Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTZ2

USP17L1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L1Q7RTZ2 POLR2B-202ENST00000381227 4108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
USP17L1Q7RTZ2 TRIM51-201ENST00000244891 1329 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
USP17L1Q7RTZ2 AC234781.1-202ENST00000412436 1329 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
USP17L1Q7RTZ2 SCOC-204ENST00000394205 1964 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
USP17L1Q7RTZ2 DLEU7-AS1-201ENST00000413510 1806 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
USP17L1Q7RTZ2 AC013488.1-201ENST00000526618 1838 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
USP17L1Q7RTZ2 LINC01741-201ENST00000427173 1666 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
USP17L1Q7RTZ2 LINC01619-203ENST00000549802 2169 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
USP17L1Q7RTZ2 DNAJC6-203ENST00000395325 5743 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
USP17L1Q7RTZ2 ZNF37BP-203ENST00000452306 1352 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
USP17L1Q7RTZ2 BNC1-202ENST00000569704 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
USP17L1Q7RTZ2 SYT14-207ENST00000629778 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
USP17L1Q7RTZ2 LINGO2-202ENST00000379992 3044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
USP17L1Q7RTZ2 HAVCR1-204ENST00000522693 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
USP17L1Q7RTZ2 PDE6A-205ENST00000617647 4039 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
USP17L1Q7RTZ2 OR7D2-201ENST00000344248 3224 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
USP17L1Q7RTZ2 AC130360.2-201ENST00000533477 1556 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
USP17L1Q7RTZ2 SEMA3A-204ENST00000436949 2550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
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USP17L1Q7RTZ2 AL031651.1-201ENST00000615357 1438 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
USP17L1Q7RTZ2 AP1M1-201ENST00000291439 13193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
USP17L1Q7RTZ2 FOPNL-201ENST00000255759 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
USP17L1Q7RTZ2 OSGEPL1-207ENST00000522700 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
USP17L1Q7RTZ2 ZC3H11A-204ENST00000367214 3451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
USP17L1Q7RTZ2 BCORP1-202ENST00000441139 3461 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
USP17L1Q7RTZ2 AC008033.1-201ENST00000216407 1162 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
USP17L1Q7RTZ2 FUNDC2P3-201ENST00000334716 533 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
USP17L1Q7RTZ2 C1orf162-201ENST00000343534 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
USP17L1Q7RTZ2 RNA5SP350-201ENST00000363298 111 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
USP17L1Q7RTZ2 Y_RNA.296-201ENST00000364930 108 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
USP17L1Q7RTZ2 SNORD116-23-201ENST00000384645 92 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
USP17L1Q7RTZ2 KRTAP29-1-201ENST00000391353 1026 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
USP17L1Q7RTZ2 CCNG1P1-201ENST00000406783 885 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
USP17L1Q7RTZ2 BOLA3P4-201ENST00000418151 400 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
USP17L1Q7RTZ2 AL121878.1-201ENST00000418638 859 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
USP17L1Q7RTZ2 RPL7P30-201ENST00000420888 709 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
USP17L1Q7RTZ2 DYDC1-203ENST00000421924 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
USP17L1Q7RTZ2 AL445123.1-201ENST00000422023 446 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
USP17L1Q7RTZ2 MTCO3P1-205ENST00000422088 832 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
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USP17L1Q7RTZ2 AC018793.1-201ENST00000638166 585 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
USP17L1Q7RTZ2 RALBP1-206ENST00000609094 3676 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
USP17L1Q7RTZ2 ZNF192P1-201ENST00000440790 1628 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
USP17L1Q7RTZ2 BTN3A2-201ENST00000356386 3017 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
USP17L1Q7RTZ2 MUT-201ENST00000274813 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
USP17L1Q7RTZ2 AC025809.2-201ENST00000625085 1802 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
USP17L1Q7RTZ2 CEP57L1-203ENST00000368970 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
USP17L1Q7RTZ2 SLC17A8-201ENST00000323346 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
USP17L1Q7RTZ2 PSMD6-202ENST00000394431 1349 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
USP17L1Q7RTZ2 OR51E1-201ENST00000396952 3612 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
USP17L1Q7RTZ2 RPL37A-210ENST00000491306 3647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
USP17L1Q7RTZ2 RAD23B-202ENST00000416373 3835 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
USP17L1Q7RTZ2 KCNMB2-210ENST00000617329 2214 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
USP17L1Q7RTZ2 C11orf63-203ENST00000531316 2782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
USP17L1Q7RTZ2 CPS1-212ENST00000619804 1542 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
USP17L1Q7RTZ2 ZNF227-202ENST00000391961 2993 ntTSL 4 BASIC7.47□□□□□ -1.21
USP17L1Q7RTZ2 LCP2-201ENST00000046794 4678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
USP17L1Q7RTZ2 VWA5A-203ENST00000392748 3419 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
USP17L1Q7RTZ2 AMOT-203ENST00000371959 7319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
USP17L1Q7RTZ2 CC2D2B-202ENST00000410012 1792 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.21
USP17L1Q7RTZ2 CPED1-206ENST00000450913 2501 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
USP17L1Q7RTZ2 MEIOC-202ENST00000409464 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.21
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