499 nt | BASIC | 4.57 | □□□□□ -1.68 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SNORA11F-201 | ENST00000408237 | 128 nt | BASIC | 4.57 | □□□□□ -1.68 | | |
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| RUNX3 | Q13761 | AL391427.1-201 | ENST00000451575 | 425 nt | TSL 3 BASIC | 4.57 | □□□□□ -1.68 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RPS27AP17-201 | ENST00000463344 | 455 nt | BASIC | 4.57 | □□□□□ -1.68 | | |
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| RUNX3 | Q13761 | AC117430.1-201 | ENST00000474711 | 801 nt | TSL 5 BASIC | 4.57 | □□□□□ -1.68 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC090753.1-201 | ENST00000522087 | 331 nt | TSL 3 BASIC | 4.57 | □□□□□ -1.68 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AF117829.1-202 | ENST00000524166 | 836 nt | TSL 3 BASIC | 4.57 | □□□□□ -1.68 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC007496.1-201 | ENST00000565641 | 739 nt | TSL 3 BASIC | 4.57 | □□□□□ -1.68 | | |
| RUNX3 | Q13761 | BPIFA4P-203 | ENST00000603168 | 689 nt | BASIC | 4.57 | □□□□□ -1.68 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AP000569.1-201 | ENST00000607953 | 591 nt | TSL 2 BASIC | 4.57 | □□□□□ -1.68 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL162574.2-201 | ENST00000614618 | 657 nt | BASIC | 4.57 | □□□□□ -1.68 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LRRC2-AS1-202 | ENST00000614743 | 633 nt | TSL 3 BASIC | 4.57 | □□□□□ -1.68 | | |
| RUNX3 | Q13761 | DARS-AS1-225 | ENST00000615163 | 824 nt | TSL 5 BASIC | 4.57 | □□□□□ -1.68 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC073592.7-201 | ENST00000623659 | 507 nt | BASIC | 4.57 | □□□□□ -1.68 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC103798.2-201 | ENST00000624292 | 632 nt | BASIC | 4.57 | □□□□□ -1.68 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ARHGAP42P3-201 | ENST00000443989 | 2508 nt | BASIC | 4.57 | □□□□□ -1.68 | | |
| RUNX3 | Q13761 | PCDH9-201 | ENST00000377861 | 28227 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.57 | □□□□□ -1.68 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LGI1-202 | ENST00000371418 | 2381 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.57 | □□□□□ -1.68 | | |
| RUNX3 | Q13761 | TPTE2-205 | ENST00000400230 | 1793 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 4.57 | □□□□□ -1.68 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MAPK10-208 | ENST00000395169 | 4049 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.57 | □□□□□ -1.68 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ZNF283-201 | ENST00000324461 | 2297 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.57 | □□□□□ -1.68 | | |