Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 RGS4-204ENST00000421743 3311 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
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FOXC1Q12948 CYB5D1-201ENST00000332439 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
FOXC1Q12948 ATF3-201ENST00000336937 482 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
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FOXC1Q12948 RNU6-1081P-201ENST00000384537 107 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
FOXC1Q12948 RNU6-1093P-201ENST00000391194 107 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
FOXC1Q12948 RNU6-903P-201ENST00000391270 109 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
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FOXC1Q12948 AC093579.1-201ENST00000439455 352 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
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FOXC1Q12948 AC011891.2-201ENST00000604949 397 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
FOXC1Q12948 AL136097.3-201ENST00000611097 505 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
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FOXC1Q12948 AC127459.3-201ENST00000624328 466 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
FOXC1Q12948 AC111152.1-202ENST00000635848 339 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
FOXC1Q12948 ATXN2-202ENST00000389153 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
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FOXC1Q12948 RBFOX2-205ENST00000405409 6932 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
FOXC1Q12948 CNTN4-AS1-201ENST00000442749 1640 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
FOXC1Q12948 AL355377.1-201ENST00000621125 1653 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
FOXC1Q12948 TRDN-206ENST00000628709 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
FOXC1Q12948 FBXO7-202ENST00000397426 1888 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
FOXC1Q12948 C17orf78-204ENST00000615133 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
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FOXC1Q12948 AL954650.1-201ENST00000430776 2051 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
FOXC1Q12948 GPRIN3-201ENST00000333209 6260 ntAPPRIS P1 BASIC6.89□□□□□ -1.31
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FOXC1Q12948 NCKAP5-204ENST00000409213 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
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FOXC1Q12948 AC097634.1-201ENST00000604491 2467 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
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FOXC1Q12948 PROX2-202ENST00000556489 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
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FOXC1Q12948 Y_RNA.222-201ENST00000364264 102 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
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FOXC1Q12948 RNU6-740P-201ENST00000364734 105 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
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FOXC1Q12948 RNA5SP279-201ENST00000365513 117 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
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FOXC1Q12948 AL359715.1-201ENST00000404330 555 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
FOXC1Q12948 AL606923.1-201ENST00000406616 190 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
FOXC1Q12948 Z85994.1-201ENST00000406912 606 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
FOXC1Q12948 RNA5SP431-201ENST00000410312 120 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
FOXC1Q12948 AL356277.2-201ENST00000421318 441 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
FOXC1Q12948 AC092832.1-201ENST00000422934 400 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
FOXC1Q12948 AC005019.1-201ENST00000436455 431 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
FOXC1Q12948 AL138799.3-201ENST00000438968 350 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
FOXC1Q12948 LINC01307-201ENST00000439146 474 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
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FOXC1Q12948 OR13K1P-201ENST00000444577 975 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
FOXC1Q12948 LINC01038-201ENST00000457858 428 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
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FOXC1Q12948 AC104687.1-201ENST00000485829 412 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
FOXC1Q12948 AC016746.1-201ENST00000489557 831 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
FOXC1Q12948 AC112484.3-201ENST00000505910 329 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
FOXC1Q12948 RNU6-256P-201ENST00000516747 97 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
FOXC1Q12948 IGHV3-76-201ENST00000522465 295 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
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