Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 SYCP1-210ENST00000618516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 OR56B2P-201ENST00000317102 954 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 RNA5SP447-201ENST00000363749 119 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 MIR129-1-201ENST00000384972 72 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 RPS20P25-201ENST00000412447 352 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 AL512504.1-201ENST00000415494 778 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 AC004690.1-201ENST00000418216 328 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 AC034195.1-201ENST00000420000 559 ntTSL 4 BASIC4.63□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 RPL36AP10-201ENST00000421785 322 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 AL356806.1-201ENST00000422524 916 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 AL360227.1-201ENST00000425364 433 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 AL139294.1-201ENST00000435739 512 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 ATP5A1P7-201ENST00000453978 1279 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 ISCUP1-201ENST00000454451 448 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 AC103987.1-201ENST00000473394 348 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 TFDP2-211ENST00000479040 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 PTPN20-213ENST00000502705 854 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 AC067904.2-201ENST00000517322 1283 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 LINC02404-201ENST00000546710 1188 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 AC074029.2-201ENST00000551045 634 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 AC092868.3-201ENST00000560515 784 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 LINC00511-212ENST00000581183 657 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 AC011507.1-201ENST00000585364 567 ntTSL 4 BASIC4.63□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 LINC00904-201ENST00000604453 471 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 AC100814.1-201ENST00000606963 623 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 OR7A19P-201ENST00000608051 733 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 LAMTOR5-AS1-217ENST00000608152 407 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 LAMTOR5-AS1-227ENST00000609653 457 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 AL355306.2-208ENST00000634868 1251 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 OR52N4-202ENST00000641350 1276 ntAPPRIS P1 BASIC4.63□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 WDR63-203ENST00000370596 2905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 ECM2-202ENST00000375540 1606 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 RGS5-201ENST00000313961 5862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 XIRP2-207ENST00000628543 12182 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 AC027228.2-201ENST00000567141 2154 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 POLR2B-203ENST00000431623 3666 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 HACD3-211ENST00000569894 1471 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 AC007342.7-201ENST00000624610 2337 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 OBSCN-210ENST00000570156 26925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 INTU-201ENST00000335251 13233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 MYO9A-203ENST00000444904 7749 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 RNU4-39P-201ENST00000362455 127 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 OR51A2-201ENST00000380371 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.62□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 GNG5P5-201ENST00000420444 220 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 CHIAP3-201ENST00000423668 1133 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 RPEP3-201ENST00000425462 676 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 PCBP1-AS1-224ENST00000429599 1045 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 RPL12P28-201ENST00000430852 489 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 AC093716.1-201ENST00000435923 377 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 MTCYBP29-201ENST00000436327 1006 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 AC006037.1-201ENST00000437967 287 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 AL512303.1-201ENST00000458693 465 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 MME-AS1-201ENST00000484721 828 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 AC069304.1-201ENST00000491593 704 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 AC083829.1-201ENST00000503756 657 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 RPS27AP18-201ENST00000515536 459 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 PPP1R42-212ENST00000522909 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 TOMM20P2-201ENST00000540082 421 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 AC126178.1-201ENST00000548722 926 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 LINC02301-201ENST00000553760 773 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 AC013652.1-202ENST00000561058 570 ntTSL 4 BASIC4.62□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 AC068112.1-201ENST00000580057 346 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 AC022916.2-201ENST00000590144 559 ntTSL 4 BASIC4.62□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 MIR99AHG-211ENST00000602323 475 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 MTCO2P22-201ENST00000603246 681 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 AC090953.1-201ENST00000604305 1092 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 AL356218.2-201ENST00000605264 187 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 AC020658.4-201ENST00000613987 684 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 ZNF479-203ENST00000620639 1239 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 AC107398.4-201ENST00000635489 765 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 MIR6830-201ENST00000636015 70 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 FAM49B-230ENST00000639004 837 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 AP000542.2-201ENST00000623199 6179 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 ARPP21-202ENST00000396481 1304 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 KCNH7-205ENST00000621889 1893 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 ZNF137P-201ENST00000456718 1920 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 MTRNR2L7-201ENST00000544824 1535 ntAPPRIS P1 BASIC4.62□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 AC120338.1-201ENST00000625074 1541 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 OR8H2-203ENST00000641311 3092 ntAPPRIS P2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 STARD4-201ENST00000296632 4606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 LIMA1-214ENST00000552783 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 MYBPC1-201ENST00000361466 3899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 FKBP7-204ENST00000424785 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 MUC12-202ENST00000379442 16737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 OR14L1P-202ENST00000641545 3009 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 SCN1A-201ENST00000303395 8533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 STARD9-201ENST00000290607 15567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 CDC23-202ENST00000394886 3155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 C10orf120-201ENST00000329446 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 AC083799.1-201ENST00000366451 910 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 RNU6-152P-201ENST00000384037 107 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 MIR659-201ENST00000384963 97 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 ATXN10-203ENST00000402380 564 ntTSL 4 BASIC4.61□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 AMZ2P2-201ENST00000406819 1057 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 BTF3P9-201ENST00000418784 283 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 AL732292.1-201ENST00000426692 226 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 AL139824.1-201ENST00000431983 453 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 MTUS2-AS2-202ENST00000434779 720 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 AL139327.2-202ENST00000437057 400 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
CDKN3Q16667 AC009963.2-201ENST00000453431 138 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
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