Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 AC005911.1-201ENST00000619883 456 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
RTL8BQ17RB0 CASC19-222ENST00000641321 1173 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
RTL8BQ17RB0 DTNA-203ENST00000315456 1706 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
RTL8BQ17RB0 SERPINA7-202ENST00000372563 1600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
RTL8BQ17RB0 ALS2CR12-201ENST00000286190 1769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
RTL8BQ17RB0 ZNF107-203ENST00000395391 6094 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
RTL8BQ17RB0 AC132825.1-201ENST00000463573 2247 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
RTL8BQ17RB0 HELLS-204ENST00000371332 2675 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
RTL8BQ17RB0 CCDC14-217ENST00000485727 7917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
RTL8BQ17RB0 ARHGAP21-218ENST00000636789 4210 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.82
RTL8BQ17RB0 LYST-201ENST00000389793 13480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.82
RTL8BQ17RB0 CFAP70-203ENST00000355577 3691 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.82
RTL8BQ17RB0 ARL15-202ENST00000504924 2486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
RTL8BQ17RB0 ARL15-207ENST00000620747 2486 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.82
RTL8BQ17RB0 SYCP1-210ENST00000618516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
RTL8BQ17RB0 VN2R3P-201ENST00000422626 1412 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 MUCL1-201ENST00000308796 470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 IFNA21-201ENST00000380225 1024 ntAPPRIS P1 BASIC3.65□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 AC019155.1-201ENST00000382242 574 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 LINC01945-201ENST00000419784 840 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 AC073335.1-201ENST00000427776 363 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 AL133268.3-201ENST00000428903 577 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 AP000770.1-201ENST00000444123 583 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 AP000146.1-203ENST00000444178 309 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 RGS1-203ENST00000469578 1034 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 AC090013.1-201ENST00000485147 480 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 AC079209.1-201ENST00000519412 820 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 AC024958.1-203ENST00000520256 577 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 OSBPL9P2-201ENST00000526582 1228 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 AP001978.1-201ENST00000526851 834 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 DERA-209ENST00000532964 854 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 AC126178.1-201ENST00000548722 926 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 OR1AB1P-201ENST00000585564 761 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 LINC02565-201ENST00000592678 478 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 AL139041.1-201ENST00000605480 610 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 AP002360.3-201ENST00000607673 710 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 AC211433.2-201ENST00000608433 387 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 AC015813.4-201ENST00000610469 179 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 AL353726.1-201ENST00000614041 1000 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 AC023509.5-201ENST00000617434 807 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 AC090510.2-201ENST00000617465 629 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 AC007546.2-201ENST00000623996 360 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 WDR75-207ENST00000631047 270 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 PATJ-202ENST00000316485 3657 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 AC010132.3-201ENST00000442788 2430 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 KPNA2P2-201ENST00000419546 1489 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 NKTR-219ENST00000617821 7319 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 TAB3-204ENST00000378932 3698 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 FAM107B-229ENST00000622567 3510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 OR14L1P-202ENST00000641545 3009 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 PREPL-206ENST00000409936 5212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 RNF145-201ENST00000274542 3364 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 KARSP3-201ENST00000571212 1504 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 AJ009632.2-202ENST00000634644 1513 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 CENPI-201ENST00000372926 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 EIF2S1-202ENST00000466499 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 CPHL1P-201ENST00000461341 3407 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 ENOX2-202ENST00000370927 3788 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 STXBP4-201ENST00000376352 15590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 OR2L5-201ENST00000355281 2429 ntAPPRIS P1 BASIC3.64□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 TCN1-201ENST00000257264 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 GPX8-203ENST00000503787 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 AGTR1-202ENST00000402260 2172 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 ABCA8-215ENST00000615593 3264 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 TMEM251-201ENST00000283534 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 RNA5SP307-201ENST00000362863 116 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 TNFRSF17-202ENST00000396495 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 GSTM3P2-201ENST00000412746 530 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 AC104837.2-201ENST00000427236 424 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 SKP1P3-201ENST00000429280 487 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 ARHGAP26-IT1-201ENST00000433186 388 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
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RTL8BQ17RB0 OR5M7P-201ENST00000526140 972 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 LINC01355-202ENST00000604481 400 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
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RTL8BQ17RB0 CCT5-215ENST00000625723 135 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 AL355480.1-201ENST00000629041 99 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 AJ009632.2-207ENST00000634659 527 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 AL359313.1-202ENST00000635073 544 ntTSL 4 BASIC3.64□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 MNS1-201ENST00000260453 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 SLC44A5-202ENST00000370859 3896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 AC096751.1-201ENST00000515178 2202 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 UBE2W-207ENST00000602593 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 SYTL2-217ENST00000528231 3536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 UGT2B17-201ENST00000317746 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 LINC02085-201ENST00000465215 2051 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 THOC2-202ENST00000355725 4930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 ZNF560-201ENST00000301480 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 EXO1-208ENST00000518483 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 WNK3-202ENST00000375159 5403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
RTL8BQ17RB0 DNAJC28-202ENST00000381947 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
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