Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9B4

ANKRD42, Ankyrin repeat domain-containing protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD42Q8N9B4 AC007738.1-201ENST00000413892 348 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
ANKRD42Q8N9B4 AC006076.1-201ENST00000423233 345 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
ANKRD42Q8N9B4 AL021153.1-201ENST00000427360 308 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
ANKRD42Q8N9B4 AL160004.1-201ENST00000434311 478 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
ANKRD42Q8N9B4 AL592494.1-201ENST00000437523 309 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
ANKRD42Q8N9B4 AL583854.1-201ENST00000438818 613 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
ANKRD42Q8N9B4 AC099654.1-201ENST00000442649 407 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
ANKRD42Q8N9B4 MTCYBP42-201ENST00000444653 1130 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
ANKRD42Q8N9B4 AL358794.1-201ENST00000445689 381 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
ANKRD42Q8N9B4 RHEBP2-201ENST00000450289 600 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
ANKRD42Q8N9B4 DENND6A-AS1-201ENST00000470427 364 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
ANKRD42Q8N9B4 AC093607.1-202ENST00000499715 559 ntTSL 4 BASIC5.3□□□□□ -1.56
ANKRD42Q8N9B4 NACAP5-201ENST00000509863 636 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
ANKRD42Q8N9B4 AC114781.3-201ENST00000512083 142 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
ANKRD42Q8N9B4 AC011405.1-201ENST00000514207 248 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
ANKRD42Q8N9B4 SNORA19.3-201ENST00000516165 130 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
ANKRD42Q8N9B4 AC025524.2-206ENST00000517953 439 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
ANKRD42Q8N9B4 AC009623.1-201ENST00000517964 1131 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
ANKRD42Q8N9B4 SOD1P3-201ENST00000518682 454 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
ANKRD42Q8N9B4 AC025370.1-201ENST00000523775 583 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
ANKRD42Q8N9B4 LINC01479-201ENST00000545520 509 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
ANKRD42Q8N9B4 BNIP3P1-201ENST00000547295 580 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
ANKRD42Q8N9B4 AC039056.1-201ENST00000552704 467 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
ANKRD42Q8N9B4 SLC7A7-210ENST00000554517 1158 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
ANKRD42Q8N9B4 AL392023.2-202ENST00000555342 494 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
ANKRD42Q8N9B4 AL161713.1-201ENST00000555538 145 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
ANKRD42Q8N9B4 PWRN4-201ENST00000563016 420 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
ANKRD42Q8N9B4 RPGRIP1L-208ENST00000566096 893 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
ANKRD42Q8N9B4 AC011824.2-203ENST00000579975 633 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
ANKRD42Q8N9B4 AC091057.3-201ENST00000602684 733 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
ANKRD42Q8N9B4 AC096947.1-201ENST00000603233 470 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
ANKRD42Q8N9B4 AC011453.2-201ENST00000603737 729 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
ANKRD42Q8N9B4 AC016597.2-201ENST00000613256 341 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
ANKRD42Q8N9B4 AC105227.2-201ENST00000615075 605 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
ANKRD42Q8N9B4 RNU6-156P-201ENST00000621869 107 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
ANKRD42Q8N9B4 AC104985.3-201ENST00000623479 597 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
ANKRD42Q8N9B4 AP000843.1-201ENST00000624880 701 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
ANKRD42Q8N9B4 SATB1-AS1-266ENST00000630271 813 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
ANKRD42Q8N9B4 AC092375.1-202ENST00000639452 404 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
ANKRD42Q8N9B4 KLHL13-201ENST00000262820 3972 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
ANKRD42Q8N9B4 CYP4Z1-201ENST00000334194 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
ANKRD42Q8N9B4 MTND4P8-201ENST00000514997 1362 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
ANKRD42Q8N9B4 EMSY-205ENST00000524767 4116 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
ANKRD42Q8N9B4 RGS4-202ENST00000367908 2606 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
ANKRD42Q8N9B4 TCP11-207ENST00000418521 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
ANKRD42Q8N9B4 WDR35-202ENST00000345530 6960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
ANKRD42Q8N9B4 AC120338.1-201ENST00000625074 1541 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
ANKRD42Q8N9B4 FTX-210ENST00000603037 8347 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
ANKRD42Q8N9B4 MYB-213ENST00000525369 2866 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
ANKRD42Q8N9B4 COX6B1P3-201ENST00000312310 260 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
ANKRD42Q8N9B4 RNU1-150P-201ENST00000362491 162 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
ANKRD42Q8N9B4 SNRPE-201ENST00000367208 355 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
ANKRD42Q8N9B4 TRAV23DV6-201ENST00000390451 409 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
ANKRD42Q8N9B4 Y_RNA.578-201ENST00000390903 88 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
ANKRD42Q8N9B4 AL034417.1-201ENST00000399343 800 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
ANKRD42Q8N9B4 SFR1P1-201ENST00000403720 688 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
ANKRD42Q8N9B4 CoTC_ribozyme.1-201ENST00000408104 192 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
ANKRD42Q8N9B4 EEF1A1P29-201ENST00000416082 1096 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
ANKRD42Q8N9B4 SLC16A12-AS1-201ENST00000423474 405 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
ANKRD42Q8N9B4 AC127526.2-201ENST00000426436 775 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
ANKRD42Q8N9B4 LINC01611-201ENST00000428896 477 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
ANKRD42Q8N9B4 RPL12P17-201ENST00000432393 498 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
ANKRD42Q8N9B4 TRAPPC2P9-201ENST00000434556 343 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
ANKRD42Q8N9B4 PCBP1-AS1-232ENST00000442040 1111 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
ANKRD42Q8N9B4 BCAP29-207ENST00000445771 1157 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
ANKRD42Q8N9B4 LINC01880-201ENST00000446593 561 ntTSL 4 BASIC5.29□□□□□ -1.56
ANKRD42Q8N9B4 AL356421.2-201ENST00000446733 197 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
ANKRD42Q8N9B4 GAPDHP39-201ENST00000481866 979 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
ANKRD42Q8N9B4 WDR78-207ENST00000488333 613 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
ANKRD42Q8N9B4 SNRPCP11-201ENST00000492453 205 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
ANKRD42Q8N9B4 AC092924.1-201ENST00000496084 487 ntTSL 4 BASIC5.29□□□□□ -1.56
ANKRD42Q8N9B4 AC090071.1-201ENST00000507713 644 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
ANKRD42Q8N9B4 HMGB3P16-201ENST00000508037 287 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
ANKRD42Q8N9B4 KRT19P6-201ENST00000510983 209 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
ANKRD42Q8N9B4 AC091163.3-201ENST00000518269 1144 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
ANKRD42Q8N9B4 TPT1-AS1-207ENST00000520310 563 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
ANKRD42Q8N9B4 DEFB130C-202ENST00000530001 230 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
ANKRD42Q8N9B4 AC090791.1-201ENST00000530960 492 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
ANKRD42Q8N9B4 AP004607.2-201ENST00000533949 322 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
ANKRD42Q8N9B4 AC055720.2-201ENST00000537724 172 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
ANKRD42Q8N9B4 PDCD5P1-201ENST00000543528 309 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
ANKRD42Q8N9B4 AC079905.1-201ENST00000549280 475 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
ANKRD42Q8N9B4 AC116553.2-201ENST00000564203 463 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
ANKRD42Q8N9B4 MRPS21P7-201ENST00000566937 238 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
ANKRD42Q8N9B4 RBM22P1-201ENST00000578589 1214 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
ANKRD42Q8N9B4 AC104996.1-201ENST00000583250 591 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
ANKRD42Q8N9B4 DYNAP-202ENST00000585973 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
ANKRD42Q8N9B4 AC067852.4-201ENST00000590314 478 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
ANKRD42Q8N9B4 GMFG-202ENST00000594700 397 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
ANKRD42Q8N9B4 SSX4B-201ENST00000595235 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
ANKRD42Q8N9B4 SSX4-201ENST00000595689 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
ANKRD42Q8N9B4 CDC42EP3P1-201ENST00000601004 764 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
ANKRD42Q8N9B4 AC024060.1-201ENST00000607052 494 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
ANKRD42Q8N9B4 AP000238.1-201ENST00000608759 426 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
ANKRD42Q8N9B4 RN7SL544P-201ENST00000617232 284 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
ANKRD42Q8N9B4 BX005214.3-202ENST00000619809 325 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
ANKRD42Q8N9B4 RN7SL763P-201ENST00000620922 284 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
ANKRD42Q8N9B4 LINC00969-332ENST00000630874 738 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
ANKRD42Q8N9B4 OR52B5P-202ENST00000641118 1110 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
ANKRD42Q8N9B4 MOSPD2-201ENST00000380492 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.9 ms