Protein–RNA interactions for Protein: Q13643

FHL3, Four and a half LIM domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHL3Q13643 MRPL42-203ENST00000547098 701 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
FHL3Q13643 AC034102.2-201ENST00000548861 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
FHL3Q13643 AC004551.1-201ENST00000552784 575 ntTSL 4 BASIC4.68□□□□□ -1.66
FHL3Q13643 OTX2-203ENST00000554559 715 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
FHL3Q13643 AL162464.1-201ENST00000557642 554 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
FHL3Q13643 AL136084.2-213ENST00000585704 690 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
FHL3Q13643 AL136084.2-212ENST00000589976 654 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
FHL3Q13643 AC141002.1-201ENST00000607025 279 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
FHL3Q13643 AC073114.1-201ENST00000612027 490 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
FHL3Q13643 U1.25-201ENST00000614085 162 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
FHL3Q13643 AC015712.7-201ENST00000615211 635 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
FHL3Q13643 LAMTOR5-AS1-233ENST00000625451 470 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
FHL3Q13643 HIPK1-204ENST00000369555 3966 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
FHL3Q13643 LINC02421-201ENST00000542219 3135 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
FHL3Q13643 OR10A6-204ENST00000642108 6104 ntAPPRIS P1 BASIC4.68□□□□□ -1.66
FHL3Q13643 BMPR1APS1-201ENST00000403332 1598 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
FHL3Q13643 UBR4-204ENST00000375254 15906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
FHL3Q13643 PHC3-214ENST00000494943 5030 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
FHL3Q13643 ST7-212ENST00000422922 1887 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
FHL3Q13643 AC107081.3-201ENST00000612715 2034 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
FHL3Q13643 AMY2B-201ENST00000361355 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
FHL3Q13643 ANKRD17-203ENST00000509867 8105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
FHL3Q13643 NFKBIZ-203ENST00000394054 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
FHL3Q13643 FANCD2-205ENST00000431693 2450 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
FHL3Q13643 AC009095.1-201ENST00000388909 1326 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
FHL3Q13643 CCDC129-211ENST00000615280 4142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
FHL3Q13643 CFH-201ENST00000359637 1454 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
FHL3Q13643 RFC1-201ENST00000349703 4859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
FHL3Q13643 ZNF532-222ENST00000591083 5324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
FHL3Q13643 RGPD2-203ENST00000638730 5306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
FHL3Q13643 AC104024.1-201ENST00000428142 2201 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
FHL3Q13643 HELLS-204ENST00000371332 2675 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
FHL3Q13643 AC010266.2-201ENST00000564741 3255 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
FHL3Q13643 ZNF677-201ENST00000333952 3422 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
FHL3Q13643 LNX2-201ENST00000316334 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
FHL3Q13643 BDNF-210ENST00000438929 4059 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
FHL3Q13643 MYB-226ENST00000528774 2277 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
FHL3Q13643 CD200R1-201ENST00000295863 1692 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
FHL3Q13643 AJ009632.2-202ENST00000634644 1513 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
FHL3Q13643 ECT2-216ENST00000540509 4406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
FHL3Q13643 PSG7-206ENST00000623675 1392 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
FHL3Q13643 ANKRD12-201ENST00000262126 11288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
FHL3Q13643 SELE-204ENST00000367776 3576 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
FHL3Q13643 SELE-205ENST00000367777 3576 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
FHL3Q13643 CWF19L2-201ENST00000282251 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
FHL3Q13643 BANK1-203ENST00000444316 3141 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
FHL3Q13643 CTDSPL2-204ENST00000558966 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
FHL3Q13643 GTF3C3-202ENST00000409364 1736 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
FHL3Q13643 SLC39A12-201ENST00000377369 2808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
FHL3Q13643 MID1-206ENST00000380787 5973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
FHL3Q13643 GNS-202ENST00000418919 4877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
FHL3Q13643 ZNF26-202ENST00000534834 4853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
FHL3Q13643 ZFYVE9-202ENST00000357206 4567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
FHL3Q13643 DCAF8L1-201ENST00000441525 3457 ntAPPRIS P1 BASIC4.67□□□□□ -1.66
FHL3Q13643 PUM2-201ENST00000319801 6002 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
FHL3Q13643 ZNF418-212ENST00000616958 2212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
FHL3Q13643 AFF2-203ENST00000370457 3952 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
FHL3Q13643 AP3B1-204ENST00000519295 3986 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
FHL3Q13643 USMG5-201ENST00000309579 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
FHL3Q13643 REP15-201ENST00000310791 1078 ntAPPRIS P1 BASIC4.67□□□□□ -1.66
FHL3Q13643 RNA5SP273-201ENST00000362484 113 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
FHL3Q13643 RNU1-85P-201ENST00000364127 164 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
FHL3Q13643 RNU105B-201ENST00000364478 208 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
FHL3Q13643 RAET1L-202ENST00000367341 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
FHL3Q13643 Y_RNA.505-201ENST00000384489 102 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
FHL3Q13643 ATP5F1P4-201ENST00000397288 746 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
FHL3Q13643 HYKK-202ENST00000408962 847 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
FHL3Q13643 AL133384.1-201ENST00000412744 351 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
FHL3Q13643 CEACAMP8-201ENST00000413902 580 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
FHL3Q13643 TRAPPC2P10-201ENST00000415662 323 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
FHL3Q13643 LINC01198-201ENST00000416521 500 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
FHL3Q13643 VDAC1P6-201ENST00000430062 855 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
FHL3Q13643 KCTD10P1-201ENST00000434203 625 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
FHL3Q13643 AC108488.1-202ENST00000439547 482 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
FHL3Q13643 CYCSP51-201ENST00000443545 318 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
FHL3Q13643 MTND1P1-201ENST00000445453 368 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
FHL3Q13643 AC034228.3-201ENST00000446275 562 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
FHL3Q13643 PRR16-203ENST00000446965 1152 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
FHL3Q13643 AL513422.1-201ENST00000449531 383 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
FHL3Q13643 AC016027.4-201ENST00000450866 277 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
FHL3Q13643 SUN3-208ENST00000453192 801 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
FHL3Q13643 HLA-DPA3-207ENST00000454398 229 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
FHL3Q13643 RPL18AP17-201ENST00000455326 198 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
FHL3Q13643 AC004692.2-201ENST00000457315 355 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
FHL3Q13643 AC112206.1-201ENST00000468416 477 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
FHL3Q13643 OR52A4P-201ENST00000472867 958 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
FHL3Q13643 AC114728.1-201ENST00000488289 483 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
FHL3Q13643 MSMO1-203ENST00000504317 1026 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
FHL3Q13643 AC093752.2-201ENST00000506942 573 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
FHL3Q13643 AC097467.3-213ENST00000508191 726 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
FHL3Q13643 HTN1-204ENST00000511674 623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
FHL3Q13643 AC096736.1-201ENST00000512609 947 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
FHL3Q13643 RNU6-583P-201ENST00000516012 92 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
FHL3Q13643 TBCA-206ENST00000518338 551 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
FHL3Q13643 LINC02055-205ENST00000521090 774 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
FHL3Q13643 AC011363.1-201ENST00000524198 458 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
FHL3Q13643 AC092851.1-201ENST00000535964 478 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
FHL3Q13643 AC009803.2-201ENST00000550378 665 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
FHL3Q13643 LINC01146-208ENST00000557355 548 ntTSL 4 BASIC4.67□□□□□ -1.66
FHL3Q13643 INO80-AS1-201ENST00000558967 312 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
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