Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 PRRC2CP1-201ENST00000404428 159 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 AC004022.2-201ENST00000413824 193 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 AK4P4-201ENST00000419465 646 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 AC027644.1-201ENST00000419595 298 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 FNDC1-IT1-201ENST00000419703 516 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 RPL36AP10-201ENST00000421785 322 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 AC007394.1-201ENST00000421941 531 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 AL136131.2-201ENST00000424283 348 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 IPMKP1-201ENST00000425988 855 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 AL136980.1-201ENST00000426764 543 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 RPL35AP21-201ENST00000437667 333 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 AC024597.1-201ENST00000442753 706 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 AL392089.1-202ENST00000444793 449 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 ATP5A1P7-201ENST00000453978 1279 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 AC104164.3-201ENST00000467363 1258 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 SNORA70.20-201ENST00000516848 126 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 AC021678.3-201ENST00000517893 476 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 AC091163.3-201ENST00000518269 1144 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 AC083923.2-203ENST00000520512 372 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 AF279873.1-201ENST00000523393 313 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 VNN2-207ENST00000525289 900 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 AC244502.1-203ENST00000541008 576 ntTSL 4 BASIC5.65□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 AC024909.1-201ENST00000549278 599 ntTSL 4 BASIC5.65□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 GNG2-208ENST00000554875 430 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 SRP54-AS1-203ENST00000556355 603 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 LINC00933-205ENST00000560917 449 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 BPTFP1-201ENST00000579209 492 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 AC245884.10-201ENST00000597355 337 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 AC096947.1-201ENST00000603233 470 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 AC244472.1-201ENST00000620773 347 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 PDCD6IPP1-202ENST00000622242 1064 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 Metazoa_SRP.130-201ENST00000622625 267 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 PCBP1-AS1-278ENST00000625518 864 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
BRD3Q15059 LINS1-214ENST00000561308 1612 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 SMC2-AS1-201ENST00000603487 7020 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 POU2F1-212ENST00000541643 13937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 FAM135A-210ENST00000505868 5173 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 POMP-202ENST00000460403 1428 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 AC106872.5-201ENST00000508856 1416 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 ZEB1-208ENST00000542815 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 ZBED6-201ENST00000545588 7979 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 PIK3C3-217ENST00000639914 2722 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 AKAP9-201ENST00000356239 12471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 PCDH15-214ENST00000395446 3948 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 TET2-203ENST00000380013 9679 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 PTRH2-203ENST00000470557 4114 ntAPPRIS P3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 RPL9-201ENST00000295955 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 SNORA64.1-201ENST00000362600 132 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 MIR16-1-201ENST00000385271 89 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 POLR1D-202ENST00000399696 668 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 CoTC_ribozyme.1-201ENST00000408104 192 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 RPS7P9-201ENST00000414704 586 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 PAICSP7-201ENST00000419829 962 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 RPL30P3-201ENST00000424262 333 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 AL451070.1-201ENST00000430143 439 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 AC012668.2-201ENST00000431727 503 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 LINC01598-201ENST00000432067 460 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 AL591848.2-201ENST00000442712 522 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 RPL36AP39-201ENST00000445859 318 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 HRAT17-201ENST00000447785 547 ntTSL 4 BASIC5.64□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 IFNWP4-201ENST00000453148 294 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 TVP23BP2-201ENST00000455082 615 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 AC022133.1-201ENST00000490961 571 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 C1orf143-202ENST00000491260 813 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 AC009120.1-201ENST00000493458 473 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 GYPA-204ENST00000504786 357 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 AC093903.1-201ENST00000507220 405 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 AC093752.1-206ENST00000511823 336 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 RGS4-207ENST00000527809 817 ntTSL 4 BASIC5.64□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 AP000648.1-201ENST00000529682 397 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 GPRC5D-AS1-205ENST00000540198 404 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 AL356804.1-201ENST00000553791 448 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 FRMD6-AS2-201ENST00000556617 548 ntTSL 4 BASIC5.64□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 AC092078.2-201ENST00000560900 581 ntTSL 4 BASIC5.64□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 AP001542.2-201ENST00000593141 364 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 AC105148.1-201ENST00000604961 409 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 AL392112.1-201ENST00000605115 829 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 AC112220.2-201ENST00000605513 533 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 AL031601.1-201ENST00000605702 394 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 Metazoa_SRP.43-201ENST00000616394 271 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 GPR34-203ENST00000620846 1282 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 AC104985.3-201ENST00000623479 597 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 AC092813.1-201ENST00000635455 969 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 CTAGE5-208ENST00000553352 3441 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 DNAH7-202ENST00000409063 1845 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 LGI1-228ENST00000637689 1802 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 SGO1P1-201ENST00000603525 1447 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 UGT8-202ENST00000394511 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 RNF182-207ENST00000537663 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.63□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 HMCN1-201ENST00000271588 18208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 FLJ46284-201ENST00000504861 3421 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 LINC02516-201ENST00000563724 1771 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 MUC2-202ENST00000613187 4845 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 RABGAP1L-205ENST00000367687 1849 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 PTPRD-203ENST00000381196 9911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 HMMR-203ENST00000393915 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 AC138409.2-201ENST00000514048 5001 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 OR1L1-201ENST00000309623 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 ANKRD36P1-201ENST00000344424 659 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
BRD3Q15059 OR6K2-201ENST00000359610 975 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.5 ms