Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 RMST-202ENST00000541282 2099 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 OR6B1-202ENST00000641698 5153 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 VDAC3-201ENST00000022615 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 SESN1-201ENST00000302071 2718 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 LMNTD1-202ENST00000413632 1520 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 CDKL3-210ENST00000523832 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 AC083843.3-201ENST00000623679 2186 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 PCDH15-212ENST00000395442 2970 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 C8orf22-201ENST00000303202 1499 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 PLCB4-204ENST00000378501 5833 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 ALS2CR12-202ENST00000392257 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 AL731566.1-201ENST00000620490 1937 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 CHRM2-203ENST00000445907 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 OR14A2-201ENST00000366485 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 CCL7-203ENST00000394630 687 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 DNAJA1P4-201ENST00000406473 1166 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 AC104389.1-201ENST00000418080 522 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 OR51A6P-201ENST00000418680 1004 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 AC021035.1-201ENST00000421597 427 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 AC241520.1-201ENST00000422654 1099 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 PTP4A1P7-201ENST00000423476 514 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 AP000233.1-201ENST00000426609 291 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 AP000936.3-201ENST00000438127 255 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 AL163193.1-201ENST00000444895 788 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 AL138767.2-201ENST00000446794 168 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 TTTY19-201ENST00000453955 269 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 RNU7-27P-201ENST00000459281 62 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 AC000372.1-201ENST00000488818 646 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 DWORF-201ENST00000489090 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 COX6B1P5-201ENST00000509843 249 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 RN7SKP260-201ENST00000516907 149 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 THUMPD3-AS1-215ENST00000521609 793 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 AC018442.3-201ENST00000523025 183 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 AP002518.1-201ENST00000534904 3837 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 AC023906.4-201ENST00000557898 895 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 AC016134.1-201ENST00000565259 701 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 AC010735.1-201ENST00000567305 1026 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 CYCSP40-201ENST00000575927 294 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 MOCS2-209ENST00000582677 741 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 MIR4691-201ENST00000583764 85 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 AC068408.2-201ENST00000584566 439 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 AC245884.10-201ENST00000597355 337 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 TAS2R6P-201ENST00000605022 826 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 AC245452.5-201ENST00000620649 780 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 AC015871.5-202ENST00000623252 701 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 TEX41-254ENST00000626394 423 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 VPS13D-213ENST00000613099 16245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 LINC00862-204ENST00000637098 1400 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 DCTN4-201ENST00000424236 4054 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 FAM197Y3-202ENST00000427622 2325 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 FAM197Y7-202ENST00000433321 2325 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 AC017007.4-201ENST00000503353 1352 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 AL132640.2-201ENST00000559968 1698 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CUL4BQ13620 SCARNA15-201ENST00000607520 4325 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 CEP112-204ENST00000537949 2847 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 SP110-202ENST00000258382 2080 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 HSPD1P14-201ENST00000432666 1618 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 ZNF468-203ENST00000595646 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 MYNN-203ENST00000544106 4815 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 RASAL2-203ENST00000462775 14453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 FABP4-201ENST00000256104 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 TFPI-202ENST00000339091 1088 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 SNORA72.3-201ENST00000365074 132 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 RNU1-106P-201ENST00000384382 164 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 IGLJ6-201ENST00000390328 70 ntAPPRIS P1 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 AP000534.2-201ENST00000412729 568 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 HMGB3P31-201ENST00000413333 595 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 AL365184.1-201ENST00000413801 572 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 AC073310.1-201ENST00000423226 1033 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 LINC01611-201ENST00000428896 477 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 AL139819.1-201ENST00000429420 471 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 RPL34P6-201ENST00000432390 345 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 RPS7P2-201ENST00000435134 607 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 AC004824.1-201ENST00000439577 311 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 AL353093.1-201ENST00000441292 436 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 OR7E125P-201ENST00000443450 846 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 AC064871.1-201ENST00000444562 427 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 RHEBP2-201ENST00000450289 600 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 GYG1P1-201ENST00000460864 698 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 AC018635.1-201ENST00000468292 1030 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 RPL21P18-201ENST00000469899 480 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 AC090686.1-201ENST00000481577 749 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 AC096773.1-201ENST00000506852 648 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 RNA5SP249-201ENST00000516127 99 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 RNA5SP92-201ENST00000516437 110 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 AC062004.1-201ENST00000518706 686 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 AC131254.2-201ENST00000521908 550 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 AC073172.2-201ENST00000527770 571 ntTSL 4 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 SNHG1-204ENST00000537068 629 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 AC011595.3-201ENST00000546699 632 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 NMNAT1P1-201ENST00000554095 876 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 LINC01859-201ENST00000565584 1024 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 AC005324.5-201ENST00000584540 571 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 CXXC1P1-203ENST00000589302 746 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 AC015802.3-201ENST00000590241 570 ntTSL 4 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 AP002802.2-201ENST00000605877 235 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 AC017076.1-201ENST00000607613 578 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 OR5H6-201ENST00000615035 1113 ntAPPRIS P1 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 AL049794.2-201ENST00000616301 365 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CUL4BQ13620 ZNF75A-210ENST00000617839 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.7 ms