Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

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Length 3,210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 HIPK2-202ENST00000406875 15049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
CENPFP49454 DDX60-201ENST00000393743 6071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
CENPFP49454 DNAH10-210ENST00000638045 13678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CENPFP49454 PTPRB-201ENST00000261266 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
CENPFP49454 NKTR-219ENST00000617821 7319 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CENPFP49454 AC239868.2-201ENST00000564237 4527 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CENPFP49454 VIRMA-201ENST00000297591 6528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
CENPFP49454 AC092652.1-202ENST00000413315 587 ntTSL 4 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CENPFP49454 AC023590.1-205ENST00000430457 676 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CENPFP49454 OR6C71P-201ENST00000432580 913 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CENPFP49454 ATP2B2-IT1-201ENST00000440152 472 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CENPFP49454 RPS11P1-201ENST00000451072 473 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CENPFP49454 AL139099.1-201ENST00000497398 403 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CENPFP49454 AL133166.1-202ENST00000550975 565 ntTSL 4 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CENPFP49454 AL031985.2-201ENST00000600955 480 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CENPFP49454 LINC01197-202ENST00000555332 3568 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CENPFP49454 MATR3-228ENST00000620916 3134 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CENPFP49454 ZNF33B-208ENST00000613419 5843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
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CENPFP49454 ZNF567-203ENST00000585696 3734 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
CENPFP49454 ZNF568-216ENST00000619231 3797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CENPFP49454 NALCN-201ENST00000251127 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
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CENPFP49454 C6-201ENST00000263413 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
CENPFP49454 RNVU1-14-201ENST00000384770 164 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
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CENPFP49454 AC012442.1-201ENST00000436885 529 ntTSL 4 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CENPFP49454 AC110792.1-201ENST00000491826 472 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CENPFP49454 ELOCP35-201ENST00000604289 336 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CENPFP49454 LINC02086-205ENST00000628749 679 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CENPFP49454 PCBP1-AS1-348ENST00000629506 667 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CENPFP49454 DDAH1-206ENST00000633113 703 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CENPFP49454 IQCH-201ENST00000335894 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
CENPFP49454 DDX18P5-201ENST00000534547 1306 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CENPFP49454 TCF4-268ENST00000629387 3789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CENPFP49454 AP1G1-201ENST00000299980 6969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
CENPFP49454 AL672167.1-204ENST00000641875 3017 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
CENPFP49454 NBPF26-202ENST00000611287 2701 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CENPFP49454 ATF6-201ENST00000367942 7496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
CENPFP49454 USP47-203ENST00000399455 7396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
CENPFP49454 C1orf112-202ENST00000359326 4002 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
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CENPFP49454 PTPN3-203ENST00000412145 8765 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
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CENPFP49454 THNSL1-201ENST00000376356 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
CENPFP49454 FTO-204ENST00000463855 3056 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
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CENPFP49454 Y_RNA.510-201ENST00000384511 114 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
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CENPFP49454 AL049634.3-201ENST00000604968 457 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CENPFP49454 TEX41-256ENST00000626411 368 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CENPFP49454 CFH-201ENST00000359637 1454 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
CENPFP49454 KIAA1024-201ENST00000305428 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
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CENPFP49454 PTBP3-202ENST00000334318 7990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
CENPFP49454 PRB2-201ENST00000389362 1429 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CENPFP49454 NXPH1-205ENST00000602349 1953 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CENPFP49454 AC233982.1-201ENST00000451247 436 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CENPFP49454 AC010884.1-201ENST00000456519 642 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CENPFP49454 AC114741.1-201ENST00000504357 464 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CENPFP49454 WBP1LP4-201ENST00000505043 344 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CENPFP49454 AC025470.2-201ENST00000506106 897 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CENPFP49454 LINC00508-201ENST00000538901 194 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CENPFP49454 AC006064.5-201ENST00000541782 248 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
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