Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 AL139819.1-201ENST00000429420 471 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PGGT1BP53609 POU6F2-AS1-201ENST00000433519 381 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PGGT1BP53609 LINC01052-201ENST00000437777 496 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PGGT1BP53609 CNOT7P2-201ENST00000441051 832 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PGGT1BP53609 BBIP1-206ENST00000447005 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PGGT1BP53609 AC004022.1-201ENST00000447766 1066 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PGGT1BP53609 FAM104B-204ENST00000472571 1109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
PGGT1BP53609 RPL7P39-201ENST00000481157 744 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PGGT1BP53609 AC079841.1-201ENST00000481228 950 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PGGT1BP53609 RPL21P47-201ENST00000483696 477 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PGGT1BP53609 LRRC70-203ENST00000491184 703 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PGGT1BP53609 AL049544.1-201ENST00000511849 673 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PGGT1BP53609 RPL23AP53-201ENST00000521854 457 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PGGT1BP53609 MTERF3-203ENST00000522822 1148 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PGGT1BP53609 OSGEPL1-AS1-203ENST00000523895 567 ntTSL 4 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PGGT1BP53609 AC099520.1-205ENST00000524083 316 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PGGT1BP53609 LINC01489-201ENST00000542689 605 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PGGT1BP53609 AL442163.2-201ENST00000553912 710 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PGGT1BP53609 AL357172.1-201ENST00000556016 593 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PGGT1BP53609 AC023906.4-201ENST00000557898 895 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PGGT1BP53609 WDR61-205ENST00000558459 884 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PGGT1BP53609 ZNF971P-201ENST00000562068 1249 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PGGT1BP53609 MIR4691-201ENST00000583764 85 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PGGT1BP53609 AL157938.2-205ENST00000586290 891 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PGGT1BP53609 PART1_2.1-201ENST00000612397 250 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PGGT1BP53609 VN1R9P-201ENST00000614184 867 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PGGT1BP53609 AC015914.2-201ENST00000618167 288 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PGGT1BP53609 AC138965.3-201ENST00000623875 498 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PGGT1BP53609 AC079416.3-201ENST00000624479 549 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PGGT1BP53609 UOX-205ENST00000640983 544 ntTSL 4 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PGGT1BP53609 AC025574.1-201ENST00000554784 1653 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PGGT1BP53609 SPATA2P1-201ENST00000431223 2055 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PGGT1BP53609 WEE2-201ENST00000397541 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
PGGT1BP53609 PTPRO-204ENST00000445537 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PGGT1BP53609 VNN3-211ENST00000509351 1700 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
PGGT1BP53609 SUCLA2P2-201ENST00000417269 1309 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PGGT1BP53609 CIR1P2-201ENST00000514821 1342 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PGGT1BP53609 AC008432.1-201ENST00000615912 1320 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PGGT1BP53609 PCDH15-212ENST00000395442 2970 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PGGT1BP53609 ADGRG4-202ENST00000394141 8971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
PGGT1BP53609 SLC1A3-202ENST00000381918 3652 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
PGGT1BP53609 AP000808.1-201ENST00000512200 3252 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
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PGGT1BP53609 CMYA5-201ENST00000446378 12847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
PGGT1BP53609 UBR1-201ENST00000290650 7761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
PGGT1BP53609 RGS1-201ENST00000367459 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
PGGT1BP53609 CD86-203ENST00000393627 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
PGGT1BP53609 RNMT-202ENST00000383314 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
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PGGT1BP53609 SASS6-201ENST00000287482 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
PGGT1BP53609 SYCP1-209ENST00000613524 3034 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
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PGGT1BP53609 DNAH14-208ENST00000430092 13763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
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PGGT1BP53609 Y_RNA.169-201ENST00000363745 96 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
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PGGT1BP53609 Y_RNA.318-201ENST00000365131 97 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
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PGGT1BP53609 AMELX-203ENST00000380714 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
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PGGT1BP53609 AC034238.1-215ENST00000609792 219 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
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PGGT1BP53609 DAOA-212ENST00000640578 378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 ECT2L-203ENST00000423192 4319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 NECAB1-202ENST00000521366 2908 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 TAF9-205ENST00000506736 1331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 BMPR1B-202ENST00000394931 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 FAT3-201ENST00000409404 19030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 AC105411.1-201ENST00000568776 1470 ntTSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 GRID2-208ENST00000611049 4844 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
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