Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 MTND6P6-201ENST00000478031 263 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPN13Q12923 RPL35P6-201ENST00000490024 372 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPN13Q12923 IGBP1P4-201ENST00000503202 879 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPN13Q12923 AC022118.1-201ENST00000512352 547 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPN13Q12923 AC079064.1-201ENST00000528365 362 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPN13Q12923 AC093249.4-201ENST00000564755 259 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPN13Q12923 EXPH5-201ENST00000265843 10187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPN13Q12923 PIGN-241ENST00000640050 3154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPN13Q12923 MCMDC2-204ENST00000422365 5096 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPN13Q12923 MAGI2-222ENST00000636039 5671 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPN13Q12923 PRRC1-201ENST00000296666 4699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPN13Q12923 KLHL28-202ENST00000396128 6545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPN13Q12923 DDX18P4-201ENST00000511690 1966 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPN13Q12923 DMD-207ENST00000378677 13932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPN13Q12923 BRCA1-203ENST00000357654 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPN13Q12923 LMOD2-202ENST00000458573 2346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPN13Q12923 BDH2-201ENST00000296424 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPN13Q12923 AL035696.2-201ENST00000407941 709 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPN13Q12923 AL365318.1-201ENST00000453128 705 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPN13Q12923 ENSA-211ENST00000503345 793 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPN13Q12923 Y_RNA.676-201ENST00000516393 96 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPN13Q12923 AC011477.2-201ENST00000590697 921 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPN13Q12923 AC239809.3-206ENST00000596091 741 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPN13Q12923 U3.53-201ENST00000628922 216 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPN13Q12923 AC006206.1-201ENST00000544842 3387 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
PTPN13Q12923 CCDC62-205ENST00000537566 3537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
PTPN13Q12923 CASP10-202ENST00000286186 5928 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
PTPN13Q12923 PLCB1-211ENST00000617005 6458 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
PTPN13Q12923 KCNE2-201ENST00000290310 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
PTPN13Q12923 Y_RNA.238-201ENST00000364441 102 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
PTPN13Q12923 ARPP21-211ENST00000427542 568 ntTSL 4 BASIC3.92□□□□□ -1.78
PTPN13Q12923 LINC01704-202ENST00000442358 649 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
PTPN13Q12923 AC003991.1-205ENST00000447758 625 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
PTPN13Q12923 RPL5P24-201ENST00000463742 885 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
PTPN13Q12923 AC099805.1-203ENST00000518177 773 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
PTPN13Q12923 AC022081.1-201ENST00000537327 433 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
PTPN13Q12923 SNORA74C-1-201ENST00000580726 201 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
PTPN13Q12923 AC073137.1-201ENST00000605636 634 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
PTPN13Q12923 PCNP-208ENST00000627393 136 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
PTPN13Q12923 ARHGAP42-203ENST00000524892 5685 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
PTPN13Q12923 WDR35-202ENST00000345530 6960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
PTPN13Q12923 A1CF-207ENST00000395495 9400 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
PTPN13Q12923 ADGRL3-202ENST00000504896 4816 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
PTPN13Q12923 AC004817.4-201ENST00000602396 3625 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
PTPN13Q12923 STAG2-203ENST00000371145 4393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
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PTPN13Q12923 GTF2IP22-201ENST00000554443 182 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
PTPN13Q12923 AC008543.4-201ENST00000585694 442 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
PTPN13Q12923 OR7A19P-201ENST00000608051 733 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
PTPN13Q12923 ZMYND11-202ENST00000381584 2709 ntTSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
PTPN13Q12923 CYP4Z1-201ENST00000334194 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
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PTPN13Q12923 NABP1-205ENST00000425611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
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PTPN13Q12923 MYCT1-201ENST00000367245 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
PTPN13Q12923 OR56A5-201ENST00000340110 738 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
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PTPN13Q12923 PPFIA2-201ENST00000333447 5517 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
PTPN13Q12923 LINC01844-201ENST00000432677 2237 ntTSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
PTPN13Q12923 SLC6A15-203ENST00000450363 4229 ntTSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
PTPN13Q12923 IBTK-206ENST00000503631 3560 ntTSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
PTPN13Q12923 ASB14-202ENST00000487349 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
PTPN13Q12923 PMS1-215ENST00000447232 2576 ntTSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
PTPN13Q12923 CYP3A7-CYP3A51P-202ENST00000620220 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
PTPN13Q12923 LINC01268-201ENST00000434296 2755 ntTSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
PTPN13Q12923 AL592182.3-201ENST00000642132 3304 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
PTPN13Q12923 NFAT5-203ENST00000393742 13067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
PTPN13Q12923 CD200R1-204ENST00000471858 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
PTPN13Q12923 OR4A15-201ENST00000314706 1035 ntBASIC3.9□□□□□ -1.78
PTPN13Q12923 TRAJ38-201ENST00000390499 62 ntAPPRIS P1 BASIC3.9□□□□□ -1.78
PTPN13Q12923 CD200R1-203ENST00000440122 847 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.78
PTPN13Q12923 MRPL48P1-201ENST00000445390 636 ntBASIC3.9□□□□□ -1.78
PTPN13Q12923 LINC00377-201ENST00000456588 657 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.78
PTPN13Q12923 AC079089.1-204ENST00000530194 572 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.78
PTPN13Q12923 AC023442.3-203ENST00000530946 533 ntTSL 4 BASIC3.9□□□□□ -1.78
PTPN13Q12923 SULT6B1-205ENST00000535679 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.78
PTPN13Q12923 AC068643.1-201ENST00000548594 755 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.78
PTPN13Q12923 ZNF66-203ENST00000594534 757 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.78
PTPN13Q12923 SETSIP-202ENST00000596516 909 ntAPPRIS P2 BASIC3.9□□□□□ -1.78
PTPN13Q12923 MIR6133-201ENST00000617057 108 ntBASIC3.9□□□□□ -1.78
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