Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9I9

DTX3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase DTX3, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX3Q8N9I9 HSPD1P9-201ENST00000420325 1636 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
DTX3Q8N9I9 CFHR4-204ENST00000608469 1601 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
DTX3Q8N9I9 OR4D5-201ENST00000307033 1095 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
DTX3Q8N9I9 HHLA3-201ENST00000359875 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
DTX3Q8N9I9 RNA5SP350-201ENST00000363298 111 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
DTX3Q8N9I9 RN7SKP191-201ENST00000364713 306 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
DTX3Q8N9I9 XAGE3-202ENST00000375491 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
DTX3Q8N9I9 RNU6-114P-201ENST00000384704 105 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
DTX3Q8N9I9 MIR181A1-201ENST00000385026 110 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
DTX3Q8N9I9 TRAJ46-201ENST00000390491 63 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
DTX3Q8N9I9 EI24P3-201ENST00000399046 1062 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
DTX3Q8N9I9 RN7SKP205-201ENST00000410999 307 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
DTX3Q8N9I9 AL354868.1-201ENST00000417077 482 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
DTX3Q8N9I9 GNG5P5-201ENST00000420444 220 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
DTX3Q8N9I9 GNRHR-202ENST00000420975 859 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
DTX3Q8N9I9 GLRXP1-201ENST00000423261 334 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
DTX3Q8N9I9 AC000089.1-201ENST00000424559 801 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
DTX3Q8N9I9 AL590399.2-201ENST00000427536 309 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
DTX3Q8N9I9 AC104653.2-201ENST00000435407 416 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
DTX3Q8N9I9 PCBP2P1-201ENST00000437262 977 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
DTX3Q8N9I9 TMEM244-202ENST00000438392 565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
DTX3Q8N9I9 AC064862.5-201ENST00000440618 334 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
DTX3Q8N9I9 AC016395.1-201ENST00000444086 465 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
DTX3Q8N9I9 MTND2P24-201ENST00000453434 806 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
DTX3Q8N9I9 RPL26P30-201ENST00000453533 435 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
DTX3Q8N9I9 LMOD2-201ENST00000456238 918 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
DTX3Q8N9I9 RNU7-27P-201ENST00000459281 62 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
DTX3Q8N9I9 DCUN1D1-204ENST00000469954 970 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
DTX3Q8N9I9 AC114956.1-201ENST00000504277 512 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
DTX3Q8N9I9 OR52H2P-201ENST00000514607 902 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
DTX3Q8N9I9 LINC02482-202ENST00000515205 422 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
DTX3Q8N9I9 AC095057.2-201ENST00000515422 553 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
DTX3Q8N9I9 AC016885.1-201ENST00000517796 532 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
DTX3Q8N9I9 IGKV2D-38-201ENST00000518423 240 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
DTX3Q8N9I9 AC008429.2-201ENST00000523057 864 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
DTX3Q8N9I9 OR4R3P-201ENST00000525084 838 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
DTX3Q8N9I9 AC239860.2-201ENST00000525886 270 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
DTX3Q8N9I9 AP000790.2-201ENST00000534388 522 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
DTX3Q8N9I9 PATE4-203ENST00000534411 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
DTX3Q8N9I9 AC027804.1-201ENST00000534653 529 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
DTX3Q8N9I9 AC022075.3-201ENST00000539009 649 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
DTX3Q8N9I9 AC011595.3-201ENST00000546699 632 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
DTX3Q8N9I9 AC008126.1-201ENST00000549019 480 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
DTX3Q8N9I9 AL096869.1-201ENST00000557622 559 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
DTX3Q8N9I9 AC016987.2-201ENST00000560696 351 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
DTX3Q8N9I9 AC009852.1-201ENST00000564058 465 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
DTX3Q8N9I9 PPIAL4A-201ENST00000577856 660 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
DTX3Q8N9I9 AP001004.1-201ENST00000582468 324 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
DTX3Q8N9I9 AC022031.2-203ENST00000587346 565 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
DTX3Q8N9I9 AC104365.1-201ENST00000588835 394 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
DTX3Q8N9I9 AC020915.3-201ENST00000595301 550 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
DTX3Q8N9I9 ZRANB2-AS2-215ENST00000596952 624 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
DTX3Q8N9I9 AC005084.1-201ENST00000605160 304 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
DTX3Q8N9I9 AC016727.1-205ENST00000605437 569 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
DTX3Q8N9I9 AC091304.9-201ENST00000612091 226 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
DTX3Q8N9I9 AC092650.2-201ENST00000619984 902 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
DTX3Q8N9I9 AC104985.2-201ENST00000620598 500 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
DTX3Q8N9I9 AC092794.2-201ENST00000620933 563 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
DTX3Q8N9I9 AC069234.4-201ENST00000621276 412 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
DTX3Q8N9I9 SAMD12-AS1-201ENST00000625758 718 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
DTX3Q8N9I9 AL157786.1-207ENST00000627771 695 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
DTX3Q8N9I9 SOX9-AS1-218ENST00000628742 733 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
DTX3Q8N9I9 TEX41-293ENST00000630451 690 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
DTX3Q8N9I9 MKKS-204ENST00000639674 192 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
DTX3Q8N9I9 AL353796.1-201ENST00000561542 3241 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
DTX3Q8N9I9 STYX-202ENST00000442123 4554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
DTX3Q8N9I9 SOX5-216ENST00000546136 6975 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
DTX3Q8N9I9 CDR1-202ENST00000625883 1485 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
DTX3Q8N9I9 LINC01581-202ENST00000558874 3173 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
DTX3Q8N9I9 AP001541.1-201ENST00000623322 1904 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
DTX3Q8N9I9 SCN2A-202ENST00000375427 8553 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
DTX3Q8N9I9 CLRN1-AS1-201ENST00000465576 2045 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
DTX3Q8N9I9 FCGR1B-209ENST00000616817 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
DTX3Q8N9I9 AC116158.1-201ENST00000560231 2129 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
DTX3Q8N9I9 C2orf66-201ENST00000342506 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
DTX3Q8N9I9 AC020637.1-201ENST00000546977 1447 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
DTX3Q8N9I9 PHACTR2P1-201ENST00000605639 1414 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
DTX3Q8N9I9 KCNRG-202ENST00000360473 1623 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
DTX3Q8N9I9 SAGE3P-201ENST00000619800 1635 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
DTX3Q8N9I9 PTPRT-201ENST00000356100 12480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
DTX3Q8N9I9 PTPRT-203ENST00000373187 12453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
DTX3Q8N9I9 OR2M4-201ENST00000306687 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
DTX3Q8N9I9 OR13F1-201ENST00000334726 960 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
DTX3Q8N9I9 RN7SKP226-201ENST00000364912 300 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
DTX3Q8N9I9 RN7SKP130-201ENST00000364924 301 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
DTX3Q8N9I9 OR52E6-202ENST00000379946 954 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
DTX3Q8N9I9 ATP5EP2-201ENST00000381026 385 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
DTX3Q8N9I9 SRY-201ENST00000383070 845 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
DTX3Q8N9I9 SNORD115-47-201ENST00000391226 86 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
DTX3Q8N9I9 AC105271.1-202ENST00000411417 445 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
DTX3Q8N9I9 ZNRF3-IT1-201ENST00000412798 674 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
DTX3Q8N9I9 AC005104.1-201ENST00000414896 442 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
DTX3Q8N9I9 AC016831.2-201ENST00000417179 352 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
DTX3Q8N9I9 AC092484.1-201ENST00000420548 833 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
DTX3Q8N9I9 AL390243.1-201ENST00000422038 708 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
DTX3Q8N9I9 LINC00387-201ENST00000422609 458 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
DTX3Q8N9I9 PTPN2P1-201ENST00000423212 1072 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
DTX3Q8N9I9 AL360227.1-201ENST00000425364 433 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
DTX3Q8N9I9 AL158212.1-201ENST00000428766 315 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
DTX3Q8N9I9 AL513175.1-201ENST00000431492 780 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.5 ms