Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU0

BEST4, Bestrophin-4, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST4Q8NFU0 AC023509.5-201ENST00000617434 807 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
BEST4Q8NFU0 WWOX-217ENST00000620008 450 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
BEST4Q8NFU0 ST6GALNAC3-203ENST00000621530 617 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
BEST4Q8NFU0 AC072062.1-209ENST00000627336 772 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
BEST4Q8NFU0 AL136520.1-201ENST00000600311 1322 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
BEST4Q8NFU0 IL13RA2-201ENST00000243213 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
BEST4Q8NFU0 TMEM161B-210ENST00000511218 1351 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
BEST4Q8NFU0 CD200R1-204ENST00000471858 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
BEST4Q8NFU0 FKTN-201ENST00000223528 7364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
BEST4Q8NFU0 TEX26-201ENST00000380473 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
BEST4Q8NFU0 LINC00704-201ENST00000430998 1478 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
BEST4Q8NFU0 F8-202ENST00000360256 9059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
BEST4Q8NFU0 MYB-226ENST00000528774 2277 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
BEST4Q8NFU0 AC018529.3-201ENST00000624212 2254 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
BEST4Q8NFU0 CYP4Z2P-201ENST00000423332 1512 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
BEST4Q8NFU0 LINC01192-202ENST00000470546 1519 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
BEST4Q8NFU0 RIMS2-201ENST00000262231 3854 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
BEST4Q8NFU0 AC011493.1-201ENST00000596753 1632 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
BEST4Q8NFU0 SLC9B1-202ENST00000394789 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
BEST4Q8NFU0 SYTL2-217ENST00000528231 3536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
BEST4Q8NFU0 UTP20-201ENST00000261637 9025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
BEST4Q8NFU0 KLHL13-203ENST00000371878 3234 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
BEST4Q8NFU0 SENP7-202ENST00000348610 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
BEST4Q8NFU0 GKN2-201ENST00000328895 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
BEST4Q8NFU0 OR5L2-201ENST00000378397 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.09□□□□□ -1.75
BEST4Q8NFU0 OR51B6-201ENST00000380219 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.09□□□□□ -1.75
BEST4Q8NFU0 OR51F1-201ENST00000380383 960 ntAPPRIS P5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
BEST4Q8NFU0 OR5K3-201ENST00000383695 966 ntAPPRIS P1 BASIC4.09□□□□□ -1.75
BEST4Q8NFU0 RNU6-481P-201ENST00000384194 107 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
BEST4Q8NFU0 AL021331.1-201ENST00000402817 582 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
BEST4Q8NFU0 VDAC1P9-201ENST00000412766 841 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
BEST4Q8NFU0 AL645465.1-201ENST00000417765 642 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
BEST4Q8NFU0 AL590432.1-201ENST00000420071 566 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
BEST4Q8NFU0 AC008154.2-201ENST00000420268 414 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
BEST4Q8NFU0 AL603910.1-201ENST00000423099 370 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
BEST4Q8NFU0 HMGB3P10-201ENST00000434734 572 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
BEST4Q8NFU0 MTND6P18-201ENST00000439477 513 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
BEST4Q8NFU0 AP000281.1-201ENST00000444036 316 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
BEST4Q8NFU0 KNOP1P3-201ENST00000446933 426 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
BEST4Q8NFU0 PTMAP3-201ENST00000447474 330 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
BEST4Q8NFU0 LINC01034-201ENST00000448806 277 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
BEST4Q8NFU0 RPL31P15-201ENST00000449770 338 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
BEST4Q8NFU0 AL160408.1-203ENST00000453568 631 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
BEST4Q8NFU0 RPS27AP2-201ENST00000457576 465 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
BEST4Q8NFU0 MLF1-205ENST00000469452 1098 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
BEST4Q8NFU0 AC098851.1-201ENST00000476561 570 ntTSL 4 BASIC4.09□□□□□ -1.75
BEST4Q8NFU0 RCHY1-206ENST00000507014 650 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
BEST4Q8NFU0 LINC02039-201ENST00000507428 566 ntTSL 4 BASIC4.09□□□□□ -1.75
BEST4Q8NFU0 RNU6-709P-201ENST00000517257 104 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
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BEST4Q8NFU0 MTUS1-216ENST00000519263 4089 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.76
BEST4Q8NFU0 ZEB1-202ENST00000361642 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
BEST4Q8NFU0 ZNF700-202ENST00000482090 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
BEST4Q8NFU0 CDC42SE2-201ENST00000360515 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
BEST4Q8NFU0 OTOGL-202ENST00000458043 8083 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
BEST4Q8NFU0 DICER1-212ENST00000541352 5621 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
BEST4Q8NFU0 ZC2HC1B-201ENST00000237275 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
BEST4Q8NFU0 SOCS5-201ENST00000306503 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
BEST4Q8NFU0 TMSB4XP4-201ENST00000323496 618 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
BEST4Q8NFU0 SCAI-201ENST00000336505 12079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
BEST4Q8NFU0 SLC30A7-201ENST00000357650 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
BEST4Q8NFU0 SNORA17.1-201ENST00000362945 126 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
BEST4Q8NFU0 RNA5SP132-201ENST00000364725 118 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
BEST4Q8NFU0 CD84-205ENST00000368051 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
BEST4Q8NFU0 MIR142-201ENST00000384835 87 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
BEST4Q8NFU0 ATP5F1P2-201ENST00000398143 760 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
BEST4Q8NFU0 RN7SKP126-201ENST00000411143 300 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
BEST4Q8NFU0 TTTY12-201ENST00000413466 979 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
BEST4Q8NFU0 GTF3AP1-201ENST00000416942 1004 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
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