Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 OR8B3-202ENST00000641139 2170 ntAPPRIS P1 BASIC8.06□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 HEATR1-201ENST00000366579 793 ntTSL 2 BASIC8.06□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 TRDC-201ENST00000390477 720 ntAPPRIS P1 BASIC8.06□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 TRAJ38-201ENST00000390499 62 ntAPPRIS P1 BASIC8.06□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 RSL24D1P4-201ENST00000400938 484 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 AL512422.1-201ENST00000407033 553 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 MOB4-205ENST00000409916 829 ntTSL 3 BASIC8.06□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 MTND4P3-201ENST00000417829 541 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 AC009498.1-201ENST00000419860 541 ntTSL 4 BASIC8.06□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 GLUD1P9-201ENST00000420997 1173 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 OR10T1P-201ENST00000424327 947 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 AL360007.1-201ENST00000426166 349 ntTSL 3 BASIC8.06□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 DPRXP1-201ENST00000426312 460 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 OR2B8P-201ENST00000432841 938 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 AL590399.3-201ENST00000438072 543 ntTSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 CD200R1-203ENST00000440122 847 ntTSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 CD200R1L-202ENST00000448932 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 AL513422.1-201ENST00000449531 383 ntTSL 2 BASIC8.06□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 RN7SL174P-201ENST00000475578 289 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 SLC9A9-AS1-201ENST00000479030 518 ntTSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 RN7SL101P-201ENST00000496350 279 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 BAALC-AS1-205ENST00000521102 613 ntTSL 3 BASIC8.06□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 OR5AM1P-201ENST00000532136 1032 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 ELOCP32-201ENST00000548625 324 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 AC087897.1-201ENST00000550134 156 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 BLZF2P-201ENST00000553776 1130 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 POU1F1-203ENST00000560656 647 ntTSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 LINC01904-201ENST00000564872 861 ntTSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 MTND4LP24-201ENST00000572277 291 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 GTSCR1-201ENST00000582578 470 ntTSL 3 BASIC8.06□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 AC006270.1-201ENST00000582889 478 ntTSL 3 BASIC8.06□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 NDUFV2-AS1-202ENST00000583081 399 ntTSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 AC104365.1-202ENST00000587080 398 ntTSL 3 BASIC8.06□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 ZRANB2-AS2-212ENST00000590186 686 ntTSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 AL583832.1-201ENST00000603227 784 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 IGKV1OR2-9-201ENST00000603957 287 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 IGKV1OR2-11-201ENST00000604120 287 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 AP001330.5-201ENST00000607176 411 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 SCOC-AS1-203ENST00000609616 405 ntTSL 3 BASIC8.06□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 AC010632.3-201ENST00000611377 369 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 AL356121.2-201ENST00000624715 780 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 LINC01359-206ENST00000634775 888 ntTSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 AP000550.3-201ENST00000637734 379 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 SRGAP1-201ENST00000355086 23331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 AMY1C-201ENST00000370079 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 CD86-204ENST00000469710 1604 ntTSL 2 BASIC8.06□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 LINC02047-201ENST00000494761 1371 ntTSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 DLGAP1-AS2-202ENST00000573177 1388 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 ZNF429-209ENST00000618549 1889 ntTSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 CUBN-202ENST00000377833 11949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 ROR1-204ENST00000545203 5362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 CCDC178-209ENST00000579947 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 SLC4A10-202ENST00000375514 5710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.06□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 AP005212.5-201ENST00000577614 3505 ntTSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 RBMS1-203ENST00000409075 1550 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 AFP-201ENST00000226359 1914 ntTSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 SUPT3H-203ENST00000371460 2389 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 PSG1-202ENST00000312439 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 DIAPH3-208ENST00000498416 2249 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 ANKRD49-208ENST00000544253 3002 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 ZC2HC1B-201ENST00000237275 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 COX7B2-201ENST00000355591 542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 CDC123-202ENST00000378900 933 ntTSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 RNU6-1005P-201ENST00000384519 107 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 PIGP-204ENST00000399102 688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 AL590084.1-201ENST00000407885 387 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 PPP1R1C-203ENST00000409702 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 AF064860.1-201ENST00000416555 544 ntTSL 3 BASIC8.05□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 AL357832.1-201ENST00000427460 420 ntTSL 3 BASIC8.05□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 AC018832.1-201ENST00000428171 566 ntTSL 4 BASIC8.05□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 AL713851.2-201ENST00000431209 332 ntTSL 2 BASIC8.05□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 REG1CP-203ENST00000434852 460 ntTSL 4 BASIC8.05□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 AL136972.1-201ENST00000443471 351 ntTSL 3 BASIC8.05□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 AC016724.1-201ENST00000453215 421 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 LMOD2-201ENST00000456238 918 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 RPSAP39-201ENST00000467439 883 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 RPL35AP19-201ENST00000469425 329 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 RPS27AP16-201ENST00000492222 470 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 LINC01609-201ENST00000519506 424 ntTSL 3 BASIC8.05□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 OR8I1P-201ENST00000529291 931 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 LINC02375-201ENST00000545739 852 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 AC093025.1-201ENST00000547795 569 ntTSL 2 BASIC8.05□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 ADI1P3-201ENST00000549509 470 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 AL359233.1-201ENST00000554029 364 ntTSL 3 BASIC8.05□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 AC066613.1-201ENST00000559977 1053 ntTSL 2 BASIC8.05□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 C15orf41-205ENST00000563167 772 ntTSL 3 BASIC8.05□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 PDCD6IPP2-207ENST00000566321 1069 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 BCAR4-204ENST00000573319 1273 ntTSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 AC015845.2-201ENST00000581805 472 ntTSL 2 BASIC8.05□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 ZNF66-203ENST00000594534 757 ntTSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 VN1R90P-201ENST00000595717 726 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 AL020997.3-201ENST00000602843 359 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 AL606834.2-201ENST00000602954 668 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 AC106791.2-201ENST00000604680 391 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 AC126118.1-201ENST00000607744 628 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 AC079395.2-201ENST00000610982 737 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 AL118522.2-201ENST00000616045 615 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 PDCD6IPP1-202ENST00000622242 1064 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 LINC01320-210ENST00000626008 929 ntTSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
NEUROD1Q13562 AC011287.1-204ENST00000640300 1213 ntTSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
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