Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 AC062016.2-201ENST00000420950 676 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
POLKQ9UBT6 AL157831.1-201ENST00000426134 473 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
POLKQ9UBT6 NPM1P29-201ENST00000483112 803 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
POLKQ9UBT6 PARP4P3-201ENST00000510265 317 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
POLKQ9UBT6 SNORA31.9-201ENST00000516429 84 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
POLKQ9UBT6 LINC02290-201ENST00000554187 608 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
POLKQ9UBT6 AC073878.2-201ENST00000565449 385 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
POLKQ9UBT6 RN7SL600P-201ENST00000581811 299 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
POLKQ9UBT6 AC015911.9-201ENST00000591634 185 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
POLKQ9UBT6 SLCO1C1-201ENST00000266509 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
POLKQ9UBT6 CDK14-203ENST00000406263 5163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
POLKQ9UBT6 LRRC9-202ENST00000445360 4717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
POLKQ9UBT6 KAT6B-201ENST00000287239 8287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
POLKQ9UBT6 IQGAP2-204ENST00000502745 3404 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
POLKQ9UBT6 LINC01689-201ENST00000416218 2007 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
POLKQ9UBT6 SCN3A-203ENST00000409101 6599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
POLKQ9UBT6 CFHR3-206ENST00000617219 1462 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
POLKQ9UBT6 AL592182.3-201ENST00000642132 3304 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
POLKQ9UBT6 LARP1BP1-201ENST00000506036 1359 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
POLKQ9UBT6 OR5K1-201ENST00000332650 1097 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
POLKQ9UBT6 RNA5SP317-201ENST00000410176 116 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
POLKQ9UBT6 RN7SKP167-201ENST00000411047 285 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
POLKQ9UBT6 RNA5SP311-201ENST00000411290 116 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
POLKQ9UBT6 AC244033.1-201ENST00000426826 870 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
POLKQ9UBT6 LINC00458-202ENST00000427299 1030 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
POLKQ9UBT6 AC005828.1-201ENST00000431604 524 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
POLKQ9UBT6 AC136489.1-201ENST00000438181 717 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
POLKQ9UBT6 BMS1P22-202ENST00000440946 1160 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
POLKQ9UBT6 AL445433.1-201ENST00000457507 257 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
POLKQ9UBT6 RNA5SP103-201ENST00000459503 118 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
POLKQ9UBT6 RPL35AP15-201ENST00000468042 339 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
POLKQ9UBT6 HMGB3P14-201ENST00000494195 599 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
POLKQ9UBT6 AC091917.2-201ENST00000505002 744 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
POLKQ9UBT6 SPINK13-202ENST00000511106 661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
POLKQ9UBT6 LINC02014-201ENST00000514010 713 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
POLKQ9UBT6 RNA5SP315-201ENST00000516340 116 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
POLKQ9UBT6 RNA5SP312-201ENST00000517068 116 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
POLKQ9UBT6 AC051619.4-201ENST00000560034 292 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
POLKQ9UBT6 OOSP1P2-201ENST00000579644 351 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
POLKQ9UBT6 RN7SL435P-201ENST00000584418 282 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
POLKQ9UBT6 HMGB2P1-201ENST00000591146 634 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
POLKQ9UBT6 ZNF283-207ENST00000593164 1260 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
POLKQ9UBT6 AL161729.3-201ENST00000603533 673 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
POLKQ9UBT6 AL591034.3-201ENST00000605511 685 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
POLKQ9UBT6 AC008966.2-201ENST00000606157 453 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
POLKQ9UBT6 AC092653.1-201ENST00000608509 531 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
POLKQ9UBT6 MILR1-203ENST00000615220 1196 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
POLKQ9UBT6 AL021997.2-201ENST00000615674 271 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
POLKQ9UBT6 AL122125.1-201ENST00000616999 600 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
POLKQ9UBT6 VIPR1-AS1-223ENST00000627073 451 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
POLKQ9UBT6 MIR492-201ENST00000638676 116 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
POLKQ9UBT6 FTO-223ENST00000640179 210 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
POLKQ9UBT6 ATRX-202ENST00000395603 10218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
POLKQ9UBT6 HSPD1P14-201ENST00000432666 1618 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
POLKQ9UBT6 HDAC9-204ENST00000406451 9705 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
POLKQ9UBT6 TJP1-202ENST00000356107 6747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
POLKQ9UBT6 CNTN5-201ENST00000279463 5925 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
POLKQ9UBT6 TOX-201ENST00000361421 4131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
POLKQ9UBT6 AC005261.4-201ENST00000600047 1385 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
POLKQ9UBT6 TAS2R3-201ENST00000247879 1101 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
POLKQ9UBT6 MIR383-201ENST00000362257 73 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
POLKQ9UBT6 RNA5SP307-201ENST00000362863 116 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
POLKQ9UBT6 RN7SKP227-201ENST00000364445 330 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
POLKQ9UBT6 WFDC6-202ENST00000372670 620 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
POLKQ9UBT6 SNORA81-201ENST00000408493 178 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
POLKQ9UBT6 SF3B1-202ENST00000409915 600 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
POLKQ9UBT6 EIF4A1P1-201ENST00000420241 934 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
POLKQ9UBT6 AC104170.2-201ENST00000424246 678 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
POLKQ9UBT6 MTCO3P17-201ENST00000443775 513 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
POLKQ9UBT6 MTND4LP12-201ENST00000448237 295 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
POLKQ9UBT6 DDX39BP2-208ENST00000453923 258 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
POLKQ9UBT6 LINC01014-203ENST00000455307 548 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
POLKQ9UBT6 IGKV2D-30-201ENST00000474213 395 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
POLKQ9UBT6 RPS4XP18-201ENST00000495480 763 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
POLKQ9UBT6 SPTSSB-202ENST00000497137 880 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
POLKQ9UBT6 AC025470.2-201ENST00000506106 897 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
POLKQ9UBT6 LINC01060-205ENST00000512839 716 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
POLKQ9UBT6 RPL23AP97-201ENST00000568955 471 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
POLKQ9UBT6 AC100872.1-201ENST00000577765 501 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
POLKQ9UBT6 AC011507.1-201ENST00000585364 567 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
POLKQ9UBT6 ZNF66-203ENST00000594534 757 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
POLKQ9UBT6 DAOA-AS1_1.1-201ENST00000613021 201 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
POLKQ9UBT6 LINC02342-201ENST00000627910 461 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
POLKQ9UBT6 FP325313.1-201ENST00000638228 703 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
POLKQ9UBT6 CD200R1-204ENST00000471858 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
POLKQ9UBT6 EFCAB5-201ENST00000394835 5132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
POLKQ9UBT6 TFPI-203ENST00000392365 3649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
POLKQ9UBT6 WDR72-204ENST00000559418 3602 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
POLKQ9UBT6 C1orf112-202ENST00000359326 4002 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
POLKQ9UBT6 SCN2A-203ENST00000375437 8792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
POLKQ9UBT6 AC097461.1-201ENST00000568928 2821 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
POLKQ9UBT6 C6-201ENST00000263413 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
POLKQ9UBT6 MTUS1-228ENST00000544260 3650 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.48
POLKQ9UBT6 TCHHL1-201ENST00000368806 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
POLKQ9UBT6 LTN1-202ENST00000389194 7749 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
POLKQ9UBT6 OR2AT4-205ENST00000641931 8357 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
POLKQ9UBT6 USP44-201ENST00000258499 4022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
POLKQ9UBT6 XRN1-201ENST00000264951 10143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
POLKQ9UBT6 TC2N-203ENST00000435962 5146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
POLKQ9UBT6 ATXN3-207ENST00000503767 1315 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75 ms