Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 RN7SKP288-201ENST00000516227 268 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 RNU6-416P-201ENST00000516265 103 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 AC016074.1-201ENST00000518339 636 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 ZNF436-AS1-205ENST00000518600 376 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 IGHV7-34-1-201ENST00000519200 350 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 AC078899.1-201ENST00000521432 1185 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 AC138832.1-201ENST00000522871 556 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 AL356215.1-201ENST00000528366 1102 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 NPIPB14P-203ENST00000532298 987 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 SNHG1-217ENST00000541578 588 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 AP002383.3-201ENST00000545958 593 ntTSL 4 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 OR6C7P-201ENST00000547875 934 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 AC012555.2-201ENST00000549448 413 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 AC074029.1-201ENST00000552531 1044 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 AC244502.3-201ENST00000555460 457 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 AP005205.1-201ENST00000563503 508 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 AC025809.1-201ENST00000585336 560 ntTSL 4 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 AC026898.1-201ENST00000586404 571 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 OR4G1P-201ENST00000588632 938 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 ELOCP28-201ENST00000590044 317 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 AC239809.3-206ENST00000596091 741 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 ZNF137P-202ENST00000597158 308 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 AC007953.2-201ENST00000603299 193 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 AC012368.3-201ENST00000604190 219 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 AC022001.1-201ENST00000605193 268 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 AC244196.4-201ENST00000611787 392 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 MIR6811-201ENST00000620409 58 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 AC022400.9-201ENST00000623633 273 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 AL161457.2-202ENST00000629161 743 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 LGALS8-204ENST00000352231 1402 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 PDE7A-201ENST00000379419 2425 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 FKBP7-204ENST00000424785 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 TET1-201ENST00000373644 9288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 LINC01748-203ENST00000634836 3229 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 GRIA4-204ENST00000428631 2778 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 KMO-202ENST00000366557 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 ELMO1-203ENST00000396045 2524 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 GBP3-202ENST00000370481 3067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 AC011416.1-201ENST00000514947 1732 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 PIP5K1B-201ENST00000265382 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 OR4F17-202ENST00000585993 2669 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 ZNF160-203ENST00000429604 4336 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 AC098679.1-203ENST00000505532 2227 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 NR3C2-202ENST00000344721 5712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 FABP4-201ENST00000256104 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 OR51J1-201ENST00000332043 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 WFDC8-202ENST00000357199 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 Y_RNA.88-201ENST00000363029 99 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 RNU1-49P-201ENST00000363468 159 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 RNU6-532P-201ENST00000384318 107 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 PRELID1P1-201ENST00000403549 660 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 AL513325.1-201ENST00000417716 1034 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 LINC02541-201ENST00000427157 327 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 AC114808.2-201ENST00000428335 536 ntTSL 4 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 LINC01078-201ENST00000434832 387 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 RPL12P18-201ENST00000437175 325 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 TRIM31-AS1-204ENST00000440874 549 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 AL121917.1-201ENST00000441270 893 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 GAPDHP23-201ENST00000444823 993 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 AL161722.1-201ENST00000446972 1032 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 AL592447.1-201ENST00000447592 540 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 AL445991.1-201ENST00000450381 475 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 AC093392.2-201ENST00000450682 337 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 FRG2FP-204ENST00000453982 852 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 DNAJC19P1-201ENST00000455312 319 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 AL359385.1-201ENST00000456509 365 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 MRPS33-203ENST00000467334 622 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 PLSCR5-AS1-201ENST00000473817 450 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 AC114324.2-202ENST00000503812 134 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 AC012629.1-201ENST00000503953 342 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
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TOP3AQ13472 AC025881.1-201ENST00000518851 512 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 IGHVIII-11-1-201ENST00000522733 267 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 AC109635.6-201ENST00000525487 1113 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 AP001267.3-204ENST00000528578 423 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 AP004609.2-201ENST00000532177 190 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 AP001893.1-201ENST00000532866 362 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 AP001858.2-201ENST00000536213 601 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 AKAP7-208ENST00000537868 1006 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 AAGAB-203ENST00000542650 1015 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 LINC00944-204ENST00000544499 366 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 SPINK14-202ENST00000562793 157 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 AC135050.4-201ENST00000568708 504 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 LCMT1-AS1-204ENST00000569920 474 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 AC005771.1-201ENST00000585581 349 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 AC091135.1-201ENST00000585943 307 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 AC063977.7-201ENST00000594454 337 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 AL390838.2-201ENST00000602394 274 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 AC133552.5-201ENST00000604266 540 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 SNORA74.4-201ENST00000607595 199 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 AC080013.4-201ENST00000607624 649 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 Metazoa_SRP.199-201ENST00000615501 281 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 AC016769.4-201ENST00000616893 535 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 AL445670.1-201ENST00000618889 801 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 AC005840.5-201ENST00000619166 599 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 AL122023.1-201ENST00000622847 530 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 OR8K3-202ENST00000623845 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 OR11H2-202ENST00000641517 1085 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 NCOA1-206ENST00000407230 4745 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
TOP3AQ13472 SLAMF6-202ENST00000368057 2712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
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