Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 LINC00511-212ENST00000581183 657 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 AL157938.2-202ENST00000588378 875 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 AC025278.1-201ENST00000593558 515 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 AC025574.2-201ENST00000615621 514 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 CCL4L2-215ENST00000620055 537 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 C1orf195-202ENST00000625027 441 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 MIR193BHG-214ENST00000641765 509 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 ZNF663P-202ENST00000641770 1131 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 ESRRG-202ENST00000360012 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 ATF2-201ENST00000264110 4176 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 AL022393.1-201ENST00000625142 1677 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 TSPAN8-202ENST00000393330 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 AC079097.1-201ENST00000512187 1399 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 ZEB1-219ENST00000560721 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 CLEC1B-204ENST00000428126 3054 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 ZNF92-203ENST00000431504 2947 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 LIX1-AS1-201ENST00000504578 1793 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 ECHDC1-222ENST00000531967 2585 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 AIG1-208ENST00000494282 3393 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 LINC01553-203ENST00000521074 4329 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 MTRNR2L11-201ENST00000604646 1552 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 CCDC54-201ENST00000261058 1444 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 GABRA3-201ENST00000370314 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 RAPGEF4-213ENST00000535187 3707 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 IL21-201ENST00000264497 629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 OR51Q1-201ENST00000300778 1096 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 RN7SKP15-201ENST00000364742 309 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 PLIN2-202ENST00000380464 655 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 IGLV5-48-201ENST00000390293 369 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 U3.28-201ENST00000391249 210 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 AL590609.3-201ENST00000411815 210 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 LINC01709-201ENST00000415532 634 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 AL137856.1-202ENST00000418238 422 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 AC093155.2-201ENST00000420734 937 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 AL513188.1-201ENST00000421167 614 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 RPL7P53-201ENST00000421245 739 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 RPL34P3-201ENST00000421454 338 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 AC104170.2-201ENST00000424246 678 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 MTND6P12-201ENST00000428247 522 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 AC007285.2-201ENST00000433088 518 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 MTND1P34-201ENST00000438556 671 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 AC073465.2-201ENST00000440938 498 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 GSAP-208ENST00000441833 737 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 AL591848.2-201ENST00000442712 522 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 AC064871.1-201ENST00000444562 427 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 AL450996.1-201ENST00000445574 1202 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 EEF1B2P6-201ENST00000445713 673 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 CBX1P2-201ENST00000453841 458 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 MTND4LP3-201ENST00000468320 276 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 AC108748.1-201ENST00000487772 515 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 AC084024.2-201ENST00000503480 791 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 AC008591.1-201ENST00000503616 631 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 AC011411.1-201ENST00000509592 876 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 NDUFB4P12-201ENST00000513465 390 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 AF117829.1-208ENST00000521996 915 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 AC062004.1-202ENST00000524014 246 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 MINCR-206ENST00000524335 499 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 CASP1-206ENST00000526568 1061 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 CASP1-216ENST00000534497 825 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 CACNA1C-AS4-201ENST00000544415 735 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 TMEM191C-213ENST00000545656 574 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 POU1F1-203ENST00000560656 647 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 AC087463.3-201ENST00000570105 415 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 AC129507.1-204ENST00000573601 503 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 MIR7853-201ENST00000584820 132 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 MRO-208ENST00000588444 866 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 AC007193.1-201ENST00000599645 448 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 MRPS35P3-201ENST00000603189 709 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 AL137072.1-201ENST00000603444 466 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 uc_338.7-201ENST00000621834 124 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 AC024023.1-201ENST00000624530 922 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 CGA-204ENST00000627148 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 OR51Q1-202ENST00000641085 1096 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 DYNC1I2-225ENST00000508530 2494 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 ALCAM-205ENST00000472644 4189 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 AP002512.4-201ENST00000641310 4672 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 AC104260.2-201ENST00000623551 3497 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 VIM-AS1-201ENST00000437232 1351 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 TRIM51GP-201ENST00000534741 1350 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 NPIPB9-201ENST00000357796 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 KCNJ10-205ENST00000638728 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 Z95331.1-201ENST00000623075 23112 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 DGKH-210ENST00000628433 3449 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 AC006042.3-201ENST00000454684 1469 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 CLCA1-202ENST00000394711 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 IFIT1B-201ENST00000371809 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 LINC01619-207ENST00000551843 2205 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 SPATA2P1-201ENST00000431223 2055 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 CDC42SE2-201ENST00000360515 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 AL049737.1-201ENST00000413920 1403 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 POMP-202ENST00000460403 1428 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 EMSY-206ENST00000525038 4376 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 ORC3-202ENST00000392844 2512 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 PCDH11X-202ENST00000361655 4126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 LRRC37A-203ENST00000496930 3860 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 NBPF10-202ENST00000617010 11630 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 OR6B1-202ENST00000641698 5153 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 A1CF-207ENST00000395495 9400 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 TMSB4XP4-201ENST00000323496 618 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
EHD3Q9NZN3 NACA3P-201ENST00000359690 648 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
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