Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 STPG2-AS1-201ENST00000508933 537 ntTSL 4 BASIC4.77□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 AP001992.1-204ENST00000525104 687 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 AC022832.1-201ENST00000530718 645 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 AC092490.3-201ENST00000545370 572 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 AC069240.1-201ENST00000548774 375 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 LINC02394-201ENST00000549140 543 ntTSL 4 BASIC4.77□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 TVP23CP2-201ENST00000571473 623 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 Z98949.1-202ENST00000600211 1282 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 AL139395.1-201ENST00000603662 160 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 TEX41-254ENST00000626394 423 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 CAPZA2-215ENST00000639546 129 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 TLR3-201ENST00000296795 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 RGS21-201ENST00000417209 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 AC025125.1-201ENST00000624743 1922 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 ARAP2-210ENST00000618163 2592 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 AL031320.2-201ENST00000591892 2079 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 PIGN-242ENST00000640145 4505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 SEC31A-237ENST00000513858 3687 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 AC079062.1-203ENST00000581862 3610 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 R3HCC1L-205ENST00000612478 3337 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 OR9Q2-202ENST00000641291 3774 ntAPPRIS P1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 CRISP1-202ENST00000335847 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 NR5A2-201ENST00000236914 3115 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 RNA5SP455-201ENST00000365190 119 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 C1orf194-203ENST00000369948 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 RNU6-167P-201ENST00000384292 106 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 AL021331.1-201ENST00000402817 582 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 R3HDM1-203ENST00000409606 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 AC073333.1-201ENST00000418907 648 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 VN1R37P-201ENST00000419096 748 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 AC079355.1-201ENST00000421770 223 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 LINC01074-201ENST00000422527 555 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 NPM1P24-201ENST00000428039 894 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 MARK2P15-201ENST00000432204 2186 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 TRAPPC2P9-201ENST00000434556 343 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 AC104781.1-201ENST00000449838 397 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 RN7SL222P-201ENST00000476452 299 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 EPDR1-204ENST00000476620 555 ntTSL 4 BASIC4.76□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 AC087071.2-201ENST00000483283 575 ntTSL 4 BASIC4.76□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 AC104071.1-201ENST00000505636 602 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 AC112198.3-201ENST00000505950 441 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 AC010445.1-201ENST00000507674 440 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 RNA5SP43-201ENST00000516559 110 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 AC006511.5-202ENST00000546339 1198 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 TEX49-202ENST00000548380 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 CBX3P5-201ENST00000552017 521 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 AL161713.1-201ENST00000555538 145 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 AC015912.2-201ENST00000571053 181 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 MIR3176-201ENST00000582210 90 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 AC007952.9-201ENST00000584365 191 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 RPL38-208ENST00000584577 344 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 AL713922.2-201ENST00000619384 716 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 ST6GALNAC3-203ENST00000621530 617 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 C2orf27A-204ENST00000623058 969 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 AC243960.7-201ENST00000623532 707 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 MFSD8-220ENST00000641243 1422 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 CSRNP3-202ENST00000342316 11684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 OR10D3-202ENST00000641351 3561 ntAPPRIS P1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 VDAC3-201ENST00000022615 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 POSTN-201ENST00000379742 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 USP26-201ENST00000370832 3642 ntAPPRIS P1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 AC106871.1-201ENST00000568324 3102 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 ZNF208-207ENST00000609966 3653 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 SLC25A17-202ENST00000402844 2405 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 SYTL2-217ENST00000528231 3536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 MMRN1-204ENST00000508372 3234 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 OR2M7-201ENST00000317965 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 OR5K4-201ENST00000354924 966 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 RHOT1P2-201ENST00000366423 333 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 FAM26F-203ENST00000368606 546 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 MIR513A2-201ENST00000385249 127 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 TRGV8-201ENST00000390343 468 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 AL645733.1-201ENST00000402250 217 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 ARL4AP5-201ENST00000404372 599 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 C2orf73-203ENST00000405749 576 ntTSL 4 BASIC4.75□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 AMZ2P2-201ENST00000406819 1057 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 GNRH1-202ENST00000421054 470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 CNOT7P2-201ENST00000441051 832 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 AL137845.2-201ENST00000444292 988 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 AP001434.1-201ENST00000444977 287 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 AL122008.1-201ENST00000456078 452 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 PSMC1P13-201ENST00000458195 985 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 APOA2-207ENST00000470459 416 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 OR52A4P-201ENST00000472867 958 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 RN7SL319P-201ENST00000480656 221 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 AC005912.1-201ENST00000495392 255 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 RNU6-319P-201ENST00000516025 108 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 RNU6-709P-201ENST00000517257 104 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 AC062004.1-201ENST00000518706 686 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 AP003059.1-201ENST00000526206 432 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 GMDS-AS1-212ENST00000534160 720 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 CACNA1C-IT1-201ENST00000542984 687 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 AC138360.1-201ENST00000552332 386 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 OR11J2P-201ENST00000555298 907 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 AC005324.5-201ENST00000584540 571 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 ZNF561-AS1-207ENST00000591932 676 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 AC010857.1-201ENST00000606398 594 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 AC100847.1-201ENST00000611316 481 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 AL353726.1-201ENST00000614041 1000 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
IFT88Q13099 AC022467.1-201ENST00000614738 749 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
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